具体来说，差异如下:
首先，03版钢炼中的人造人中，爱德华和艾尔炼制的“母亲”和“儿子”在FA和漫画中并没有出现，而是剧组在创作时添加的。
其次，03版的但丁和人造人的弱点，在法里是找不到的，03版的死了，在法里却活了，艾尔得不到贤者之石(03版里有)，最后全死了，在法里却没有。《法》中的一些重要人物，如林、、、烧瓶人、蒲莱等。，都不在03版；
第三，03版最后几句，爱德华数次穿越时空，这是FA没有的。
最后，法是一个快乐的人。
结局，但03版不是。即使后来有剧场版，也还是远远落后于FA。03版的结局是艾尔恢复了健康，爱德华却在一战后去了德国，两兄弟在不同的世界。虽然后来的剧场版《香巴拉的征服者》补充了这个结局的不足，爱德华重返炼金术界，但也是昙花一现。与李文和上校重聚后，他被分开了。消灭征服者后，他再次回到德国，以爱德华自信的样子结束——他终有一天会真正回到炼金术界...
(香巴拉的征服者详细介绍:
/view/414277.htm？fr=ala0_1
)
相比于FA每个人都找到了自己的幸福，又怎么能看出哪个是完美的呢...