动画版与漫画版有很大区别。尽管基本剧情一样，但是新角色圣蔷薇骑士团以喵喵的对手出现。
在漫画中，草莓的戏分更加多，就如同她是唯一对抗外星人的喵一样;其他的主要角色被设定成跑龙套。在动画里，其他角色，其他主要角色有更多的情结;喵喵们被给予了更多的独特个人品质，白金棱的过去得到更多解释。赤坂圭一郎或许是戏分增加最多的角色;在漫画种，他基本是被一笔带过，并且他的历史就只是帮助白金棱运作喵计划。整个动画都描写了不同角色。
草莓和黄步铃的家庭是仅有的两个家庭在漫画中有交代，但是也是非常粗略的。在动画中，蓝泽薄荷和黄步铃的家庭被给予了一整集介绍。碧川香菜粗略的进行交代，藤原石榴的家庭和童年被略为提及。
角色们的关系在动画里也被深化。在漫画中草莓是唯一一个有爱情生活的。五只喵喵中的三只有自己的一集来讲述他们的爱情生活。比如，在漫画中，碧川香菜对白金棱有蒙胧的爱意。但是在动画中，这种关系显得更具体，有一整集的故事专门讲述这段恋情。蓝泽薄荷与藤原石榴的关系同样被深化;在漫画种，藤原甚少与薄荷交谈，给人感觉石榴有意忽略薄荷。在动画中，石榴显得更注意薄荷，就如同姐妹关系一样。
事件发生的地点也不同;在漫画中，石榴在跳舞室中第一次面对一个圣蔷薇骑士。在动画中，她第一次与圣蔷薇骑士的遭遇是在教堂。事件也改变了;在漫画里，女孩子们在第一章注入DNA以前就相互认识。在动画中，她们不知道对方直到草莓发现她们是喵喵。一些事件的发生顺序也改变了;在动画中，蓝色骑士的出现是在第一个喵溶液发现后和在桃宫与青山雅之间的感觉显现以前。