001 云霄飞车杀人事件
013 奇妙的寻人杀人事件
054 电玩公司杀人事件
128 黑衣组织十亿元抢劫事件
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件
176 与黑暗组织的再会（灰原篇）
177 与黑暗组织的再会（柯南篇）
178 与黑暗组织的再会（解决篇）
230 迷一样的乘客（前篇）
231 迷一样的乘客（后篇）
271 隐藏匆忙中的省略（前篇）
272 隐藏匆忙中的省略（后篇）
286 工藤新一纽约事件（事件篇）
287 工藤新一纽约事件（推理篇）
288 工藤新一纽约事件（解决篇）
307 没有声音的证词（前篇）
308 没有声音的证词（后篇）
309 与黑暗组织的接触（交涉篇）
310 与黑暗组织的接触（追迹篇）
311 与黑暗组织的接触（决死篇）
338 四台保时捷（前篇）
339 四台保时捷（后篇）
340 厕所隐藏的秘密（前篇）
341 厕所隐藏的秘密（后篇）
345 与黑暗组织的直面对决 满月之夜的二元推理
425 黑色的冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间
462 黑暗组织的影子 年幼的目击者
463 黑暗组织的影子 奇妙的照明
464 黑暗组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑暗组织的影子 珍珠的流星
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
509 红白黄色与侦探团
510 柯南VS双重暗号之谜
511 推理对决！新一VS冲矢昴
542 鱼儿消失的一角岩（前篇）
543 鱼儿消失的一角岩（后篇）
563 侦探团VS劫匪团 骚动
564 侦探团VS劫匪团 沉默
578 召唤危机的红色前兆
579 黑色13的暗示
580 逼近的黑之时限
581 摇曳的红色目标
622 紧急事态252（前篇）
623 紧急事态252（后篇）
剧场版05：通往天国的倒计时
剧场版13：漆黑的追踪者