他们终于来到了森林终点站，在数字扫描仪的指引下来到了一座城堡。在城堡里，他们遇到了冰巫兽，冰巫兽把他们带到了三个沉睡天使之一的研究天使兽的房间。这时，每个人也知道了属于三位天使的另一位神圣的天女兽一直在指引着每个人。数字扫描仪的光被收集来唤醒研究天使兽。大家在天使兽的口中得知了整个事件的起因。这时，洞穴野兽带着它的同伴，其他四个邪恶战士中的三个闯进来。研究天使兽拥有压倒性的力量，但邪恶斗士瞄准所有人攻击分散研究天使兽的注意力，最终打败了研究天使兽并吸收了它的数字代码，研究天使兽变成了数字蛋。全冲过去抢数码蛋，然后冰法师牺牲自己保护孩子不离开。怀着悲痛和愤慨，每个人都乘火车离开了...
拯救汉堡兽！友树真诚的心(拯救汉堡兽！友之天真的心)
当他们来到汉堡村时，得知汉堡店的经理被许多变色龙兽抓走了，要求他们今晚做美味的汉堡作为交换，于是他们决定帮助汉堡兽做汉堡。等大家都做好了，波哥兽和提问者一起品尝。虽然拓和圭司讲的很好，但是他们的厨艺很烂。但是他们很不服气，他们继续这样做...这时候已经是晚上了，另外三个人拿着优树做的汉堡来到外面，因为优树做的汉堡很好吃，被变色龙兽带到了一个城堡里。三个人遇到了汉堡兽的经理，他吃了一个由优树做的汉堡包，并对它大加赞赏。三个人为了营救被绑架的汉堡兽商店经理的孩子，打败了变色龙。这时花瓣龙兽出现了，三人得知是花瓣龙兽。汉堡兽的经理把加工好的汉堡给了花瓣龙和野兽，它们吃饱了就睡着了。汉堡兽一家终于团聚了。
第20集隐藏在黑暗中的战斗黑暗兽！潜伏在黑暗中的粉丝斗士！黑暗野兽)
水、木和钢的邪恶战士被基鲁比兽召唤。天使兽揭露了钢铁的邪恶，银镜兽隐藏了研究天使兽的信息，这让他非常生气。他们来到了黑暗的大陆，不安的预感笼罩了整个大陆...他们遇到了性情温和的蝙蝠兽，但圣树兽立即出现，吸收了蝙蝠兽的数据，进化成花瓣龙兽来攻击人。大家都进化成野兽来战斗，但是花瓣龙兽吃了森林里的树，变得巨大，力气很大，还能自我恢复。五兽对此无能为力。但万兽联合起来，用组合技能挡住花瓣龙的攻击并将其打倒，最终抢夺木兽魂。这时，最后一个邪恶的斗士——代表黑暗的黑暗兽出现了。出乎所有人意料的是，它竟然用剑杀死了树兽，然后面对所有的野兽。一场激烈的战斗即将开始！
21集全军覆没！？可怕的黑暗势力(五个战士全军覆没！？恐怖的黑暗力量！)
暗兽有着不可思议的战斗力，人没有办法伤害它，只能逃跑。拓也相信每个人都可以打败暮光之兽，但惠尔认为这是不可能的，而应该先逃到安全的地方。力拓也想出了进攻策略，却被惠尔训斥了一顿。惠儿和拓也来到一个地方单独交谈。惠尔告诉力拓，黑兽的力量还没有发挥出来，但力拓也坚信大家都会赢。这个时候暗兽被杀，大家只能用力拓的策略来对抗。但是无论怎么攻击，就算四只野兽同时攻击，也伤不到暗兽，反而吸收了攻击力。这时，野兽在黄昏时袭击了阿古尼兽，银狼兽奋力抵抗这一举动，退化了。拓也痛苦地叫出惠尔的名字。就在这时，黑暗兽突然行动异常，散发出黑暗力量...拓也醒来时眼前站着一片黑暗。彻底绝望了，他坐在通往现实世界的黑暗运输兽上...
