File.641 消失
毛利小五郎常去的那家咖啡馆附近的公寓里，发生了证券工作人员被杀的事件，凶器是一把来复枪，上面沾有咖啡馆老板娘梓的哥哥的指纹。由于嫌疑犯、梓的哥哥不见了踪影，警察们只能潜伏在咖啡馆里。警察们还在嫌疑犯家附近的垃圾桶里，找到了被扔掉的血衣。在梓的带领下，警察们和毛利小五郎等人进入了梓的哥哥的房间内寻找线索。正巧遇上了快递员送来夏本杉人的包裹，里面竟然是一盒曲奇饼干。梓看到后，便借口外出去一下超市。小五郎和千叶警察继续讨论案情时，高木打来电话说，在超市这里让梓的哥哥逃脱了！ 听到这个消息的柯南他们，认定梓是通过曲奇饼干知道了碰头地点。但是，柯南却觉得这盒曲奇饼干不是梓的哥哥派人送来的，而是真正的凶手设下的一个陷阱……
FILE. 642 虚假的友情
原来，梓借口要买内衣而支开了高木，得以顺利溜走。
柯南暗示小五郎，指出血衣的腋下和肘部的血迹十分有规律。目暮警官推断出犯人其实是用枪柄来殴打受害人的。经过柯南的步步诱导，凶手终于浮出了水面。
夏本杉人的公司同事河濑，利用公款炒股票，结果不知不觉中输了1亿日元。他心想，与其一生都背负这笔债，不如……
柯南发现杉人寄给妹妹的包裹上，意外地扎着丝带。当众人赶到丝带上的地址时，看见河濑正准备向梓下毒手……