晋江之名的由来有多种说法。
其一说法是：“以晋南渡时，衣冠避此者多沿江而居，故名，县名因之”。也就是说，晋代时，中原的士族为避战乱，南渡长江，逃入闽南，定居于今晋江两岸，即将这条河流取名为晋江，晋江地名也因之而命名。
其二说法是：晋代时，由于有大量中原汉人入闽，故晋武帝析建安郡置晋安郡，下统晋安等八县。晋江流经之地属晋安县辖区，故江取县名首字“晋”字为名。
其三说法是：南安江易名晋江与晋人南迁有关，但当时晋江仅处于泉州城北一里至南安丰州双溪口这段江面。唐开元六年析南安东南地置晋江县，县治设于泉州城内。《新唐书》载：“晋江县北一里有晋江。”其他江段各有名称，如安溪境内称兰溪，永春境内称桃溪，南安境内称东西溪。后来由于江重地名，即将南安江改称晋江。因而认为晋江之名起于晋代，而整条江更名成于后代，县名即由江名而命名。