随着整个宇宙的负能量越来越大，很多怪物开始蠢蠢欲动。由宇宙卫队看守的宇宙监狱中的邪恶奥特曼·贝利亚在扎拉布星人的帮助下成功越狱。后来，贝利亚杀死了扎拉布星人，抢走了扎拉布星人的吉比特格斗器械。贝利亚为了复仇回到了光明之地，手持千兆格斗仪，开始暴戾邪恶。
贝利亚手持千兆战斗仪，在击败宇宙卫队队长佐菲后进入等离子放电塔，带走了光之国人造太阳的能量核心。在这个关键时刻，机动奥特曼。太郎挺身而出，用身体保护着光明之国的最后一丝光明。然而，失去了能量核心的光之国度开始进入冰封期...
为了让光明之国重获光明，蒙比乌斯·奥特曼听从赛文·奥特曼和奥特曼的指引，前往寻找与贝利亚拥有相同基因的雷欧尼克斯战士——雷。梦想碧昂斯奥特曼化身人体——日比野的未来。雷从未来听说了光明之国的历史和贝利亚的企图，决定前往光明之国帮助未来推翻邪恶的贝利亚。当雷来到光明之国时，他看到的是极其寒冷的冰冻世界。许多奥托士兵被冻在冰里。
与此同时，贝利亚利用等离子火花的力量从怪物墓地中唤醒了大量的怪物，并集结了一支怪物军队。
雷和未来与奥特曼和赛文·奥特曼相遇，他们暂时只能出现在早田和星团的人类形象中。
贝利亚需要能量。
在去等离子放电塔的路上，他们被贝利亚派来的宇宙人和怪物挡住了去路。经过激烈的战斗，四人终于到达了等离子放电塔。奥特曼、赛文奥特曼、蒙比斯奥特曼用的是机动奥特曼。太郎放弃了保护自己生命的希望，又回到了奥特曼的形态，和雷一起去了怪物墓地。
正义之战开始了！因为贝利亚的唆使，雷在战斗中一度失控。关键时刻，宇宙飞船盘龙到了！在伙伴们的努力下，雷终于醒了。另一方面，赛文·奥特曼为了保护雷和雷的朋友而身受重伤...此时，西罗奥特曼正在遥远的K76星球上刻苦训练。在一种模糊的意识中，赛文·奥特曼投掷了他自己的飞镖，向他的儿子西罗传达了光明之国正面临重大危机的信息。西罗奥特曼冲到怪物墓地，打败了恶毒的贝利亚。然而，战斗还没有结束！最可怕的敌人出现在怪物墓地。
《银河之外宇宙英雄传说》的故事主要讲述了奥特曼家族的一员“贝利亚·奥特曼”被雷·布兰德奥附身，成为数万年前奥特曼的列奥尼克斯。在光明之国掀起叛乱，最后被奥托之王关进宇宙监狱。谁知在扎巴纳闽人的帮助下，心地邪恶的贝利亚越狱，攻打光明之国。贝利亚获得了可以控制100个强大怪物的道具——千兆格斗仪，他的父亲，还有很多奥特曼战士都被他打败了。在银河系最大的危机面前，幸存的梦想碧昂斯·奥特曼和地球的利奥尼克斯·雷，以及新战士——西罗·奥特曼(赛文之子)与贝利亚展开了战斗。最终贝利亚没有死，后续作品中也会出现。