柯南是知道安室透是黑衣组织的波本的。(在神秘列车案件后)
漫画818~824是神秘列车篇，讲的是红黑
双方之间的对决，波本的身份也在漫画823
最后揭晓。然后紧跟着神秘列车篇的825话，
柯南就提到自己知道安室透是波本。