001过山车谋杀案(杜松子酒，伏特加，工藤新一少喝药。幕布打开)
002绑架董事长女儿(阿笠博士知道身份)
043江户川柯南诱拐(父母知道变小了)
048~049谋杀外交官(服部平次出道，第一部复原)
054电子游戏公司谋杀案(龙舌兰酒出现并被杀)
057~058福尔摩斯迷谋杀案(平治知道他的身份)
128 10亿被黑暗集团抢劫(宫野明美死亡，黑暗集团浮出水面)
129来自黑暗组织的女子大学教授谋杀案(海原艾出现)
176告别黑暗组织(灰色原创)(派斯克出场)
177告别黑暗组织(柯南)
178与黑暗组织告别(解)(皮耶斯克被杜松子酒沉默，贝尔摩出现)
226格斗游戏的陷阱(上)(朱迪出现)
227格斗游戏的陷阱(下)
230神秘兮兮的乘客(上)(赤井秀一出现了，情况很复杂)
231神秘乘客(下)
242元简直是灾难(提到琴酒是左撇子)
258个来自芝加哥的男人(第一部分)(詹姆斯出现)
259个来自芝加哥的男人(下)
269犯罪遗迹(上)(毛利小五郎档案被盗，目标是柯南)
270犯罪的遗迹(第二集)
271的仓促隐瞒的疏忽(上)(灰平原疑似，情况危急)
272匆忙掩盖疏忽(第二集)
277英语老师VS西方著名侦探(上)
278英语老师VS西方著名侦探(下)
279迷宫的黑暗(上)
迷宫的黑暗(第二部分)(克里斯被发现是已故美国明星莎伦·宾亚德的女儿。)
286工藤新一纽约事件(事件)
287工藤新一纽约事件(推理)
288工藤新一纽约事件(解)(贝尔摩以凶手身份出现，布兰奇跟踪)
307无声的证据(上)(再次抓住黑暗组织的尾巴)
308无声的证据(下)(下集介绍)
309与黑暗组织的联系(谈判)
310接触黑暗组织(后续)
311接触黑暗组织(致命章节)(柯南得知该组织正在雇佣电脑工程师编写一个神秘的系统软件)
金钱买不到的友谊(第一集)
金钱买不到的友谊(下)(在这一集里，我提到了阿沙拉的父亲:宫野厚司。这是阿笠博士的一个老熟人。)
东京电影制片厂的秘密(第一部)(Ashhara被跟踪，意想不到的事情来了)
336东京工作室的秘密(下)
338四保时捷(第一部分)
339四保时捷(第二部分)
340藏在厕所里的秘密(第一部分)
341藏在厕所里的秘密(下)
343便利店的陷阱(第一部分)
344便利店的陷阱(下)(小兰在朱迪老师公寓的墙后面找到了照片)
与黑组织面对面！月圆之夜的双星神秘事件(朱迪、赤井、詹姆斯身份曝光。卡尔瓦多斯省出场，被阿凯打断后自杀，第一次交锋告一段落)
346寻找P股上的印记(上)
347寻找P股上的印记(下)
361迪丹高中的闹鬼学校(第一部)
362迪丹高中闹鬼学校(下)(真新博士回归)
斯特拉迪瓦里小提琴的不协和音(前奏曲)
386斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐(间奏)
387斯特拉迪瓦里小提琴的不协和音(尾音)(老板手机号找到了，奋斗的新潮流)
425被组织魔爪触碰的瞬间(水无怜奈、基安蒂酒、科恩出现，硝烟再起)
429回不去以前的两个人(第一部)(影游出现在这个大厅里)
