《新白娘子传奇》大结局是白素贞被镇压在雷峰塔下。许仙从此四海为医，悬壶济世，替妻赎罪。
蛇妖白素贞受观音点化，向善千年，终化人形。为红尘证道，白素贞到人间修行，与临安城大夫许仙相识。白素贞误以为许仙是冒充医仙华佗的骗子，为揭穿他的真面目，她和对方“比拼医术”，打赌谁先治好长生的母亲。
白素贞发现长生母亲中了蛇毒，追查到女娲庙青蛇妖小青，两人不打不相识，最终结拜姐妹。因妖孽作祟，临安城陆续有孩童失踪，金山寺和尚法海奉师命前往临安城捉妖。法海以为作恶的是青白二蛇，追杀二妖。
直到元宵节灯会，小长生被掳走，众人才知道作祟的是蜈蚣精。法海与二妖联手对付蜈蚣精，二妖的正直令法海对妖的偏见产生了动摇，他决定留在临安观察二妖。许仙与白素贞在相处中，彼此相爱。一直爱慕白素贞的鼠妖景松和倾心许仙的金如意千方百计离间二人感情，但许白二人痴心不改，历尽磨难后喜结连理。
二人开设医馆保和堂，小青也与伙计张玉堂相恋，几人联手救死扶伤，造福一方。法海因开天眼，预见到水漫金山的一幕，担心二妖是伪善，一切不过是为了蛊惑人心。怀疑之下，他道心动摇，产生心魔。如意看到许白生死相随的深情，心灰意冷之下被心魔蛊惑，制造凶案嫁祸白蛇。
为了保护妻子，许仙求助法海，以纯善之身困住心魔，并借助金山寺众僧之力，与心魔同归于尽。白素贞不舍许仙牺牲，不惜水漫金山逼法海放人，最终犯下大错，被镇压在雷峰塔下。许仙从此四海为医，悬壶济世，替妻赎罪。
《新白娘子传奇》剧集评价
《新白娘子传奇》投入的经费有限、技术有限，如今过了20余年再回看，也依旧不过时，甚至还很对味。制作上的拙劣明显。外景有限，棚内布景居多，假山假草易见，就连白蛇青蛇道具、法术特效，看起来顶多也就值一毛。
但是再看，“雷人”依旧和它们不沾边。该剧重播有时不仅仅是“情怀杀”，也是因为过些年再看，老剧仍能看出新意、看出惊喜，才更加吸引观众津津有味重温。
《新白娘子传奇》是中国重播次数最多的港台电视剧，几乎每年都重播。好剧配好乐，该剧盛演不衰，每一曲都好听，且耐听。无论是演员，服装造型，法术特效，启用反串大胆创新，边演边唱方式独特，整部剧相当唯美。赵雅芝端庄大方、温柔高贵的白娘子形象以及叶童的反串许仙都已深入人心。