第22集回家！拓也独自回到了现实世界(回我家！拓也独自返回)
当黑暗的运输兽到达车站时，这里已经是陀刚刚开始乘坐前往数字世界的车站了。这时，拓也看到了黄昏时野兽的幻象...当拓也乘电梯来到二楼的电车站时，被众人用异样的眼光看着，才发现自己变成了一个不像人也不像兽的人。拓也来到他家，发现自己又回到了出发去数字世界的那一天。这时，他看到自己在房间里收到消息，冲向车站。他的意识想要阻止自己之前发生的事情。在电车上，他发现了一个和慧儿相似但不是慧儿的少年。到站后，男孩没能赶上慧儿和拓也的电梯，打算下楼，却滑倒摔下楼梯，躺在地上却还在喊“慧儿……慧儿”。到了车站，拓也打算用最后一次机会让自己停下来，但这时他看到一直和他一起战斗的同伴都上了电车，关爱他们的心终于让他改变了决定，鼓励他自己上了电车。然后，黄昏兽的幻像再次出现，拓也终于在此时重拾信心，一拳将幻像打散...然后，黑暗运输兽再次出现，拓也毫不犹豫地决定坐上运输兽！-自信的火神兽走出运输怪兽，回到了数字世界！
第23集感受数码宝贝的力量！力拓也使出了浑身解数(感受数字猛兽的力量！力拓也在全力奋战)
全、春平、友树被和银镜兽抓走，数码扫描仪也被抢走。这时，身负重伤的惠儿找到了所有人却不敢轻易上场。火神兽从塞皮库那里得知了娜娜兽和银镜兽的下落，并立即赶往那里。娜娜兽要杀了俊平，逼惠儿上场。但是银镜兽和卡马拉兽的实力都很强，狼兽是败的。这时，火神兽来到了，感受到了自然的力量。在自然力量的帮助下，火神兽救出了所有的人，并联合比以前强大数倍的力量，打退了卡马拉兽和银镜兽。然而，就在大家为重逢而高兴的时候，银镜兽有了一个更可怕的计划...
第27集奇迹的双斗士精神战狼兽的诞生！(双魂进化的奇迹！战狼兽出生)
君平、全和优树想再次进入魔弹兽帮助惠儿和拓也，却无法突破保护罩。这时，野兽在黄昏时分突然出现，冲破护盾，进入惠尔所在的区域。全立刻联系拓哉，告诉他魔弹兽和暮光兽的事。黄昏时分，野兽抓住了惠儿，读取了他的记忆。当他得知惠儿的生母已经去世后，他的父亲又娶了一个妻子。但惠儿还是很想念生母，不想叫后妈。惠儿在父亲和继母结婚三周年的时候来到数字世界，于是惠儿去给继母买花，打算给母亲打电话。暗兽得知此事后突然感到非常痛苦，惠儿立刻进化出来与之战斗。然而由于实力的差异，惠儿很快就倒在了暗黑之兽的剑下。拓也通过了冰区试炼，本来可以离开魔弹兽，但是因为担心惠儿而放弃离开。就在黑兽要杀死惠尔的时候，研究天使兽的卵突然发光，笼罩了惠尔。惠尔感觉到人类灵魂和野兽灵魂的力量合二为一，两个灵魂进化成了战狼兽，在黄昏时与野兽展开了激烈的战斗。但在战斗中，惠儿在暮光之兽的手势中看到了一个长得像自己的男孩的影子。这时，由于距离很近，在火神兽到达的一瞬间，战狼兽和暗黑破坏神兽同时离开了魔劫兽的身体。
第28集龙兽托爷的融合与进化！(力拓的融合进化！双兽的爆裂技)
