世事并不是总按北条氏政的意愿来安排的，三船山合战之后一个多月的永禄十年（1567年11月29日）十月十九日，武田义信在东光寺去世了。
在经历了永禄八年（1565年）十一月七日的饭富虎昌谋反，永禄九年（1566年）十二月骏河姬（武田义信之妻）归国，永禄十年（1567年）八月十七日 今川氏真禁止向武田所领输出食盐再到武田义信的死，甲骏同盟一步步走到了尽头。而倾向于今川氏真一方的北条氏（北条氏跟随今川氏真也禁止向武田所领输出食 盐）这时要准备对付武田氏，没有馀力去对付里见氏了。因为三船山合战失败而立场弱化的北条氏政无力坚持自己的提案，北条氏的力量由东边转向了西边……
在里见氏这边，由于在三船山合战的兵员损失只有北条氏的五分之一，而且又获得了北条军遗留的大量辎重装备，里见氏可算获得了全胜；而于合战中亲手斩下北条 军将领羽屿内蔵首级的奇兵队长正木大膳亮时茂则在三船山合战中立下了头功，于是乎一直困扰时茂的流言终于消失了。至于当主里见义弘已在准备杀回久留里城 了……
西有武田、东有里见，在北方还有经常像暴风雨一样席卷关东平原的上杉辉虎，虽然目前的景况并不像天文十五年（1546年）河越夜战之前那么危险，但北条氏 此刻的处境却也绝对不容乐观。为了扭转不利的局面，已隐退的北条氏康又重新返回了前台，氏康显然认为缺乏历练的北条氏政不足以在这种情况下领导北条氏。
政治上没有永远的友谊，只有永远的利益；同样，只要利益足够，敌人也能摇身一变成为盟友。在权衡了利弊之后，北条氏康开始向关东管领上杉辉虎示好；因为单 纯以作战来看，北条氏的邻国里就只有上杉辉虎能够正面对抗精锐的武田军。虽然一贯满口的仁义道德，但上杉辉虎并不把说过的话作为自己行动的标准，如果能捞 到足够的好处，那么相越两国的和好就并非不可能实现；辉虎一方面向北条氏的使者（武藏钵形城主北条氏邦）狮子大开口——土地、人质和北条氏的低头服软，没 有什么是辉虎不要的。而北条氏唯一要求的援军却只是不断出现在口头上，此刻的上杉辉虎正忙于镇压本庄繁长的叛乱，对救援北条氏既无心更无力。
和上杉辉虎的交涉没能迅速得到期望中的结果，但北条氏也并非白费了一场力气；由于双方的谈判一直没有中断，而北条氏也利用谈判充分了解了上杉氏的虚实，并 以此判断出辉虎在一时半会之内不可能对北条氏发动大规模攻势。那么北条氏的力量也就不必像过去几年一样集中在北方了。
既然上杉辉虎一时间成了成事不足、败事不能的小角色，北条氏康迅速把自己的目光转移到了别处。西边的武田信玄欲壑难填，除非把骏河卖给信玄，不然恐怕很难 和武田氏达成妥协；北条氏康的女儿弥姬嫁给了今川氏真做正室，如果北条氏为与武田氏达成妥协而出卖今川氏，那弥姬的命运会怎样呢？就算置弥姬的命运于不 顾，但北条氏的立场又该如何？从一开始，北条氏就是甲相骏三国同盟最弱的一国（虽然现在国力已经超过了今川氏，但仍旧与武田氏有相当差距），如果任由武田 氏吞并骏河，则北条氏很可能沦为武田氏的附庸，北条氏在关东近百年的艰苦经营并不是为了得到这样一个结果。
甲、越两国看来已很难指望了，现在北条氏的邻国中能够让其利用的（同时是值得利用的）就只有东面的里见氏了。以北条、里见两家几近半个世纪的敌对来看，想 要迅速建立一个针对第三国的北条、里见军事同盟是很困难的。特别是在这个第三国对里见氏毫无威胁的情况下，这个组建北条、里见军事同盟的想法即使被人认为 是“幻想”和“荒诞离奇”也并不希奇。
