渔民艾米被人贩子带走，送去拍卖。路飞一行前去救援。艾米被天龙人高价买走，因为她是个渔夫。路飞飞到天龙人，然后招募黄猿将军。所幸被革命军卧底的七五海熊解救，大家被熊的拍拍能力送到各个岛屿。
路飞征服九蛇岛女帝后，得知艾斯被捕，即将被处决。在女帝身份的帮助下，她到达了推城监狱，试图救出艾斯，却被重重阻碍。最后，甚平、克罗克达尔、叶鬼和其他伙伴被集合起来，赶到海军本部去救艾斯。
之后顶上打了一仗。最后艾斯被杀，白胡子死了，黑胡子成了新的第四帝，路飞损失惨重。在甚平的帮助下，振作起来，把会议和时间从三天推迟到两年，并在岛上练习。
两年后，一群人再次抵达肥皂泡群岛打败冒牌草帽集团，潜入渔人岛，打败野心勃勃企图以猛药统治世界的新渔人海盗集团。
下一站，PH岛，遇见罗，气果。罗和路飞联合，绑架气果，和多弗拉门戈谈判。
随后在德累斯顿，他与多佛家族作战，集结竞技场高手，最终击败多佛，也引发了天下大乱。动画到这个位置。
漫画他们到了象岛，了解了很多真相。向济世被大妈抢走当女婿，一群人分头行动。路飞到达了伯母的主岛，其他人则赶往和平之国，准备与伪政权和凯多作战。