首先，两部电影的开头都是主角皮特·帕克在高中时期的选择，年龄和时间大致相同。其次是家庭背景，马奎尔的版本主要切入了本叔和梅婶之间的界限，为一个早年因父母双亡而和叔叔婶婶一起寄养的年轻人做铺垫。而加菲猫版则更倾向于皮特父母的路线。虽然大伯家寄养的背景没变，但叙事更侧重于他父母去世的真相。《蜘蛛侠》在内容上侧重于能力和责任，而《神奇蜘蛛侠》则相反，倾向于探索真相。
二、能力比较
在人物能力的设定上，两者基本一致，只是在细节上有一些变化。马奎尔版的蜘蛛侠，它所有的能力都来源于一只超级蜘蛛的撕咬，以及由此产生的基因重组。惊人的蜘蛛侠能力也是用同样的方法获得的，但最终阵型中的蜘蛛侠能力并不完全是因为变异。他的蜘蛛丝的喷吐被还原为漫威漫画原著中的科学表，通过科技设备喷洒高强度合成蜘蛛丝。如果比较人物的还原度，其实《惊奇蜘蛛侠》系列更适合漫威漫画的原著。
第三，性格不同
除了上面提到的电影设定调整，两个版本的蜘蛛侠在性格上也有很大的不同。即使在马奎斯版的蜘蛛侠拥有超能力后，他实际上仍保留着对诺诺被动的书生气态度，面对这种情况，他总是有条不紊，令人满意。而《了不起的蜘蛛侠》则更注重自我性格的展现和个人理想的追求，对蜘蛛侠的展现多于人物本身。在人物塑造上，英雄色彩更为强烈。
最后不得不提的是故事线中马奎尔蜘蛛侠和神奇蜘蛛侠的选择。马奎尔选择了？绿魔？、?章鱼博士？、?毒液？三个故事线，神奇蜘蛛侠是？蜥蜴博士和？电光侠，完全两个不同的故事方向。