迪达拉想抓住鸣人，鸣人是九尾的人力支柱，于是他带着艾罗出洞，鸣人追了出去，卡卡西也跟着出去了。木本樱和千代面对的是千代的孙子。千代和木本樱逼出了蝎子的身体，发现蝎子把自己变成了木偶。木本樱要求千代的婆婆用自己做傀儡对抗蝎子。最后，千代的婆婆终于用蝎子父母做的木偶杀死了蝎子，并告诉木本樱，蝎子其实已经识破了她的攻击，只是没有行动就死在了父母的木偶手里。作为木本樱杀他的“奖励”，蝎子告诉她，大蛇丸的间谍会在十天后和他见面。
另一方面，迪达拉的鸣人不容易对付。卡卡使用了新的万花筒sharingan，这让迪达拉感到更加困难。当凯班到来时，迪达拉做了同样的事情，利用爆炸转移人们的力量，但卡卡西利用沙林根将爆炸和迪达拉的手转移到另一个空间。
千代的婆婆原本是一个不相信联盟，只做对自己好的人，但在鸣人的影响下改变了想法。和蝎子打完之后，千代没有急着去解毒，而是追着鸣人，奔向我的爱。她用禁轮回复活了我的爱，牺牲了自己。鸣人告别了我爱罗，回到了木叶。
在完成任务的过程中，卡卡西启动了万花筒，在医院耗费了太多的精力，于是暗河带领7班代替卡卡西执行任务。同时，在木叶长老的要求下，黑暗中的“根之忍者”赛加入了鸣人阶层，而“根之忍者”的导演团藏则是反对鸣人三代的激进团体。木本樱和鸣人都拒绝了他。根据毒蝎临死时的线索，他们前往大蛇丸附近与萧的密探会合，发现密探原来是窦，但窦声称自己对大蛇丸忠心耿耿。在路上，大家的身份被大蛇丸发现，于是大家和窦、大蛇丸有了一个心房。
最后，赛和大蛇丸一起去了他的老巢，鸣人和所有人都认为赛被西藏和大蛇丸的秘密任务暗中雇佣，背叛了木叶。大河的二重身也追踪到了这个地方。众人进入大蛇丸的巢穴，抓住了似乎背叛了他的赛。赛被鸣人感动，决定帮他把佐助带回木叶。赛走后，大和木本樱发现了赛的绘本，知道赛的任务不是背叛木叶和大蛇丸的联合，而是为了木叶的安全杀了佐助，但他们还是认为佐助还是想杀佐助。这时，他们都冲到佐助的房间，见到了佐助，但佐助一点也不为所动。另外，以前也无所谓。上次没杀鸣人是因为不想心血来潮，这次想心血来潮杀鸣人。我说我毫不犹豫的欺负鸣人，拔剑刺他...
此时，赛持刀挡住了佐助，但在佐助的千鸟面前，所有人都倒在了地上，河被贯穿查克拉的剑刺伤。九尾引诱鸣人解除了鸣人体内的封印，释放了它的力量。鸣人拒绝了。这时，佐助实际上看到了九尾。这就是sharingan的力量？九尾也看着佐助，说佐助的眼睛和他见过的内广(新人物)的眼睛一模一样。佐助冷笑，鸣人问佐助为什么。佐助说，他和大蛇丸的实力都对付不了雪貂。如果他变成了大蛇丸的容器，可以杀死雪貂报仇，那他做什么都无所谓了。听到这里，大和准备认真对付佐助，佐助想用自己的新力量，但随后大蛇丸阻止了佐助，说他们现在的力量对付不了小，不如把鸣人的力量留给驱散小。
回到木叶后，赛留在了7班，并要求团藏保留自己的名字“赛”(因为这次任务临时取了这个名字)。并且开始学习人际关系(汗)，想和鸣人以及他们和睦相处。七班去医院看卡卡西，把赛介绍给卡卡西。卡卡西决定训练鸣人的新技术，这是一种“自然变化”的技术。训练中要求鸣人使用自己的影子分身，让他在一周内学会别人几年才能学会的技术，而在此期间，他还需要唯一能克制九尾力量的河流的帮助。
与此同时，萧的成员们还在积极地收集，有两三条尾巴已经落到了他们的手里。木叶的火神庙也被飞段、焦度和觉觉洗劫一空，十二守护者之一的住持已经牺牲。同时，阿斯玛前往三代墓祭祀，暴露了他十二忍和三代子的身份。鸣人经过测试，知道自己的属性是风，于是找阿斯玛学习同属性的训练技能，得到了阿斯玛的指点，受益匪浅，继续练习。铁手还集结了包括阿斯玛、卢湾在内的新队伍，参与追捕洗劫火神庙的萧成员。
鸣人终于可以用风属性切叶子了。卡卡西让鸣人继续练习切瀑布，大和做了瀑布给鸣人练习。这个高难度的练习花了鸣人很多时间。晚上，毫无进展的鸣人辗转反侧，回想着佐助的近况，忍不住起身继续练习。第二天卡卡西发现鸣人已经练成功了。。。
