因为小青认为许仙背叛了她们。在许仙的三观下，自己被迫入空门以求法海放过青白二蛇是有情有义；在二蛇的三观下，生死之事为浮云，白蛇要的是爱情，可许仙先是屈于小青之诱，而后屈于法海之威。从一开始白蛇就是畏惧法海法力的，但是后来带着孤注一掷的决绝水漫金山，她心底必是期望许仙站在同一战线以死相抗。所以当白蛇身亡，青蛇带着白蛇遗子，见到的却是已剃度的许仙，她们的所有牺牲和抗争都成了笑话，于是青蛇悲愤道：你背叛了我们，然后杀了许仙。
我认为小青最后杀许仙和《飞越疯人院》中酋长杀迈克是同样的原因。因为许仙的六根被被封住，已经失去了凡人的七情六欲。此时的许仙对人世间的情谊既听不见，也看不见。真正的许仙已经死了，小青所做的只是让他解脱。
这时小青就已经知道许仙已经被斩断凡人的七情六欲了，但是她为了完成对白素贞的承诺，依然要找到许仙。
许仙找到了，可是已经不是曾经那个痛骂法海，高喊“我沉迷于女色，我愿意，我舒服，关你屁事”的许仙了。
被封住六根的许仙心中已经没有“娘子”了，对白素贞的称谓只是跟着小青一样叫“姐姐”。
听到这些，小青知道原来的许仙已经死了，这个许仙只是一副空壳，既然如此，那我就帮你解脱吧（像不像《飞飞越疯人院》莫非酋长去找迈克一起走，却发现迈克已经成了一个“傻子”，酋长给了迈克一个拥抱后杀死了他——我知道现在这副样子不是你想要的自己，你自己也不想这样活着，我不是要杀你，我只是帮你解脱）
一是小青觉得许仙背叛了她们两姐妹。她第一眼找到已经剃度的许仙，流下眼泪，那是她第一次懂得眼泪的滋味。白蛇不顾千年修行被废的危险，也要水淹金山救出许仙，青蛇自己作陪。而许仙，在青蛇看来是归入佛门，断却七情六欲，罔顾二人冒死相救。青蛇把许仙带出来后，白蛇已死，悲痛又失望，对“人世间的情”失望幻灭，杀死许仙。
二是小青希望许仙和姐姐在一起，哪怕姐姐死了。刺死许仙前，小青说，“你应该和姐姐在一起的”不管是身，还是心，都应该在一起。