430回不去从前的两个人(下)
462黑暗组织的影子，一个年轻的见证者(本堂的应友行为怪异，引起了柯南的注意)
黑暗组织的阴影，奇妙的照明
464黑暗组织神秘阴影重赏。
黑暗组织的阴影，珍珠的流星
484黑人照片的下落(第一部分)
485黑人照片的下落(第二部分)
491红黑的碰撞开始了(最精彩的系列，一定要看)。
492红与黑的碰撞血缘关系
493红与黑的碰撞绝对称得上。
494红色和黑色的碰撞
495红色和黑色之间的碰撞昏睡
496红黑碰撞入侵
497红与黑的碰撞觉醒
498红色和黑色的碰撞令人不安。
499红黑碰撞迷彩
500红与黑碰撞的遗言
501红黑之间疑似碰撞
502红色和黑色的碰撞是白色的
503红色和黑色的冲突
504红黑相撞而死(第二场决斗，赤井秀一疑似牺牲，水无怜奈身份疑似)。
509红白黄侦探组(水无怜奈发信息，组织开除一个代号波旁的侦探。冲矢昴出现了，新一轮的对抗即将开始)
510柯南VS W暗号之谜
511推理对抗！新沂VS冲矢昴
542让鱼消失的墙角石(上)
543使鱼消失的墙角石(下)(冲矢昴的话几乎触及灰色的平原)
值得一提的是，005与漫画版中的电视版不同。漫画版的两个人是杜松子酒和伏特加。柯南无意中听到了他们的对话，得知了他们的代号。不过电视版换成了两个长相差不多的人。后来柯南不知怎么知道了动画版054里杜松子酒和伏特加的代号。这成为柯南电视故事的漏洞，却无法弥补。而且在漫画《奇异凶杀》中，宫野明美与杜松子酒和伏特加联系在一起，然后被杀，动画版改成了被警察逮捕。这一集和动画版128集很像。可以说第128集是一个补丁，但是这个补丁有一些疏漏:在第13集，小兰和毛利大叔明明知道宫野明美(也就是广田亚米)，但是在第128集，就变成了只有柯南知道广田亚米，而小五郎。
在《天堂倒计时》第五剧场版中，黑衣组织再次出现。他们杀死了背叛组织的电脑工程师原佳明，破坏了长盘集团的电脑(防止组织的信息泄露出去)，并想尽办法杀死雪莉，但都失败了。
《黑暗追踪者》第十三剧场版中，一个黑人组织的间谍卷入了一起谋杀案，被杀。他有一张记忆卡，上面有所有黑色组织间谍的名单。于是，黑组织成员爱尔兰扮成松本调查命案，意图追回内存卡。贝尔摩把这件事告诉柯南后，柯南也决定拿到存储卡。最后爱尔兰成功拿到了存储卡。当他向金出示存储卡时，金命令基安蒂酒向他开枪并打破存储卡(放大的图片显示)。至于爱尔兰的身份，剧场版13没说。
剧场版中并没有明确说间谍的身份，但还是被眼尖的市民M13_ Nock查了出来。
在第一张图中，我们看到存储卡被从护身符中取出。从第三张图可以看出，护身符的主人是冈仓正明！根据高木警官的推理和麻将上的符号，我们可以在第二张图中看到，右脚微笑的人是黑组织的间谍。(可惜柯南大概不知道第二张图和第三张图的线索，所以没有去追间谍。)
2.内容介绍
注:按时间顺序，不是剧集顺序。
莎伦和工藤有希子，作为女明星，从魔术师黑羽盗一(海东黑叶的父亲，第一个小偷)那里学到了变脸的技巧，他们互相认识了。
莎伦的真实身份是黑人组织的杀手，她杀死了一直在调查该组织的美国联邦调查局特工，也就是朱迪的父亲，并放火焚烧了朱迪的家，毁尸灭迹。只有年幼的朱迪幸免于死，被父亲的同事用“证人保护计划”保护起来。