火神兽来到第九区，惊讶地发现银镜兽可以和魔劫兽共存。银镜兽可以自由进出无数的镜子，反射区域内的招式，所以火神兽用尽全力也伤不到它。银镜兽想把这场战斗当成它事先设想的一场戏，于是进入另一个区域，把它之前吸收的研究级天使兽的信息释放出来，合并成一个类似于研究级天使兽的堕落天使。连龙兽都被轻松打败了。萍萍等三人受不了了，拼命想突破防护罩，但堕落天使的魔爪已经抓住了拓的头...这时，塞拉菲亚兽的蛋再次发出金光，让拓也的双魂进化成了龙兽，最后扫描到了天使兽的数据。而数据是突然从终端释放到彩蛋里的。龙兽追到钢铁区，放出一个大火球把金属全部融化，一拳把银镜兽的尸体砸了个稀巴烂对其进行扫描，然后离开了魔弹兽的尸体。这时，天使兽的蛋终于生出了巴达兽！
第29集逃跑！百变魔弹兽(逃！十几个变化自如的动物)
就在拓也等人准备开始寻找惠尔的时候，魔弹兽突然动了。原来钢铁战士把人吸进身体的真正目的，是通过战斗读取猛兽的招式信息。现在，魔弹兽不仅可以随意使用十斗士的招式，还可以在受到十斗士招式攻击时使其无效并加倍反弹。所有人都没有胜算，只好逃跑，而是逃到了一个黑暗封闭的山洞里。在魔劫兽的言语挑衅下，他开始乱了起来，自己人之间打起来了。关键时刻，龙兽大声告诉大家，自己有数码兽的能力，有团结的力量。大家重拾信心，将杀人技能融合到新招式中，最终打破了塞菲罗托兽的完美防御。龙兽击中魔弹兽的心脏并扫描。现在五个邪武者只剩下一个暮光兽了。
第30集飞！黑鹰兽(飞！黑暗战士(黑鹰兽)
战狼兽不断追逐暗黑破坏神野兽，并与它激烈战斗。此时，陀等人在八大兽的指引下下山寻找慧儿，却被前方飞来的类似钢筋的东西困住。就算进化一起进攻，他们也打不垮。此时，一个黑影正在观看光明与黑暗的决斗。突然，黑暗野兽占了上风。就在它要杀死战狼兽的时候，它突然犹豫了一下，但被制止了。这时，影子突然袭击了战狼兽。原来是基路伯兽！它让黑暗之兽想起了自己刚来到数字世界时的场景，让自己的内心再次充满黑暗，进化成了一只黑鹰兽。这时，拓也在巴达兽的提示下挖地道逃出了监狱，感受到了黑鹰兽鸣叫的恐怖。黑鹰兽的实力更差，恐怖的招式差点要了惠儿的命。就在它要杀死慧儿的时候，慧儿的终端设备突然发出了光。神圣的天女兽的声音让黑鹰思考它在人类世界的生活。这让它再次痛苦，离开了。“是人吗？”惠儿的疑惑即将解开！
第32集事情的真相，黑暗野兽的秘密！(揭秘的过去！黑暗野兽的秘密)
黑暗兽想起惠儿是他的弟弟，于是质问基路兽。基路伯兽叫他恨惠儿，再一次让他心里充满了黑暗势力。在八大兽的指引下，高波兽、问答兽和陀将会合并，跟随八大兽去寻找慧儿。这时，惠儿遭到了黑鹰的突袭。黑鹰又变成了黑暗野兽，告诉惠尔他是惠尔的孪生兄弟木村辉一，然后又把战狼兽退化成黑鹰，打算杀死惠尔。拓也及时赶到救回惠姬，听到了惊人的真相。他鼓励惠尔去救易慧，但是惠尔打不过易慧。力拓也要单挑黑鹰，但处于劣势。看到努力的龙兽，慧儿终于下定决心进化成战狼兽，一心一意打败黑鹰兽，扫描两个黑暗的灵魂。然后拓也发现，易慧就是他回到现实世界时看到的那个人...
