1、促进营养物质的消化吸收
益生菌可合成消化酶，它们与动物体合成的消化酶一起，参与肠道中营养物质的消化?[3]?，刺激动物体分泌消化酶，降低小肠隐窝深度，增加绒毛高度，增加小肠表面积，促进肠道营养物质的吸收。
2、提高机体免疫力
益生菌的自身结构如肽聚糖、脂磷壁酸等成分可作为抗原直接发挥免疫激活作用，或者通过自分泌免疫激活剂，刺激宿主免疫系统，从而提高动物的免疫力，增强机体固有免疫细胞和自然杀伤细胞的活性，激活树突状细胞。
3、维持肠道菌群结构平衡
肠道不仅是机体正常的组成部分，参与机体重要的生理活动，同时，肠道中还存在复杂的肠道菌群，它们对宿主的生长、发育和健康等方面发挥着重要的功能。
4、改善肉质
益生菌可通过抑制脂质过氧化，延缓高铁血红蛋白的形成，从而提高肌肉的亮度。益生菌还可影响脂肪酸代谢，提高肌肉的嫩度。
5、提高机体抗氧化水平
机体中氧化物如氧自由基和羟基自由基等，含有未配对的电子，容易发生氧化还原反应，当机体中的氧化物过量时会导致机体产生氧化损伤。机体中存在着抗氧化系统，它们不断的清除机体合成的氧化物，维持着氧化物的动态平衡。
6、养殖水质调节
益生菌参与水体中的多种循环过程，通过自身的代谢，消耗水中的有机物质，减少水体中亚硝酸盐氮、氨氮的浓度，从而达到改善和维持良好水质的效果。
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