组织真实名称不详，影片一般称“黑(暗)组织”“组织”，组织的组成结构和目的不明显。但可以肯定的是，该涉黑组织是一个规模庞大的犯罪组织，在日本政界、经济界、科学界影响广泛，资产雄厚，人脉深厚。通常的方法是控制重要人物的生死，然后用钱秘密收买他们，开发可以影响全人类未来的神秘药物和程序。
该组织的代表色是黑色，所有成员都穿着黑色。除了Boss，主要成员都以酒的名字作为代号。有非常严格的内部纪律，不合格的成员，暴露组织身份的成员，背叛组织的成员都会被迅速淘汰，不留任何做事痕迹。而且保密性极强，甚至成员之间可能都不认识。
该组织的目的也不得而知。它成立于不少于半个世纪前，表现在电视130《竞技场无差别胁迫(上)》:“工藤新一，也许你不知道，你已经深深卷入了我们组织半个世纪前就开始的秘密计划”。从时间上算，芦原说这句话大约是1995-1996(根据柯南的世界时间)。回溯50年，恰好是1945-1946，正好是二战日本战败后的一年之内。
规划半个世纪的目的是什么？根据他们的APTX4869，该药物的主要功能是诱导细胞程序性死亡，但同时加强端粒酶的活性，从而增加细胞增殖能力。正常情况下会导致使用者死亡，但由于细胞自毁程序的意外作用，除了神经系统、骨骼、肌肉、内脏和毛发以外的所有细胞都退化到了幼儿期。研究这种药绝对不是为了制毒，而是通过这种药来控制或者拉拢一部分人。根据上述推断，该黑组织的头目很可能是一个军国主义的死忠，他开发了APTX4869为日本帝国的统一招兵买马，然后利用某种程序造成破坏或者控制人类。以上均为个人观点。