忍者容器可分为五类:登船器、水容器、开启器、火器和隐藏武器。
攀登者是忍者的攀登装备，包括:绑梯、爬梯、折梯、钩钩、长飞、持棒、爬龙、寻梯、探铁、苦爬、爬钩、缠绕、爬梯。
水上船只包括:浮桥、沈桥、蒲筏、葛笼筏、水蜘蛛、水刮、鹈鹕、军船等。
开瓶器是开柜、拉门撬锁时使用的作案工具，包括:外问、弯刀、伸钥匙、插分钥匙、镊子、锥子、镰刀、拔锁、板撬、锯、拔钉、听铁等。
火器由火器及其使用方法组成，包括:水火绳配方、水铁炮配方、火盒、不熄宋明、打宋明法、笼火法、水下火法、风水火炬五法、火嘴法、熊火法、熟眠法、白杨火配方、用万年火、伊宋景明、入子火、生灭宋明、药燃法。
最常见的耐力装备有手里剑、忍者刀、护手甲和烟雾弹。这些都是忍者的基本装备，平时出门作案你可玩不起。
手里剑有三种，除了飞镖形的手里剑，还有手里剑和手里剑。手里剑像筷子，手里剑像没有柄的镰刀，普通手里剑根据形状不同分为杆状和扁平状。
忍刀也叫“忍刀”。刀的长度大多短于60厘米，刀身宽而重。以直刀为主(不同于武士刀)，执行任务时经常作为攀爬的辅助工具。此外，它的鞘可以在水蜘蛛手术中用作呼吸工具和窃听工具。
剑(刀)是日本武士荣誉的象征。武士通常佩戴两把剑(刀)，长的叫太刀，短的叫斜叉，都是高碳钢材质。薄刃可以用来缠绕手指，硬刃可以穿透装甲护盾。毫不夸张地说，它削铁如泥。据说二战后美军用步枪的枪管来招架匕首，但是步枪的枪管被匕首切断了。
忍者用的剑比匕首短，只有24寸，质量远不如武士刀，刀刃也钝很多。所以忍者的刀不是用来砍的，主要是用来刺的。如果忍者和武士都用自己的刀战斗，忍者显然处于劣势。如果忍者想赢，他们必须采取其他措施。
忍者刀的刀身是钝的，用手拿着不会流血。忍者的刀与其说是武器，不如说是多功能工具。如果短刀插在地上，刀的护环可以作为绊脚石；如果刀的护环挂得高，双手就可以安全地握住刀刃往上爬。就连忍者的剑鞘也有很多用途。通常刀鞘比刀刃略长，可以用来藏毒品或隐藏武器。剑鞘的尖端也可以去掉，这样剑鞘就变成了一个中空的扁管，忍者藏在水下的时候就当通气管用。在黑暗或暗室里，刀鞘又成了忍者的“探测器”。
两棍(博)是人类最原始的革命武器。它是革命性的，因为它的性能远远优于石头或粗加工的石镖和枪。石头一扔，他手里的武器就没了。棍棒很容易得到(随便伸出一根树枝就行)，有利于近战，可以投掷。鉴于此，忍者将棍棒视为第一武器，并发展出一系列使用棍棒的方法和技巧，称为“棍棒术”。
忍者使用的棍子一般直径2英寸，长约5英尺:由硬木制成的棍子是实心棍子。实心棒的力量很大，一旦被实心棒击中，肌腱断裂断裂在所难免。如果打中关键部位，风险就更大了。空心棒重量更轻，看起来也不那么危险，但空心棒更险恶。一般的对手绝对想不到，忍者的手腕会轻轻一抖，隐藏的武器，比如藏在空心杆里的铁弹、飞刀、短箭，就会扼住对方的咽喉或者正面正中。空心杆中还可以隐藏一条5-6英尺长的铁链，这样从杆中溢出的铁链就可以出其不意地绑住对手。
与棍子配套的武器是长约2英尺(约70厘米)的棍子(Jo)；它是一种极好的防御武器，可以用匕首或小刀对着对手砍、劈、刺或扔。
手里剑，铁蒺藜，类似于中国武林中的飞镖。可以在10码(约9米)范围内百发百中。古代忍者的“手里剑”一般都沾了毒。一般有八角形手里剑、六角形手里剑、十字形手里剑、三角形手里剑和万字形手里剑。这些手里剑在被投掷后，会在空中绕其几何中心旋转，因此轨迹稳定，近距离也能保证一定的精度。多边形的手里剑主要是用它锋利的角杀死敌人，所以杀伤力有限。所以忍者会在每个角落涂上剧毒的毒药(在《兽兵任伟·冯铁》中，冒充和尚的幕府特工用手里剑喂毒)，这是一种非常危险的武器。忍者一般在两种场合使用手里剑，一种是暗杀，一种是被多人围攻，急于脱身。使用时，一般可以一次扔四五枚，增加命中率。这些手里剑重量在40克到60克之间，一般忍者不会带几十个。毕竟身轻如燕是他们的优势。
古代女忍者很少使用“手里剑”，取而代之的是用带毒的发夹杀死敌人。
此外，还有一些奇形怪状的武器，大多脱胎于农具，如短月牙镰、挠钩、短刀等。一般来说，这些镰刀和钩子被绑在一根由马毛或人毛制成的绳子上；和“手里剑”差不多，只不过带绳子的钩子、镰刀、刀送出后可以回收。
四个弓箭。忍者使用的弓分为大弓和小弓两种。大弓用于远距离射击，小弓用于近距离射击。除了射箭之外，还可以发射火箭、鸣笛箭、开花箭(可以爆裂的箭)骚扰敌人。现代忍者有手枪，弓箭笨重不方便。只有一种弩吹至今仍在使用。弩的吹管里藏着一根钢针。用力一吹，钢针就会发射，但发射距离只有两三米。
五连环棍，类似于中国的流星锤，一般长约1米，也是防御性武器。它的重量和厚度各不相同，最小最轻的可以藏在袖子里作为隐藏武器使用。
其实忍者常用的武器远不止以上五种。一根竹筷，一根空心竹筒，一根绳子，几乎可以变成随手可得的武器。