之所以会发生这样的事情，主要和日本的天皇有关，因为在早期的时候，日本的天皇认为他们一定要保证他们血脉的纯正，因此在日本天皇眼中，他们皇室的血脉是不能够随便向外流传的，这就造成了在皇室内部他们会选择近亲结婚。因为日本皇室不愿意和平民结婚，因此就导致了他们在对自己配偶的选择的时候，范围是非常狭窄的，即使在偏远那也是他们的远方亲戚，也是有一定的血脉关系的。
我们以允恭天皇的儿子为例，当初允恭天皇的儿子就喜欢上他自己的亲妹妹。而在允恭天皇退位以后，允恭天皇的儿子最终继承了新的皇位。而在他继承皇位后，就把他的妹妹封为了自己的皇后。而日本近亲结婚的习俗也从这起事件以后开始流传起来。因为人们看到他与他的妹妹两个人，还有他的母亲依然朝夕相伴，生活在一起感到很幸福。这就感动了很多人，这才造成了众多人纷纷模仿。
但是其实从现在的日本法律来看，日本的现代法律对于近亲结婚是不被允许的。而对于那些亲兄妹之间结婚是更不被允许的，在日本的法律当中要求四代以外的非直系亲属才可以结婚。当然到了现代，随着科学层次的发展，人们已经认识到了近亲结婚所造成的危害，因此也开始杜绝这一现象。但是其实在早些时期，近亲结婚并不止是在日本有所出现，在很多国家都是存在着这一现象的。
像我国在古代也有近亲结婚的现象。但是在我国古代近亲结婚的现象并不严重，因为古代的时候儒家思想在中国的影响范围很大，因此在儒家思想的影响之下，人们也认识到近亲结婚是一件十分可耻而且不被道德所允许的事情，因此在我国古代选择近亲结婚的人可以说是少之又少。