特别版是指剧场版与众不同，从12剧场版开始就有系统的制作。前期全是幕后和总结，没有故事。这些柯南吧的专题视频都在收藏中。
M01特别版-引爆摩天大楼的现场新闻(时间表じかけの摩天大楼健康资讯)
M05特别版-命运倒计时
M07特别版-迷宫的十字路口发布纪念
M07特别版-名侦探柯南的京都之旅，女子三人组的迷宫和十字路口之旅。
M08特别版-刀锋的时间之旅
M09特别版-横线上的柯南和小五郎
M10特别版-2006感恩节十周年柯南颁奖典礼
M10特别版-—柯南10年访谈
M11特别版-柯南推理教室深蓝的神秘考试
M12特别版——工藤新一球迷墙与黑色拉布拉多犬事件
M12特别版——李、小山山破解名侦探柯南颤栗配乐之谜
M13特别版-心怡和小兰麻将与七夕的回忆
M13特别版-—内藤大湖声优初次挑战
M14特别版-通往大阪什锦煎饼的艰难之路
M14特别版-喜欢柯南的艺术家大集合
M15特别版-潜入制作公司
M15特别版-新泻~东京礼物随想曲
如果你不想看普通的漫画，还有OVA和青山刚昌的短篇小说。
OVA是小学图书馆发布的专题文章，目前11。
1柯南VS基德VS铁剑和包道进行大决战！！2000
2 16嫌疑人！？2002
柯南，平治和消失的少年2003
柯南，基德和水晶之母2004
目标是小五郎！！少年侦探组2005(秘密)调查
6追踪丢失的钻石！柯南·平奇VS基德2006
7来自阿里的挑战书！阿里VS柯南&；少年侦缉队2007
8女高中生侦探铃木园子事件书2008
十年后的2009年9个陌生人
10海东黑场岛战役2010
11来自伦敦的绝密指令2011
青山刚昌的短篇小说指的是青山刚昌在画柯南之前画的卡通电视剧。很多都和柯南没有关系。值得一看的有《流浪的红蝴蝶》和《十颗流星在天空中飞》这两部和柯南有关，讲的是心怡父母的故事，还有1岁的小心怡~