1和1集讲述了左天泪和初春饰利被不法分子骚扰，及时赶到的御坂美琴和白井黑子解救了他们。这一天，美琴在图书馆和另一个level5的食蜂人发生了冲突。后来，美琴等人在医院探病时遭遇歹徒袭击。当马被美琴抓住时，他们打了起来。
2.第10集讲述了来到数据库室进行销毁的美琴回到设施中心后，遭到了迈耶的袭击。逃跑后，美琴被一路追杀，在马的掩护下，她终于在院子里将击毙。第二天，美琴住进了最后一个研究中心，却发现楼里空无一人。美琴以为一切都结束了。
3.第11集讲述了美琴在公园遇到了当妈，两个人围绕着自动售货机展开了讨论。美琴生气当妈不怕她电的能力。另一边，黑子还在等着美琴回来，于是看到长椅上的两个人，误以为他们在约会。
4.12集讲述了在美琴决定知道这一切的那一天，她在山上遇到了当妈，得知了一个御坂妹妹的消息。后来，当马再次见到时，美琴乘车来到学院城的宇宙中心，准备将错误的信息输入给树的设计者。
5.第13集讲述了御坂妹妹第10031号当晚与一方开战的故事。当马从便利店出来时，她发现不见了。与此同时，美琴因为没能消灭树设计者而非常沮丧，随后她潜入了宇宙中心的研究大楼，开始肆虐。
6.第14集讲述马来女生宿舍找美琴时，为了陷害他是马，黑子把他关在宿舍里。在宿舍里，他向黑子询问了关于梅琴的情况，并发现了御坂妹妹的神秘计划。为了救御坂妹妹10032，他按照计划去了相应的地方。
7.第15集讲述了马跑到实验场去救的故事。这时，御坂妹妹已经被一方的流量打败了。就在这关键时刻，马赶到了现场。看到受伤的御坂妹妹后，愤怒的当妈在一边发起了攻击，而与此同时梅琴也来到了战场。
8.16集讲述了御坂妹妹联手摧毁一方流量的绝招。美琴开始了保护前御坂妹妹和一方流量的战斗，倒下的当妈也在这个时候站了起来。在当妈的特殊能力下，终于打败了一方。第二天，美琴和御坂妹妹去医院看望了受重伤的当玛。
9.第24集讲述纪律委员会吸引了两万驾甲的注意，美琴和菲布理深入敌后核心。菲布理还剩最后一颗糖果，可以使用“原子崩溃”的机器人摆在面前，让整个雪原城顿时陷入一片废墟。当一切危机一触即发的时候，美琴和当妈克服了最后的困难。