第33集:全新的黑暗斗士！黑狮兽和凯撒狮兽(全新黑暗战士！黑狮和狮子凯撒)
惠尔从易慧那里得知，他是从去世的祖母那里学来的，他的生母的工作非常辛苦。还有一个事实是，易慧从楼梯上摔下来，在数字世界中醒来，而不是乘坐地下交通工具。人们会合后，把运输兽带到玫瑰星外的城堡。但由于事情的真相令人惊讶，气氛十分沉闷。于是拓也等人告诉惠尔他们对兄弟姐妹的感受，巴塔也安慰易慧。这时，基路伯兽突然出现攻击人民。即使龙兽和战狼兽的杀手技能对它没有影响！基路伯兽于是作出“天罚”来贬低所有人。它告诉易慧，他心中的黑暗面非常强大，希望他能再次回到它，但易慧坚决拒绝。关键时刻，易慧的数字终端出现了，黑暗之魂的形态变化更大了。易慧进化成了一只黑狮兽，用极其强大的招式攻击凯路比兽。基路伯还没来得及喘口气，黑狮兽就进化成了凯撒的狮兽，用凶猛连续的攻击打败了基路伯兽。然而，数字编码并没有出现。原来只是柯比兽的二重身。为了拯救神圣的天女兽，人们继续向玫瑰星外的城堡进军。
第34集拯救神圣的天女兽(决战！玫瑰星神圣天女兽战役)
他们来到城堡的入口处，遭到了死亡之兽的攻击。除了黑狮，其他动物都被斗篷放进了水晶球。关键时刻，黑狮兽用敏锐的感知击碎水晶球，扫描死亡之兽。他们继续前进，来到一个有很多浮动数据的房间。突然，那些材料里出现了黑色的影子，向所有人伸出了黑色的爪子。突然响起了铃声，黑爪停止了移动。山羊兽出现了，把人们带到了神圣的天女兽被囚禁的地方。圣天女兽详细解释了导致数字世界的危机的过程。这时候，基鲁比兽出现了，说出了它的真正目的:夺取十斗士的灵魂，与它收集的大量信息融合，称霸数字世界！
第35集两个灵魂合二为一！托耶与惠尔的极端进化
基路伯兽打算收回十个战士的所有灵魂，火龙兽和战狼兽将他们带到城外战斗，以便其他野兽找到拯救神圣天女兽的方法。在城外，龙兽和战狼兽的实力远低于基路伯兽，它们被降级并拿走了数字终端设备。而春平想出了一个办法，打破反射光的墙来消除光的牢笼。就在他们准备营救神圣的天女兽时，基比兽回来了，带走了春平、友树和易慧的数字终端。就在它要拿走泉水的终端装置时，神圣的天女兽冲了出来，挡住了攻击。神圣的天女兽试图净化小天使兽但失败了，所以她不得不利用小天使兽对她的爱，把数字终端拿回来给孩子们。然后，用最后的力量，神圣的天女兽牺牲了自己，改变了拓也和惠尔的数字终端，促使他们整合了十个战士的灵魂。在十名战士灵魂的帮助下，他们终于成功的让陀爷和惠儿超越了灵魂，进化成了凯撒霸王龙和铠甲陆佳璐兽！
第36集飞向胜利！反对科比野兽之城
凯撒霸王龙和装甲加加陆璐击退了基路伯，但同时城堡倒塌。惠不小心从城堡里掉了下来，幸好及时救了他。变性后，全等人的灵魂回到了各自的数字终端。在全的鼓励下，打算感谢惠儿。但就在这个时候，冰柱突然从地下冒出来，袭击了所有人。原来是地下监狱逃出来的冰怪。这是一个比动物更难对付的可怕的数字野兽。它屏蔽了拓爷和惠儿的数字终端，使他们无法进化。仙兽的实力差远了。冰邪魔兽越来越折磨人，最后惹恼了凯撒狮兽。在他的大力进攻下，拓也和惠尔脱困，巴沙救出风神兽和雷光，最后集结四兽之力打败了冰邪魔兽。这时，天空中出现了基路伯兽的真实位置。
