《月球人》改编自史昭创作的同名漫画，漫画中的故事发生在30年前。为了防止一颗名为Pai的行星撞击地球，科学家们做了月球盾牌计划。就是在月球上建导弹基地，先发射大型导弹把馅饼劈成两半，然后在地球轨道上用更多的小型导弹把剩下的一半馅饼砸碎。
主角“我”原本是一个一无所知的动物学家。他不是报名去月球的，而是被迫成为月盾计划的一员。但在月盾计划中，动物相关领域的专家感染了病毒，于是他被迫成为月盾计划的一员。
当所有的安排都完成了，月亮护盾的成员返回地球时，“我”…被留在了月球上。后来，在“月盾计划”中躲过攻击的行星碎片撞击了地球。“我”目睹了这一幕，以为地球在劫难逃。我成了地球上唯一一个。
虽然“月盾”基地有足够我吃100年的食物，有取之不尽的电和水的储备，但无尽的孤独让活着成为一种痛苦。
在这种情况下，我可以分为“我想活”和“我想死”。乐观和哀悼根据月球上的昼夜交替出现。“我”尝试了40多次跳楼，但因为月球的引力，我只是把跳楼练得更加多样化和熟练。
“我”想通过减少营养吸收和“折磨”身体来达到目的，但我锻炼自己是为了更强壮；我想通过不睡觉来达到我的目的，但是我变得更有知识，因为我通过读书来阻止自己睡觉。
明明想选择结束生命，放弃，却总是避重就轻。闹了很多笑话之后，“我”终于明白了，我的目的就是死，所以我一定要好好活着。我在月球上折腾的时候，不知道地球没有死。那块撞击地球的行星碎片引发了一场全球海啸，让地球布满灰尘，科技倒退了50年。
但一切依然存在。保留在月球上的先进技术，在半损的情况下，把我在月球上的所有行动同步广播给地球上的人类。据传“我”是因为返回舱空间不够而自愿留下来的，因此受到世人的尊敬和崇拜，成为全球英雄。
就在“我”已经渐渐适应了月球上孤独的生活的时候，我发现还有生命。在经历了恐惧和警惕之后，“我”看到门口有只袋鼠…