精神修炼:忍术不同于其他武学，它强调的是身体训练，尤其是精神修炼，它的整个训练体系都是建立在难以想象的精神修炼之上的。因为忍者执行的任务大多是一去不复返的高风险任务，需要克服死亡、孤独、黑暗、饥饿、寒冷、受伤等诸多困难才能在敌人的巢穴中独自完成任务，所以拥有强大的精神力量才是忍术所向披靡的真正原因。
作为忍者家族的后代，一旦出生，就必须接受残酷的命运现实——要么成为忍者，要么死去。忍者从很小的时候就被灌输了对主人绝对忠诚的思想:除了自己的主人，没有人会听命令，即使是日本天皇也不行。这种从小就被精神洗脑造就的忍者，比任何一个宗教信徒都更加狂热和无畏。但是，忍者并不是像邪教那样的僵尸般的战士。它有一套实用的强大精神力量的训练方法。这个技术是忍术的秘密，是东米的做法。托米和中国的藏密、印度的杂密一样，是密宗的一个分支。而且Tommi在人类心智的发展上一直有着自己独特的传承，在密宗圈子里也一直以速度惊人著称。忍者通过对Tommi秘法的修炼，锤炼了自己的意志，精神变得异常纯净坚韧，身体内的潜能将得到最大限度的开发。可以彻底摆脱内心的迷茫和恐惧，专心投入战斗。另外，密宗认为人体有很多奥秘和潜力。修行者只有通过密宗佛法的不懈努力，才能发挥自己的全部潜能，让身体与宇宙沟通，达到天人合一的境界，这与忍者所追求的终极体术不谋而合。密宗佛教视如来为万物之主，大力提倡传承、咒文、密咒。我们经常可以在一些影视作品或者漫画中看到忍者做出很多奇怪的手势，就是表达九字秘印，这是东密的主要做法之一:“亲、兵、斗、者、解、真、烈、在、前”的九字真言。
技能训练:忍者家族的孩子，无论男女，都必须继承祖先的职业传统，一般从五岁开始接受训练。训练有五种类型，即平衡、敏捷、力量、坚持和特殊技能。平衡训练从在竹竿上行走开始。当你能在一根圆竹竿上行走而不下滑时，你会逐渐抬高竹竿，最终它会升到30到40英尺高，达到跑跳的水平，这样你就能在树上、屋顶上、墙上爬上爬下，像苍蝇一样行走。敏感训练也是如此，拿着刀片跳过绳子，在满是利刃和枪头的狭窄通道里兜圈子。耐力和力量训练是最难的，比如把双手挂在树上支撑全身，在下面放上隐藏的武器，这样就不能松手跳跃，可以用恐惧来激发身体里的潜能，进行长时间的支撑。长跑是忍者的基本功，要求跑50公里不停歇休息。每天走几百里是家常便饭。至于特殊技能的训练，就更让人吃惊了。除了以上，还有徒手格斗，投毒，解毒。化妆是忍者的专长。他们可以做假脸，改变性别。让一个忍者穿过人群，被几个人认出来。结果每个人看到的东西都不一样，比如身高，胖瘦等等。真是“千面人”。还有就是隐形。文章开头说美国忍者在硝烟中突然消失就是一种。即忍者事先挖好一个洞，然后在烟雾的掩护下跳进洞里，让追捕者失去目标，认为有“隐身”的可能(但一般这种洞都是在树林等容易隐藏的地方挖的，像电影里那样消失在水泥地上就太夸张了)。
体能训练:忍术对体能训练的强度也是非常残酷的。每个忍者都必须掌握忍术的内容。而且每次训练都是死亡淘汰赛，不能承受的人不允许存活。除了常规训练，忍术还包括各种各样的“怪力训练”，通过这些训练，忍者们进一步磨练自己的意志、耐力、生存能力等等。这种怪力训练，比如连续几天不吃不动，杀死自己的同伴，和野兽搏斗，是不可想象的。
忍者通过这些死亡率极高的非人做法，实现了从精神到肉体的超人飞跃。获得了超乎常人的毅力、耐力和战斗力。通过忍术训练活下来的忍者，都是绝对可靠的全动力战斗机器。
忍者和武士
战国时期，虽然都是为大名臣服务，但忍者和武士的身份分别是天与地，形象就是忍者是家奴，武士是家臣。因为忍者做的事情大多是涉及上层权力斗争的秘密事件，危险性相当大，所以他们的结局往往很悲惨。危险首先来自雇主。这些阴险毒辣的社会头面人物，为了不择手段达到目的后，怕内幕败露，往往会杀掉执行任务的忍者让他们噤声。