莎伦告诉小朱迪，“秘密使女人成为女人”(秘密使人变得有女人味)给她留下了深刻的印象。
*心怡和兰去纽约玩，招待她们看白龙会的歌剧《金苹果》。他们在剧院门口相遇并认识了沙龙，但沙龙在歌剧开始前借口有事离开了。歌剧中有一场谋杀。新一帮忙破案后，广子留下声明，让他们先打车回酒店。途中，两人下车找到莎朗送给兰的手帕。兰先是遇到了追赶银发杀手的，又在废弃的仓库里遇到了受伤在逃的银发杀手。满头银发的凶手在试图杀死他们时，因栏杆断裂而从高处坠落，被何蓝心怡所救。事后发现银发凶手已自杀，但现场所有痕迹均被抹去，令人怀疑。(286工藤新一纽约事件银发凶手为贝尔摩假扮毛利兰一见赤井秀一)
*莎伦伪造了自己的死亡，继续以女儿克里斯的身份生活，在组织中的代号是“苦艾酒”。
*龙舌兰找到板仓卓，命令他开发一个系统软件。这遭到了板仓卓的拒绝。黑人组织拼命骚扰板仓卓，最终迫使他屈服。
*新一被黑团攻击，被琴酒逼成柯南。
*柯南在《新干线爆炸》漫画版中学到了杜松子酒和伏特加的代号。
*在漫画版中，宫野明美被杜松子酒杀死，但在动画版中，他被警察逮捕了。
*电子游戏公司谋杀案柯南遇到了黑暗组织成员龙舌兰，但他被杀了。
*黑暗组织抢了6543.8+00亿，丧姐宫野明美被杀。
*一名来自黑暗组织的女子大学教授逃离了该组织，并住在阿笠博士的家中。
*黑暗中的死角谋杀，新出智明的父亲被继母杀害，在柯南的帮助下破案。
*告别黑暗组织被组织成员皮斯克绑架，在柯南的帮助下逃脱。皮斯克因为暴露身份被琴声灭口(贝尔莫尔当时也在现场，后来失踪定居日本。因为她觉得当时有其他组织的成员在场，柯南开始怀疑事后她也是该组织的成员。
贝尔摩制造了一场车祸，企图杀死新出智明一家，并开始冒充新出智明。另一方面，长大后的朱迪加入了美国联邦调查局，追踪贝尔摩来到了日本。察觉到贝尔摩的企图后，她秘密地救了新出智明，并作为一名英语老师隐藏在迪丹高中进行监视。
*暴命复活，柯南变回新骑士一身黑衣，遇到了化身为新贝尔摩，被朱迪老师找到的兰。
格斗游戏的陷阱朱迪遇到了柯南，看到他在园方的帮助下破案(这是朱迪第一次正式亮相，显然她发现柯南不简单，可能已经知道内情了。)。
*神秘乘客本集开头Gin和Belmore之间的一场戏，说明这一集和主线有关。年轻的侦探队和医生在公共汽车上遇到了一起去美术馆的朱迪和辛楚。这时，艾感觉到大巴车上的组织成员变得非常害怕。后来，大巴被劫匪劫持。虽然在大家的努力下最终抓住了劫匪，但是艾呆在快要爆炸的车里想死，最终被柯南救了出来。(现在看来，组织成员艾觉得是贝尔摩，和她单独在一起的朱迪应该在监视它的行踪。好在在柯南的掩护下，不管是朱迪还是贝尔。同时，这一集也是赤井秀一的首次正式亮相。最后，他的报告显示了他在监视谁(现在看来，应该是帮助朱迪监视贝尔摩)。
柯南等人结识了来自芝加哥的“詹姆斯·布莱克”老人。后来因为被误认为名人而被绑架，在柯南的帮助下获救，被赤井接走。
