下面都是真正的新一登场的（假扮的没算在内``）
001《云霄飞车杀人事件》
对应漫画：V1F1
播映时间：1996年01月08日
简介：工藤新一：一名高中生侦探，凭借过人的推理能力，帮助警方破获众多大案，所以也被称为日本警察的救世主。某天，新一和自己青梅竹马的同班同学毛利兰相约到游乐场游玩时，意外的在云霄飞车上遇到了杀人事件，在新一的推理下，很快协助警方破了这个案子。不过，这时有两个黑衣人的身影进入了新一的视线……
049 外交官杀人事件（后篇） V10F2-F6
162《飞机空中密室！工藤新一首次的办案》1小时特别篇
对应漫画：V21F4-F7
播映时间：1999年09月27日
简介：阿笠博士抽奖抽中了旅行券，于是小五郎、小兰和侦探团去了冲绳，在飞机上小兰梦见了以前和新一一起去洛杉矶时在飞机上发生的杀人事件。那么这就是新一最初的一页……
190《危命的复活 第三个选择》
对应漫画：
播映时间：2000年05月15日
简介：柯南正在为是否告诉小兰自己的真相而烦恼。当天夜晚，灰原出现在了柯南的病房并把枪口对准了柯南！同时小兰的学校正在准备文化节，柯南出院后也去看了小兰主演的话剧。但是观众中的一个男子突然倒下死了。死因是——氰酸钾！
191《危命的复活 黑衣骑士》
对应漫画：V25F9-V26F7
播映时间：2000年05月22日
简介：在小兰主演的话剧的表演中，发生了杀人事件。原来由新出医生扮演的黑衣骑士却换成了……目暮警官认为被杀害的蒲田的饮料中被他的同伴们下了毒，但是从现实情况来说准备断定是自杀。此时意外的人物出现了！
192《危命的复活 新一回来了》
对应漫画：V25F9-V26F7
播映时间：2000年05月29日
简介：新一的出现圆满解决了案件。变回原来的身体的新一回到原来的生活的时候，在米花中心大厦的了望餐厅邀请兰吃晚餐。晚餐时听说在餐厅的电梯里发生了杀人事件的新一对兰说“马上回来”，奔向了案发现场。
193《危命的复活 约定的场所》
对应漫画：V25F9-V26F7
播映时间：2000年06月05日
简介：新一明白了在米花中心大厦的电梯里杀害社长的犯人，但是身体开始发生变化，另一方面小兰在了望餐厅一个人等着新一的回来。结果回来的却是柯南，新一约小兰来这个餐厅有什么特殊的意义吗？
219《被召集的名侦探！工藤新一VS怪盗基德》2小时特别篇
对应漫画：V30F4-F8
播映时间：2001年01月08日
简介：打算盗取铃木财阀家的黑珍珠BLACK STAR的怪盗KID，想起了以前关于钟台的一个事件，那是工藤新一和怪盗KID的第一次交手。另一方面，小五郎的事务所里收到不明发信人的信函，而且里面装着支票。小五郎带着小兰、柯南一起到了“黄昏之馆”。“黄昏之馆”是大富翁乌丸莲耶的别墅，一同被招待的还有其他名侦探。而后开始了在馆中寻找财宝的游戏，但侦探们一个一个消失，最后留下来的侦探是谁？召集侦探们的犯人的真实身份是……
286《工藤新一NY事件（事件篇）》
对应漫画：V34F11-V35F4
播映时间：2002年07月15日
简介：高烧倒下的小兰在神志不清中想起了与新一一起去纽约的事情。
新一与小兰乘新一的母亲--有希子的爱车前往剧场的途中高速行驶，结果超速被警察逮着。而将有希子解救的是化装成纽约市拉地休警官的女演员沙朗·温亚德。
287《工藤新一NY事件（推理篇）》
对应漫画：V34F11-V35F4
播映时间：2002年07月22日
简介：新一的母亲有希子带着15岁的小兰与新一在沙朗·温亚德的介绍下来到百老汇的幕后参观。小兰救下差点被从天花板落下的铠甲击中的女演员罗斯，罗斯似乎怕有人要她的命而胆怯万分。
舞台剧开始后，以神话为题材的音乐剧达到高潮。舞台中央吊在空中扮演天使的男演员休斯胸部遭枪击身亡。
288《工藤新一NY事件（解决篇）》
对应漫画：V34F11-V35F4
播映时间：2002年07月29日
简介：摆在新一的母亲-有希子及15岁的小兰与新一眼前的是百老汇音乐剧的主演在舞台被杀事件。嫌疑人应该是同舞台演出的4名女演员之一。
新一在舞台装置中发现羽毛后向着事件的真相迈进。有希子听过新一的推理后，在舞台开始解迷秀，将犯人推向绝境。
剧场版第七弹《迷宫的十字路》
还有一些是假扮（总之不是真的）新一的``不过都算是出场了：
剧场版之第3弹:《世纪末的魔术师》(这部中,"新一"虽登场,但却是由KID假扮的)
OVA1:柯南 vs Kid vs Yaiba 宝刀争夺大作战(不是吃药变大,只是柯南在做梦)
第345话 直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘事件(这部中,"新一"虽登场,但却是由服部平次假扮的)