张小燕时期
当《百万小学堂》开场音效开始后，主持人喊：“各位同学，开课了噢～！”而智囊团五位成员，会从指定通道内依序走出，并与主持人击掌（give me five），并坐在指定位置上，主持人稍微谈话完后，带动喊口号。
因应甲型H1N1流感（H1N1），自2009年5月8日（第三十三集）开始，主持人不向小朋友击掌，且没有任何亲密接触；智囊团陪考生，则改以鞠躬的方式向主持人问好。直至H1N1疫情没那么严重后，2009年6月19日（第三十八集）恢复击掌入场。而再从2009年9月18日（第五十一集）开始，仍以预防H1N1为由，改以拱手礼向主持人问好，直至疫情再次降低威胁时，智囊团陪考生于第七十八集的节目恢复击掌（部分陪考生仍以拱手鞠躬为主）。
小虾时期
第一版
首先由小虾在主持位置先说出一则冷笑话，再喊出“开课了”之类的字眼。智囊团五位成员，还有主持人曾宝仪，同样也会从指定通道内依序走出，但不做与曾宝仪或与小虾击掌拍手动作。各自走出来后，曾宝仪与小虾***同站在主持位置，五位小学生智囊团会坐在指定位置。曾宝仪与小虾谈话完毕后，小虾就坐“班长位置”，而曾宝仪也开始带动喊口号。
第二版
由曾宝仪喊出“开课了”或“上课了”之类的字眼，再由五位智囊团与小虾从指定通道走出，并与曾宝仪做击掌动作。智囊团成员就做指定位置后，曾宝仪与小虾***同做开场白，谈话完毕，小虾就坐“班长位置”，曾宝仪也开始带动喊口号。