1，食用价值不同
香菜:香菜的嫩茎和鲜叶有一种特殊的香味，常作为菜肴的点缀和提味品。它是人们喜欢吃的好蔬菜之一。
水芹生长期长，秋、冬、春三季均可采收。可以凉拌食用，也可以和其他肉类菜肴一起炒，或者和海苔干、水芹肉丝、水芹羊肉饺子、花生一起煮。
2.不同的生长条件
香菜:香菜能耐受-1℃至2℃的低温，适宜生长温度为17℃至20℃。超过20℃时生长缓慢，30℃时停止生长。香菜对土壤要求不严格，但土壤结构好、保肥保水性能强、有机质含量高的土壤有利于香菜的生长。
香菜:
小芹菜:
小芹菜耐寒性强，幼苗能耐受-2℃的低温，成株能耐受-5℃的低温。种子萌发的适宜温度为15~20℃，营养生长期的适宜温度为15~20℃。？
3.不同的营养价值
香菜(芫荽)营养丰富，包括维生素C、胡萝卜素、维生素b1、b2等。同时，它还含有丰富的矿物质，如钙、铁、磷、镁等。其挥发油中含有甘露醇、正戊醛、非醛、芳樟醇，能开胃健脾。香菜还含有苹果酸钾等。
水芹含有丰富的维生素和无机盐，其中钙、磷、铁含量较高，具有清洁人体血液、降血压、降血脂的作用。
百度百科-香菜(香菜的学名)
百度百科-小芹菜