神七的故事舞台设定在一个港口城市，故事围绕着原石神七展开，神七蕴含着特殊的力量。其中，能自制或克制权力爆发或使用的权力，就是“好石”；代表让能量跑掉的邪恶的怪物就是“邪恶之石”。(当满足“邪石”的条件时，也可能转化为“善石”)
有一天，一直独居的丹英雄阿尔玛面前，突然出现了一个叫蓝玉的女孩，她带领着管家和侍女。蓝玉希望借丹童子的神七“邪石”之力。但我因为自己神圣的七大“邪石”力量，害怕伤人的事件再次发生，自然就把他们赶走了。另一方面，在这个稳定的城市里，突然出现了一个强大的魔法东西“邪石”。为了保护别人，也为玻璃的真诚所感动，丹桐子同意成为玻璃的帮助者。原来匡离拥有圣七的“好石”力量，真的可以解放丹少年的圣七力量，让丹少年在不受“邪石”力量影响的情况下“逃跑”击退“邪石”。
本文的主人公丹桐子因为过去的暴力事件而变得孤僻，从而过着孤独的学术生活。玻璃的出现让他开始审视神圣七的力量。击退“邪石”，和蓝玉等人一起保护世界。
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