阿斯玛带领的队伍到达了火之神殿，但是没有发现大地的尸体。同行的和尚告诉阿斯玛，这块地的人头值3200万，应该是萧成员用悬赏金换来了这块地的尸体，并提醒和这块地一样也是“十二护卫奶妈”的阿斯玛要小心。阿斯玛轻松地笑称，自己的脑袋比土地还值钱五百万两百万，轻易放弃也不会容易。只有鹿丸能从她的眼睛里看出阿斯玛的内心并不轻松。之后阿斯玛命令几个小队前往黑市交易点，自己和卢万组成的小队前往最近的交易点追查小何的尸体。。。
练习结束后，卡卡西邀请鸣人吃拉面(其实卡卡西最后是以他的“好口才”邀请了大和)，并告诉他以后会有新的练习。演习中，卡卡西告诉鸣人“螺旋丸”的秘密，这是一门四代未完成的艺术。四代一开始创造它是为了把“形态变化”和“性质变化”与自己的属性结合起来，但没有成功。卡卡西也是，虽然他也能“螺旋丸”和“瑞秋”，但他不能把螺旋丸和瑞秋结合起来。卡卡希望鸣人能完成这个四代都无法完成的技能——甚至是不可能完成的，也相信鸣人能完成。受到鼓舞的鸣人继续练习，而阿斯玛在战斗中被飞段和角斗士杀死。现在Lumaru队和卡卡西老师正在阻止他们进入火国，抢占人力柱。关键时刻，鸣人他们来了。
面对七对一的局面，焦度拿出了通灵卷轴和通灵四个包扎好的物体。。
然后所有的角发出那些血管线，刺向这四个绷带物体。。
然后所有的绷带都爆炸了，露出里面的物件。这四件物品原来是穿着萧制服的木乃伊。。
告诉卡卡西他们，这四个伙伴是他以前杀的，他们都是萧的成员！牛角用医疗忍者很好的保存了这些尸体，而且只在关键战役中使用，所以可以保存很久。。
这四个木乃伊，连同焦度和卡卡西，必须面对五个成员的强大的怪物与知识。。
经过激烈的战斗，凭借着鹿丸的智慧和鸣人的新耐力。所有的角都被打败，最后被卡卡西用千鸟杀死。卢湾去拜阿斯玛，洪也去，得知洪怀孕了。鸣人，小樱，赛在吃拉面。三个人的感情渐渐融洽起来。
另一方面。佐助趁大蛇丸虚弱去拿药的时候攻击了他。大蛇丸的真面目是一条白蛇。他准备转身，最后却杀了大蛇丸。佐助让水月先走，让他跟着。他们来到了他们过去打败过并且再也没有砍过的那座桥。水月没有再砍晚辈。他拿着雾忍七刀的大刀，说刀是代代相传的，佐助也拿走了北方的重吾和南方的香磷。
水月和佐助争论着，走到了监狱一样的地方。
有一大群人被大蛇丸抓住了。
然后翔磷上台(戴眼镜的女人)
项磷一开始是反抗并帮助他们的。在水月走出房间的那一刻，香溢的态度发生了变化。用房间钥匙从里面把门关上。
甜磷《走吧》
突然走近佐助，摘下眼镜。
翔磷“如果是佐助~ ~ ~再怎么说~ ~我就和你一起演戏。”
佐助:怎么了？这么快就改变主意了
项磷“仔细考虑了一下，我就是看腻了这个东西。”
磷化氢一直在向佐助靠近。
佐助，“求你了...留一点。”
香磷“嗯，如果...反正就我和佐助了，不是吗...那家伙水月不要了？”
水月回来发现锁了，就用刀把墙毁了。
水月:“走吧，佐助，看来香磷不行了。”
佐助:那，你想清楚了，就跟上。
“谁的香磷...谁说要去了！”我只是碰巧路过，一起去的...同一个方向...仅此而已。"
水月在的时候，香林听起来又像个唱反调的。
最后，在监狱里，一个被锁着的人喃喃自语
男人“讨厌...真的是女的...还是女人好，我讨厌。我必须等待...或者一个男人...还是男人好。”
水月和佐助争论着，走到了监狱一样的地方。
有一大群人被大蛇丸抓住了。
然后翔磷上台(戴眼镜的女人)
项磷一开始是反抗并帮助他们的。在水月走出房间的那一刻，香溢的态度发生了变化。用房间钥匙从里面把门关上。
甜磷《走吧》
突然走近佐助，摘下眼镜。
翔磷“如果是佐助~ ~ ~再怎么说~ ~我就和你一起演戏。”
佐助:怎么了？这么快就改变主意了
项磷“仔细考虑了一下，我就是看腻了这个东西。”
磷化氢一直在向佐助靠近。
佐助，“求你了...留一点。”
香磷“嗯，如果...反正就我和佐助了，不是吗...那家伙水月不要了？”
水月回来发现锁了，就用刀把墙毁了。
水月:“走吧，佐助，看来香磷不行了。”
佐助:没有..好像还可以。
“谁的香磷...谁说要去了！”我只是碰巧路过，一起去的...同一个方向...仅此而已。"
水月在的时候，香林听起来又像个唱反调的。
最后，在监狱里，一个被锁着的人喃喃自语
男人“讨厌...真的是女的...还是女人好，我讨厌。我必须等待...或者一个男人...还是男人好。”