TV：新一：01 云霄飞车杀人事件
耳朵还很大的新一……整个故事的开端，被黑暗组织灌药之前的原始新一~~（这集也出现了当时还是路人甲乙丙丁的高木涉~步美元太光彦等人~~~）
049 外交官杀人事件(后篇)
喝了服部平次带来的白干酒，喝了之后变回新一了一次，本来想和兰多说几句话的，结果解决完案件就又变回去了
162 飞机空中密室！工藤新一的首次的办案
阿笠博士抽奖抽中了旅行券，小五郎、小兰和侦探团去了冲绳，在飞机上小兰梦见了以前和新一去洛杉矶的飞机上发生的杀人事件。那么这就是最初的一页……但是其实最早的推理应该是他小时候咿咿呀呀帮助妈妈找到爸爸的事件……
190 生死一瞬间（危险的复活） 第三种选择
柯南正在为是否告诉小兰自己的真相而烦恼时，当天夜晚，灰原出现在了柯南的病房并把枪口对准了柯南~啪~~打出来一朵红花……把新一吓了个半死~~于是坦白计划泡汤~~剧情得以继续下去~~同时小兰的学校正在准备文化节，柯南也去看了小兰主演的话剧。但是观众中的一个男子突然倒下死了。
191 生死一瞬间（危险的复活）黑衣骑士
在小兰主演的话剧的表演中，发生了杀人事件。目暮警官认为被杀害的蒲田的饮料中被他的同伴们下了毒，但是从现实情况来说准备断定是自杀。此时出现了意外的人物！
192 生死一瞬间（危险的复活） 新一回来了
借助哀利用白干提取的物质制成的暂时解药变回原来身体的新一回到原来的生活的时候，在糀町中心大厦的了望餐厅邀请兰吃晚餐。晚餐时听说在餐厅的电梯里发生了杀人事件的新一对兰说“马上回来”，奔向了案发现场。
193 生死一瞬间（危险的复活） 约定的场所
新一明白了在糀町中心大厦的电梯里杀害社长的犯人，但是身体开始发生变化，另一方面小兰在了望餐厅一个人等着新一的回来。结果破了案子，药效到了~~他差点哭出来……柯南看到兰跟前~“新一哥哥走了~”，兰开始哭~~“新一哥哥说~……”“我不听我不听……”~~“他说，希望你等他，就是死，他也会回来的……”
219 被召集的名侦探 工藤新一 VS 怪盗基德
打算拿取铃木财阀的黑珍珠BLACK STAR的怪盗基德，想起了以前关于钟台的一个事件。(这里有怪盗对新一,但后面的不是新一,以柯南的身份出现) 另一方面，小五郎的事务所里受到不明发信人的信函，而且里面装着支票。小五郎带着小兰、柯南一起到了“黄昏之馆”。“黄昏之馆”是大富翁乌丸莲耶的别墅，一同被招待的还有其他名侦探。而后开始了在馆中寻找财宝的游戏。但侦探在一个一个消失。最后留下来的侦探是？召集侦探们的犯人的真实身份是？
286 工藤新一NY事件(事件篇)
287 工藤新一NY事件(推理篇)
288 工藤新一NY事件(解决篇)
柯南解决了横滨中华街的事件，但小兰发起高烧病倒了。在意识恍惚中，小兰的脑海中浮现了带着黑帽子的男子赤井、新一、及美国女演员莎朗?温亚德的形象。小兰想起了以前是在纽约，自己和新一遇见莎朗.温亚德并遭遇到事件的时候见过赤井。那是2人前去见住在美国的新一父母时候的事情。新一的妈妈有希子开着“美洲豹”疾驰在纽约的街头。她拿到了在百老汇好评如潮的音乐剧《金苹果》的入场券，正赶往剧场前去观看。 (这也是毛里兰开始对新一有好感的开始，那个街头飞车的动作堪称经典)
400 心存疑惑的小兰（回忆）
近期小兰越加怀疑柯南就是新一。柯南放在那里的手机被小兰给看到，她想从手机的邮件确认自己的怀疑。小兰在开机画面中发现手机被锁定了。正想解除密码暗号的时候，外面有汽车喇叭的相声，小兰看到那车的号码是46-49（yoroshiku），想起半年前与新一约会的事情…