第37集决战！生命极限，拿回数字世界！
拓和圭司来到天空对抗凯路比兽。战斗很激烈，但由于托耶和惠姬的默契配合，基鲁比兽在强大的龙攻击中处于下风。正当他们以为已经打败了基路伯兽的时候，他们惊讶地发现，基路伯兽竟然有自我复原的能力。而基路伯比野兽更多地使用了数字世界收集的数据，这大大增加了他们的实力。暴龙凯撒和装甲加加陆璐兽被击败。后来，装甲陆璐兽发现了藏在柯比兽前额的信息是打败它的关键，于是他用自己的身体作为盾牌，挡住了柯比兽的攻击，让凯撒霸王龙靠近了柯比兽...铁甲陆璐兽应声倒地:“走，拓爷！”愤怒的拓也把战意烧成了火焰，打在了基路伯兽的额头上，扫视了一下。然而，就在大家欢庆胜利的时候，真正的阴谋开始浮出水面...
第42集保护数码蛋！失去生命的奇迹
大家来到创始村，看到很多数码蛋和天鹅兽守护着数码蛋，还帮助天鹅兽照顾婴儿。当他们得知原来负责运送婴儿的运输动物都躲起来了，就去劝他们再帮忙。劝说无效后，大家回到创始村，却发现皇家骑士已经来到村子里，打伤了天鹅兽。为了保护数码蛋，托爷和惠儿进化到拖延大家运送数码蛋的时间。但是皇家骑士很厉害，过了一会他们就倒了，退化了。这时十架战斗机全部出现，打败了皇家骑士，但是皇家骑士拿走了信息。
第45集扰乱数据战术！守护秋叶市场
大家先到了冰雪之国，包括秋叶市场，准备战斗，送走这里的数码兽。但是塞皮库兽从它的回旋镖中发现，许多数码兽在他们的路上拦住了皇家骑士。于是拓和圭司立刻进化，冲向战场，其他人则准备雪球发射器帮助拓和圭司。强大的数码兽根本不是皇家骑士的对手，接连被打败。拓和圭司在众人的帮助下与皇家骑士展开了激烈的战斗。在战斗中，人们被不小心袭击了。惠再一次纳闷，只有他没有受伤。杜纳斯兽说他只有灵魂，没有身体。此时，凯撒暴龙在与杜纳斯兽的战斗中占了上风，而剑帝不得不去帮忙。就在拓和圭司即将打败皇家骑士的时候，杜纳斯兽重组了零散的数据，吸收了数据，带着剑帝撤退了。
第46集数字世界被摧毁了！？光明会的黑暗统治
他们来到最后一个区域——神圣天使兽的宫殿，看到尼菲迪兽守卫着宫殿。宫殿里有数不清的书籍。为了赶在皇家骑士之前找到钥匙，大家分头翻书，度过了最后一个安静的夜晚。但是惠尔发现易慧总是处于恍惚状态...第二天，大家还是一无所获，皇家骑士这时赶到，说尼菲迪兽是关键。拓哉和惠尔进化到与皇家骑士决一死战，不分胜负。在战斗最激烈的时候，大蛇突然发出光芒，导致托耶和惠尔掉落，皇家骑士也成功吸收了最后一个区域的信息。六翼兽复活，数字世界消失！？当六翼兽出现在大家面前时，大家都很惊讶。六翼兽原来是一个天使模样的可爱小孩。六翼兽想要杀死所有人，幸好运输兽及时出现，把所有人送上了月球。
第47集击败皇家骑士后
