安倍晴明和博源雅是当时非常著名的人，他们两个人生活在同一时期，源博雅比安倍晴明大上四岁，但是他们两个人却无话不谈，是关系非常好的“朋友”。
故事发生在人鬼***生的年代，原本属于阴界的魑魅魍魉，潜藏在人类的恐慌中伺机而动，阳界的秩序岌岌可危。幸而世间有着一群懂得观星测位、画符念咒，还可以跨越阴阳两界。
御灵相当于阴阳师的守护者，不同的阴阳师拥有不同的御灵，御灵伴随着阴阳师出入于战斗当中，御灵可以为阴阳师带来额外的属性强化，御灵的等级越高对阴阳师的属性加成就越大。
而阴阳师到达一定等级时会获得一个“御灵被动技能”，就是当阴阳师在战斗中如果受到攻击，御灵有几率会对敌方全体进行反击，伤害值取决于御灵的伤害属性。御灵可以通过“吞噬”御魂来强化自己以达到提升等级的目的。