电影和漫画里面剧情不一样。
漫画里面，金刚狼被一种液态合金导致窒息而死。大致剧情就是有个邪恶的博士要用基因制造一大批X武器，狼叔去阻止。但此时金刚狼的自愈能力已经被破坏了，所以他开始变老变弱，而且受伤已经足以对他构成威胁。最终，狼叔救了其他人，杀了博士，自己却被液体合金缠裹窒息而死，跪在哪里，可以隐约看清他问心无愧的低着头，金钢爪依然伸出。漫画里最后一幕如下：
电影里面则是另外一种结局，但最终还是死了。
有人创立一个机构，要用基因制造一批杀人机器，这个机构表面上是医院，但是实际上是做人体试验用的。里面诸多试验品中有一个，是用金刚狼的基因制造的，也就是狼叔的“女儿”。这也是导演一种“嫁接手段”，把影迷对狼叔的感情嫁接一部分到孩子身上，然后写剧本让金刚狼死掉，这种结局相对而言能让狼迷们好接受点。
狼叔的这个“女儿”很不一般，冷静，冷酷，凶猛，干练，小小年纪，却拥有一副冰冷凝实的气质，她的两手各有两只金钢爪，而且，双脚上也各有一个爪刃。这一点比狼叔还有牛啊有木有！
电影里，狼叔的身体出了状况，自愈能力严重变慢，受伤、衰老都已经可以威胁他的身体。这个和漫画里一样的。
电影里有一个非常独特的死侍，他独特的地方是——他就是狼叔！一个被复制、但改造了意识的狼叔，一个年轻版的狼叔。这个狼叔表情抑郁凝重，看起来是个善良而抑郁的英雄汉一样。但是，他对社会没有太多认知，一是因为他刚被创造，对社会没有认知，甚至不会说话，二是因为，他制造的时候被人为改造了思想意识，从他被制造的时候，就被设定只会终于邪恶的博士。
这个死侍（年轻版狼叔）被投入战斗之后的第一件事，就让人非常痛心——他毫不犹豫杀了和狼叔相依为命的光头博士查尔斯。当时，光头博士查尔斯已经间歇性痴呆了，狼叔隐姓埋名找了份司机的工作，用微薄的收入养活自己和查尔斯。
他们当时所处的，是狼叔萍水相逢的一个农场主家，农场主全家都很善良。当时有人欺压农场主，关了农场的水闸，农场主要去打开水闸。狼叔担心农场主一个人搞不定就陪同去了。然后，复刻版的“狼叔”来到农场主家，走进查尔斯的房间。光头博士查尔斯当时背对着房门，他感知到“狼叔”进来了，还充满回忆的和“狼叔”说话，说话的内容很动人，都是回忆一些美好的时光，这一幕很让观众感动。然而，从黑暗中出来的那张脸让观众有点疑惑，因为这个“狼叔”的脸更年轻，而且发型是圆寸短发，这一刹那，我个人还以为狼叔有什么机遇恢复了自我修复能力。然而，这个狼叔伸手扶正了侧身的查尔斯，从容的把拳头贴在查尔斯胸脯上，缓缓伸出钢爪，三根明晃晃的钛合金钢爪毫无声息就插进了查尔斯的胸膛……查尔斯一脸惊呆，我也是一脸惊呆……为什么！为什么“狼叔”变年轻后会杀掉可怜而伟大却已经老年痴呆的查尔斯！但随后，真正的狼叔就回到了农场，我才明白，那个年轻版的狼叔并不是狼叔，而是被复刻出来的。
这个复刻版“狼叔”的主要任务就是抓回狼叔的“女儿”，他很快就得手了，还杀了无辜的农场主全家，在这个就让观众再次痛心的时候，狼叔回来了。他在楼梯拐角看见复制版的自己，狼叔直接惊呆了！两个“狼叔”近在咫尺，相互凝视。“年轻狼叔”眼里只有侵略性，这种侵略性并没有邪恶，而仅仅是来自他对自己“主人”——邪恶博士的忠诚。狼叔目瞪口呆的看着眼前的“自己”，眼中满是惊呆和诧异，但他来不及多想赶紧上楼去看光头博士查尔斯。然而，事实就和他的预感一样不好。
狼叔抱起奄奄一息的查尔斯奔下楼冲向皮卡汽车，但查尔斯很快就永远的闭上了眼睛。狼叔搂着查尔斯的尸体痛不欲生，发出一声冲天咆哮，发狂的冲向那个复刻版的自己开始血腥的相互厮杀。狼叔虽然老了，但把毕竟是我们的狼叔！在接下来短短的片刻间，复刻版“狼叔”受到的伤害足以让常人死几十次。但此刻的狼叔，修复能力出了问题，年老体弱，已经不是“年轻版自己”对手，在对“复刻版”造成大量伤害之后险些被反杀。这时候，只剩最后一口气的农场主用车撞了复制品，狼叔得以活命。
这个复制品被狼叔撕得稀巴烂，又被卡车撞得很惨，心理很是愤怒，没能最终杀掉狼叔更是非常不甘，在被注射了修复药水之后很快得以恢复，继续投入追杀正面角色的路途。
最终，狼叔带“女儿”和“女儿”的试验品小朋友们去安全地点，但是邪恶博士和他的手下们一直在追他们。
大幅度失去修复能力的狼叔，身体比常人好不了多少。而他面对的是一大群装备精良的现代化物武装人员。狼叔身中数枪，浑身都是窟窿，就在狼叔都站不起来的时候，他再次遭遇了那个独特的死侍——“年轻版狼叔”。
对头见面，分外眼红。
心怀仇恨的复刻版狼叔瞬间情绪失控冲向我们的狼叔。狼叔身负重伤，浑身都是弹孔，又再次遭遇年轻版的自己，且是一个愤怒的、意识被改造过的杀人机器，战斗场面相当血腥。因此，在中国上映的电影版本，被删减不少镜头。狼叔被对方的利爪重创，最后被对方狠狠穿透右胸挑在爪上拖行，拖到一个枯死的大树旁边。而此刻强大的武装暴徒还抓住了这群小孩子，包括狼叔女儿也身处危险，狼叔很不甘，想要站起来拯救孩子们，拯救自己的女儿，但是连他自己的身体都正在遭受凌虐，狼叔不甘心、也放不下孩子们尤其是自己的“女儿”。但命运就是这样，总有人在自己受到屈辱、痛苦和死亡威胁的时候，还要眼睁睁看着最在乎的人身处险境，然后在悲痛面对这一系列悲惨虐心的局面后，不甘的死掉。
狼叔被用爪子叉住拖到枯树旁，再被狠狠的举起来、狠狠的摔向粗壮的树根，身体被穿插在粗糙树根上，手臂粗的树根带着碎肉从金刚狼的心窝伸出。而复制品并没收手，因为他单纯的脑海中只有对狼叔的仇恨和愤怒，早已失控，歇斯底里的继续的用爪子捅着金刚狼的胸部，噌！噌！噌！噌！噌！……而狼叔，却顾不上疼，只能眼巴巴的看着女儿被武装分子挟持，满眼的不敢，满眼的心痛……
放映大厅不少观众不禁流泪。这时候，金刚狼的女儿暴走了，做出了顽强的反击，并成功捡起来一把左轮，把事先从狼叔那里得到的埃德曼金属子弹装进去，爆头杀了复制品。然后奔过去与狼叔泪别，并叫了一声“Dad”。
电影就这样结束了。
可能狼叔是整个系列英雄角色中死的最惨的。