大家来到金月亮，为数字世界的彻底淘汰而沮丧。这时我们发现原来的运输动物把数码蛋运到了月球上，另外两个天使重生了。于是大家又重新振作起来，决定打败六翼兽，夺回数字世界。这时，六翼兽以杀死孩子为最后条件，交出人类世界的钥匙，让皇家骑士去月球。凯撒霸王龙和盔甲加加·陆璐与皇家骑士展开决战，最终击败了皇家骑士。就在两兽准备扫描皇家骑士的时候，六翼兽出现了，扫描了皇家骑士，进化成了退化形态。在堕落极其恐怖的攻击下，托爷和惠儿被轻松击败，金月亮也被摧毁。
光明与黑暗第48集！易慧的遗愿
在三位大天使的帮助下，人们再次聚集在一起，讨论“光明与黑暗的结合”的事情。此时，他们发现从被摧毁的数字世界铺就了一条道路，而道路的尽头就是现实世界！为了阻止六翼兽进入现实世界，大家决定做最后一搏！然而，堕落形态的六翼兽的力量却出奇的强大，没过多久，除了易慧之外的所有人都堕落了。就在六翼兽准备杀死所有人的时候，易慧奋力拯救所有人，但是他被六翼兽可怕的攻击抓住了。易慧指出，并不是光兽能够将光明和黑暗结合在一起。被攻击后，只剩下灵魂...他把黑暗之魂给了惠尔，感谢他们所有人。最后，他说他实际上已经死了...六翼兽吸收了易慧的信息，愤怒的拓和惠尔聚集了所有的灵魂。“古魂进化”变成了二人融合，十大武者灵魂的力量被收集。
第49集战斗，金刚武兽，六翼兽到达人类世界！
吴金刚兽挑战光明兽的退化形态，但是对手真的很强，吴金刚兽处于劣势。不过后来，托爷和惠儿发挥了十大武者之魂的真正力量，破解了六翼兽的招式，用羽斩击败了六翼兽，并扫描了它的信息。奇怪的是，有两个数字蛋。白色的飘走后，黑色的突然变得巨大，变成了一条可怕的黑龙。原来是撒旦的形态，六翼兽！六翼兽撒旦立刻进入了通往现实世界的道路，不断向现实世界发送威胁信息。人群的进化跟着，发现他们到了涩谷的地下运输动物站。为了保护自己的世界和数字世界，大家都使出浑身解数去攻击，但是一点效果都没有。相反，他们被六翼兽撒旦的形态击中。
第50集超越时空！新的传奇开始了
所有人都被打回了地铁站，退化了。力拓也有意重新进化，被惠尔阻止。力拓也为自己的弱小实力感到惋惜。这时，奇迹出现了。火神兽的灵魂出现在力拓身后，并帮助它推下了前面的电梯，然后告诉力拓这是“我们的力量”。这时，十位战士也全部出现在大家面前，三位大天使也现身要求大家打败六翼兽。于是众人和十名武者一起把古魂进化成了金刚武兽，把刚刚冲进现实世界的六翼兽拉了回来。此时，金刚武神兽发现魔龙手中的大型黑暗球体，于是展开攻击，发现里面有一个蠕虫状的生物。就在这个时候，魔龙对金刚武神兽发动了最强大的攻击。金刚武神兽拼命冲进球体，一个拳虫般的生物将球体击得粉碎，魔龙拂袖而去，所有人都回到了数字世界。金刚武神兽最后用八雷神和一个羽斩杀死了魔龙。这时，虫类生物光明会的邪将冲向金刚武兽，被十名武者杀死。人们的数字终端发布数据，完全还原了数字世界。这个时候通道就要关闭了，大家就要告别十架战机和数字世界了。回到现实世界，人们想到了易慧，并立即赶往医院。伴随着惠儿的哭喊和他神圣的天女兽爱情的泪水，易慧奇迹般地醒了过来。拓也过了一个快乐的生日派对。友树、春平和全交了朋友。慧儿称她的继母为“妈妈”，易慧去见她的生母。经过这次冒险，大家都学到了很多东西。