437 上户彩和新一 4年前的约定(回忆)
柯南、兰与打扫工藤家书库的园子，留意到一张根据优作的著作而拍成了电视剧的“女高中生侦探YUKI的事件簿”的照片。照片上有与新一、兰同样是16岁的上户彩。听兰说，这是4年前首次担任主角的彩来拜访优作时拍的照片。
之后，一名年轻女子来到了工藤家。那人正是上户彩，原来她有事来拜托新一……
472 少年工藤新一的冒险（前篇）(少年)
473 少年工藤新一的冒险（后篇）(少年)
柯南等人正在帝丹小学的图书室读书。此时，小林老师在书架的空隙中发现了什么。那是个破旧的皮革钱包，中间放有1张纸。柯南对这个钱包有种似曾相识的感觉…。10年前，小学一年级的新一和小兰为了查明学校有妖怪出没的流言的真伪，在满月之夜潜入小学的图书馆中。在那里，新一从谜样男子那里得到了这个皮革钱包，并接受了解读纸上记录下的暗号的挑战…
柯南在图书馆继续诉说着对那个钱包的回忆。10年前，接受谜一样的男子挑战的新一与小兰，阿笠博士一起破译了第1个和第2个暗号，第3个暗号“消除OKUHO的证据 用混浊的声音紧咬住孤独”。新一破解出暗号的前半部分后前往奥穗邮局。由于前2次都是将暗号隐藏在红色的东西上，所以新一直奔红色的邮筒而去，打算寻出端倪…
490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决（中学）
剧场：
第7场 迷宫的十字路口
第1场 引爆摩天楼
第12场 战栗的乐谱
TV：基德：
076 柯南vs怪盗基德（易容毛利兰/自身）
132 魔术爱好者杀人事件(事件篇）（土井塔克树）
133 魔术爱好者杀人事件(疑惑篇）（土井塔克树）
134 魔术爱好者杀人事件(解决篇）（土井塔克树/自身）
219 被召集的名侦探！工藤新一vs怪盗基德（易容毛利小五郎/自身）
356 怪盗基德的惊异空中步行（易容铃木次郎吉/自身）
395 奇异屋宇的大冒险（机关篇）（易容老婆婆）
396 奇异屋宇的大冒险（解决篇） （老婆婆/自身）
469 怪盗基德与四幅名画（前篇）(易容高木警官)
470 怪盗基德与四幅名画（后篇）（易容高木警官/自身）
472 工藤新一少年时的冒险（前篇）（黑羽盗一）
473 工藤新一少年时的冒险（后篇）（黑羽盗一,最后大约是7岁的快斗也出场了）
479 和服部平次一起的三天远影
515 怪盗基德瞬间移动（自身）
537 怪盗基德VS最强金库（前篇）（易容女仆濑户）
538 怪盗基德VS最强金库（后篇）（女仆濑户/自身）
剧场版
03世纪末的魔术师☆ 1999/04/14
日文名：世纪末の魔术师
英文名：The Last Wizard Of The Century
08银翼的魔术师☆ 2004/4/17
日文名：银翼の奇术师
英文名：The Magician of the Silver Sky
10 侦探们的镇魂歌☆ 2006/04/15
日文名：探侦たちの镇魂歌
英文名：The Private Eye's Requiem
OVA
OVA1 柯南vs基德vs阿剑 宝刀争夺大决战!!
OVA4 柯南与基德与水晶之母
OVA6 追踪消失的钻石!柯南?平次VS基德!
剧场特典
M8特典：银翼的时间之旅（自身）
M10特典：感恩10周年！！柯南奖颁奖典礼