然而北条氏康也自有其考虑。在里见义尧执政之前，里见氏一直是所领不超过十五万石的小大名；而经过里见义尧三十几年长期不懈的努力后，里见氏所领仍旧只能 在三十万石左右徘徊。那么如果北条氏肯做一些让步，把下总属于别人的领土让出一部分给里见氏，则里见氏或许会感到满足从而与站到北条氏一方；而里见氏就算 实力得到了加强，对北条氏的威胁基本上仍旧只达到下总国府台一线，就算发生了什么不测，里见氏对北条氏的威胁也超不过武藏江户一线。这和武田氏随时可以威 胁小田原的实力是不可同日而语的。
最荒唐的外交建议只要被对方采纳了就会被称为高明的外交手腕，所以只要觉得有必要，看起来再荒唐不过的建议也不妨提提看。在武田军攻破骏府城之后，急病乱 投医的北条氏康也这么表演了一次。永禄十二年（1569年）正月，通过妙本寺的僧侣，北条氏康要求建立房、相、骏三国同盟一起对付武田军的信件送到了里见 义尧手中；当月，眼见里见氏没有动静，北条氏康再次写信给里见义尧要求与里见氏结盟。然而荒唐并不是那么容易变成高明的，同年二月，利用北条军主力在萨埵 峠与武田军对峙，里见军同时对隶属于北条的下总千叶氏所领和三浦半岛的北条所领展开了攻击；里见义尧对北条氏那深深的不信任与反感根本不是两封信里的几句 甜言蜜语和些许的让步所能改变的。
由于东西两方都无法和睦，北条氏康不得不对北方的上杉作出了很大的让步来与上杉辉虎达成妥协。而里见氏则觉得自己被上杉辉虎出卖了，“这家夥究竟算是什么关东管领？”愤愤不平的里见氏迅速与上杉氏决裂，于是关东的政治格局彻底改变了。
永禄十一年（1569年1月3日）十二月六日，武田信玄发兵骏河；十二月十三日（1月10日），武田军攻破骏府城。从永禄十二年（1569年）一月二十五 日起，武田军与北条军在萨埵峠开始了长达三个月的对峙，四月武田军被迫撤离骏府城退回甲斐。而北条氏则为了与武田氏对抗于这年闰五月三日与上杉氏结成了同 盟（一说是年三月十四日）；而武田氏则在同年八月十九日与里见氏结成了同盟。
永禄十二年（1569年）九月，武田军进攻武藏；十月一日（11月19日）武田军包围小田原城，十月六日（11月24日），武田军在三増峠大破北条军。而 里见氏也借机在这一年完全恢复了自己在第二次国府台之战之后丧失的领土，而在第二年的元龟元年（1570年）五月，为了策应武田军对北条氏的攻击，里见军 甚至打到了伊豆。
发现与武田军交战得不偿失的北条氏开始反思自己的政策，在元龟二年（1571年）十月三日北条氏康去世后，北条氏政在十二月以氏康的遗言为理由恢复了与武 田氏的同盟，而北条氏的力量又开始由西转东了。随着甲相两国的和好，房甲同盟也就失去了存在的理由，里见氏又再次与上杉氏在天正元年（1573年）结成了 房越同盟。关东的形势在表面上好像又恢复到了永禄七年（1564年）第二次国府台之战之前样子。然而此刻这些所谓的同盟中，大概已经没有纤毫的信任存在 了，于是这种只为眼前利益结成的同盟自然而然的在很短的时间内就因为彼此的利益冲突而破裂。
又经过了两三年的对抗后，里见氏不情愿的承认了北条氏的关东霸主地位（极力反北条的里见义尧去世了），里见义弘开始向北条氏寻求和平。终至天正五年 （1577年），里见义弘为弟弟里见义赖迎娶了北条氏政的女儿鹤姫为正室（里见义赖似乎做了兄长义弘的养子，此刻也是以里见氏当主之子的身份来结亲的）， 两国结束了四十年的敌对关系结为了同盟。
如果没有里见氏在三船山合战的胜利，里见氏就没有立场与北条氏缔结这个相对平等的同盟；然而由这个同盟引发的正木宪时之乱和丰臣秀吉小田原城征讨后里见氏总州领土没收却是此刻始料未及的。但如果在这场三船山合战中失败了，战国大名里见氏的历史也许在永禄年间就结束了。
在北条氏一方，三船山合战的失利使得小田原北条氏的东关东征服战略始终停留在构想的阶段，于是北条氏最终也就以关东霸主的身份结束了自己的历史。如果北条氏在三船山合战中获得了胜利，日本的形势也许真的会改变吧？然而历史却是不容假设的……
