是的，黑执事动漫和漫画版本有一些不同。这是因为动漫在播放时，漫画还在连载中，所以两者不可能完全同步。
在故事情节上，动漫版会原创一些剧情以吸引观众，而漫画版则会有更详细的故事描述。例如，在动漫第一季的地狱犬段落后，与漫画的剧情就开始有所不同了。后面的咖喱事件虽然漫画和动漫都有，但两者在处理上存在差异。关于天使的剧情完全是动漫原创，而在漫画中并没有出现这个角色。另外，在第二季中，新少爷和新执事这两个角色也只在动漫中出现，而没有在漫画中出场。
总的来说，虽然黑执事动漫和漫画版都讲述了同一个基本故事，但两者在细节和情节上存在一些差异。这可能是因为漫画和动漫的创作时间和观众群体不同，导致两者在表现形式和风格上有差异。