*佐藤警官去和白鸟相亲，最后在柯南的帮助下成功阻止了高木。(这一集唯一值得注意的是，柯南用新的冒充高木，但新的(贝尔摩)帮他撒谎，说明贝尔摩此时已经知道了柯南=新一的秘密。原因可能是作为Hiko的好朋友，她大概是小时候看到了新的照片，所以才发现了这个秘密。当然了。另外从这一集开始，新出场次数开始频繁，暗示他是和主线有关的人)。
*犯罪的纪念品事件(案件本身无关紧要，但与主线有关，即与毛利小五郎有关的案卷被盗，然后被送回，暗示有人在调查他们，这让柯南相当紧张。是贝尔摩偷了案卷，主要目的是了解与新制作有关的案件(可惜细节还是缺失)。窃取所有相关案件档案的目的是误导美国联邦调查局。故事结尾有一张赤井监视毛利侦探所的图片，说明美国联邦调查局真的把目光转向了毛利人，我们被青山进一步误导了)。
*方三角事件，柯南再次在朱迪面前破案(案件本身还是无关紧要的，这一集有几点值得注意:第一，朱迪暗示柯南的身份已经暴露，提到了美国联邦调查局。第二，在该案中，兰回忆说他曾见过一个“戴黑色针织帽的人”(即)；最后，在故事的结尾，贝尔摩发来了杜松子酒的邮件，提到了雪利酒，并把飞镖送到了(也就是艾)的十字照片上，旁边还有柯南和兰的照片。个人认为，此时贝尔摩正式接到组织的命令，要杀死艾。
*西方某著名侦探vs英语老师，案卷的丢失让柯南非常不安。他基本肯定了克里斯是该组织成员，并进一步怀疑朱迪就是克里斯。碰巧来到这里的服部哲对此很感兴趣，于是鼓动柯南去朱迪的公寓进行测试，双方接触过程中发生了一起凶杀案。虽然案子破了，但是对朱迪的考验却失败了。(这一集的重点是柯南和兰最后出现在朱迪浴室镜子后面的照片，照片上的字迹和贝尔摩的一模一样。根据后来的陈述，这是朱迪潜入新发布的房间(即贝尔莫尔)发现相关照片后复制的。同时朱迪也了解到贝尔摩的目标是服丧，但当时这些照片的出现显然给了我们很多朱迪=贝尔摩。另外，柯南最后说，除了朱迪，另外两个可疑人物应该是赤井和新一)。
*中华街的雨中似曾相识。蓝回忆了“戴黑针织帽的人”，并通过蓝发烧病倒时的回忆，讲述了金苹果事件(详见上文)。
*无声的证据。小五郎受托寻找失踪的电脑工程师板仓卓。从当事人的谈话中，柯南得知他是龙舌兰酒的联系对象，是在电子游戏公司遇害的组织成员。最后，柯南通过追查案件，得到了该组织的线索——板仓日记(在案件的最后，柯南和蓝遇到了，并提到了)。此外，柯南还了解到，兰和赤井是在那一年认识的。
柯南通过半仓的日记得知了黑暗组织的行踪，试图冒充半仓和伏特加酒的接头人，但被琴酒看到了，失败了(虽然是和黑暗组织的较量，但和主线剧情关系不大(感觉琴酒和伏特加酒被排除在主线剧情之外)，唯一的影响就是柯南和艾最后离开了，被阿凯“刚好”看到，好像艾对其有所感觉。另外，板仓的日记中提到，黑暗组织的庞大计划甚至影响着人类的未来。看来我们的柯南离“拯救世界”的刻板印象不远了。
金钱买不到的友谊(剧情本身与主线无关，但开头阿笠博士提到艾的父亲宫野厚司是著名的疯狂科学家，母亲伊琳娜是英国留学生，黑暗集团可能在搞一个起死回生的计划)。
*黑暗中的陷阱。少年侦探队遇到命案，柯南帮忙解决。值得注意的是，柯南和艾在整个故事中都感觉到自己被跟踪，但跟踪者最终被迫放弃。(最后，赤井秀一的出现表明跟踪他们的人是美国联邦调查局。因为艾与照片中的人物相似，美国联邦调查局猜测她就是贝尔摩的目标。此外，赤井最后对艾的照片说“太像了”，暗示他和艾以前就认识。奇怪的是，朱迪和阿凯似乎并不经常联系，也不经常交换信息。