和桶狭间之战之后一样，和当事方关系最密切的邻国受到战败的影响最大；只不过这次是武田氏与今川氏受到了北条氏战败的影响。自从武田信玄将自己对骏河的觊 觎明白表露出来之后，北条氏就对此做出了很强烈的反应。这使武田信玄认识到，如果武田军攻击骏河，则很有可能遭到北条氏的军事干涉；于是信玄在出兵骏河一 事上表现得很慎重，例如永禄十年（1567年）今川氏真下令对武田所领禁盐，这可以认为是处于弱势的今川氏对强势的武田氏做出的挑衅，但为此而领内民生大 受影响的武田信玄却没有迅速就此做出什么激烈的反应，这很可能就是因为武田信玄当时并没有轻易击败骏、相两国联军的把握，因而不愿轻启战端。
但当北条氏在三船山合战中被打得大败之后，形势骤然改变；北条氏可能对武田氏攻略骏河而进行的军事干涉在武田信玄看来变成了笑话。“如果一万里见军就可以 击败三万北条军，那北条军究竟有什么值得自己忧虑呢？”对于甲军的强悍和自己的军事才能，武田信玄是有着绝对自信的。没有必要靠外交努力来避免北条氏的军 事干涉了，武田军的强悍足以击败北条军，而这足以迫使北条氏停止其军事干涉；只不过这就需要赶快，因为时间越短，北条氏也就越缺少机会进行恢复、也越发没 有机会来弥补其军队在三船山合战所暴露出的缺陷。武田信玄开始倾向于用武力迅速解决北条氏的军事干涉（这时的信玄颇为急噪，因为他大概感觉到虽然自己要做 的事还有很多，然而所剩下的时间却可能已经很少了）。
然而结果证明武田信玄的判断是错误的，武田军在出兵后七天之内就轻易击败了今川军、夺取了骏府城。但当武田军在长达三个月的萨埵峠对峙失败后，信玄才真正 了解到由北条氏康统率的北条军和由北条氏政统率的北条军是截然不同的，只不过此刻的双方却都已骑虎难下了。又经过了四年的纠缠，甲相两国同盟才最终取代了 甲相骏三国同盟；然而此刻北条氏康已不在，武田信玄虽在而将老……
天正元年四月十二日（1573年5月23日），信浓驹场，当武田信玄走向自己生命终结的时候，信玄会否曾后悔为与北条氏兵戎相见而失去了宝贵的四年？此时 此刻信玄所需要的大概也就是一年的时间吧？如果当初能再在外交方面多做一些努力，甲相交战或许可以避免；即便不能避免双方的冲突，是否可以少纠缠一段时间 呢？只不过这一切一切都已经太晚了……
三船山合战的胜利对里见氏来说确实是悠关生死的战略性大转折，而北条氏的失败固然对北条的未来造成了深远的影响；但如果仅以当时而言，北条氏的失败只是一 次战术性的挫败而已。里见氏与北条氏争夺关东霸权的机会在第二次国府台合战失败之后就彻底丧失了，里见氏之后都只是为保护家族的存续与地位而与北条氏作战 而已；三船山合战中里见氏的胜利是一场典型的哀兵击败骄兵的战役。对两家疏于了解的武田信玄错估了三船山合战对北条氏的打击，同时也高估了里见氏的实力； 三船山合战的胜利并不能抵偿里见氏在第二次国府台合战失败而遭到的损失。如果在二次国府台合战之前里见氏做不到的事，那三船山合战之后里见氏一样做不到， 事实证明了里见氏的攻势并不足以牵制北条氏。在这个战乱的时代，妄图依靠对方的软弱或第三者的干涉来达到目的是很危险的，真正能够依靠的只有自己的实力； 然而在很多时候，很多人都在不经意中忘掉了这一事实，从而导致了一次又一次的遗憾……
发生在关东一隅的三船山合战作为战国时代关东内部势力的最后一场大战，极大的影响了里见、北条的未来，也很大的影响了其他东关东诸大名的命运。通过北条 氏，三船山合战的结果又影响了武田氏；又因武田氏而影响了织田氏与德川氏，从而影响了整个天下。虽然三船山合战也许只是影响这一切的一个小因素，但正是这 许许多多一环紧扣一环的小因素最终决定了未来……