*四辆保时捷Ai感冒发烧。医生和柯南把他送到了医院，但是他被一个谋杀案堵在了停车场。后来，他遇到了兰，花园和朱迪在购物，和，谁发现了他们的行踪，跟着他。最后柯南破案了，医生却借了朱迪的车送艾回家，找了新医生给艾看病。在故事的最后，贝尔摩烧掉了艾的照片，说:“你准备好了吗？我找到了，我去找你”(这是一次彻底的暴露，贝尔摩和美国联邦调查局都知道她的地址，贝尔摩还在医生家里安装了窃听器)。
*医生带着柯南和艾去拜访艾爸爸生前的朋友，设计师出岛试图多了解艾爸爸。当然，设计院必然还会有另一桩命案。柯南破案的时候，还找到了艾的姐姐设法藏在设计院，艾的妈妈留给艾的那盘磁带。(艾的妈妈应该在19岁留给艾的录音里提到过一些惊人的事情，但是因为青山爱当悬疑的爱好，我们至今一无所知。此外，在故事的最后，贝尔莫尔叫来了组织成员“卡尔·多瓦斯”(即苹果酒)帮忙，正在策划一场行动。
PS:这个卡尔多瓦斯是队里最差的成员。他连脸都没露，一句话也没说就挂了。
朱迪辞去了迪丹高中的老师(显然，她会为此做些什么)，但当兰和花园去朱迪家参加聚会时，兰意外地发现了镜子后面的照片。
*贝尔摩策划了幽灵船活动，邀请了小五郎、新一、金，试图分散柯南的注意力，暗杀艾；朱迪得知了这个计划，先带走了艾，并试图将贝尔摩引入陷阱，但贝尔摩已经知道了这个陷阱，并为此做了安排。另一方面，柯南邀请服部哲装扮成自己，并在母亲广子的帮助下化妆成服丧，试图与黑人组织取得联系。但艾不放心柯南去，偷了柯南的追踪眼镜跟着他。最后，兰躲在朱迪汽车的后备箱里，因为她想知道朱迪的真实身份。。。。真的很复杂，期间各方势力相互冲突，各种秘密相继被揭露，局势几经变化，具体情况这里就不细说了。最终，贝尔摩逃脱了阿凯，再次放过了柯南，并把柯南和艾藏在琴酒里，但朱蒂还是设法骗过了依然一无所知的兰。柯南知道黑暗组织老大的邮箱，也就是“七子”的歌。
*柯南等人去一个钢琴世家调查“七子”的音乐。
*小五郎在和播音员的一次对话中得知她被恶作剧的门铃困扰，于是和柯南、兰一起去了乐乃的家。虽然小五郎等人抓到了犯人，但此时柯南从安装的bug中意识到，可惜奈其实是黑组织的黑帮成员。随后，该黑组织制定了在edayP下午1暗杀一名代号为DJ的男子的计划。被美国联邦调查局和柯南拦住，水无怜奈受伤昏迷。
*贝尔摩去了水无怜奈一个事故目击者的家里，引起了柯南的注意。
*小兰的新同学颖友总是给柯南不好的感觉，四处寻找她的妹妹颖海，她长得和水无怜奈一模一样，但血型不对。黑暗组织到处寻找水无怜奈。水无怜奈得到了美国联邦调查局的帮助，假装失去了知觉。被本堂的应友攻击后，不得不说出自己的真实身份。原来水无怜奈是中央情报局的卧底。水无怜奈答应赤井秀一重返组织，但他接到的第一个任务是杀死赤井秀一。赤井秀一有牺牲的嫌疑。
*水无怜奈向朱迪泄露了信息，并组织驱逐了一名强大的侦探波旁。工藤新一的房子搬到了一个名叫冲矢昴的新房客那里。据海原爱反应，此人人脉很广。他是组织的卧底波旁还是重生的赤井秀一？