Complex（情结），在心理学上的提出，为弗洛伊德在上世纪20年代左右提出的俄狄浦斯情结（Oedipuscomplex，恋母情结）。SisterComplex为俄狄浦斯情结的衍生，此一词产生的详细时间已经无从考证，但是此一词的出现和使用应当为上世纪60年代以后，甚至更后，故此之前，是不存在所有“妹控”相关的说法的。
妹控的出现和发展，均在动漫和游戏作品，及至后来的轻小说范围之内，大致分为以下几个阶段 最初，在ACGN界并不存在妹控相关的说法，在萌属性确立以前也没有妹萌的说法，取而代之的，是以“妹属性”作为相关作品的分支分类，进行描述表达。
妹妹的角色，在动漫作品中出现非常早，最早的如《铁臂阿童木》中阿童木的妹妹小兰，但是以“妹属性”作为看点的作品当是70年代以后。
这个时期的作品，在70年代的特摄《铁人老虎七号》的青木ジュン，开始有此表现，不过也并非是以完全的妹妹的身份登场，而特摄片跟现下的动漫也有所差距。1974年，池田理代子的少女漫画《青兰圆舞曲》（又译：《亲亲天使心》，《给哥哥的一封信》等，原文直译为“致哥哥大人”），将“妹对兄的敬仰爱慕之情”这一故事中常用的经典主题搬上了漫画作品。
到80年代中期，“妹属性”的作品开始激增，代表的如TV动画化的安达充的经典漫画作品《美雪美雪》的若松美雪（义妹），《天威勇士》的蕾娜·斯多鲁（OVA为义妹），《机动战士高达ZZ》莉娜·亚西塔（实妹）、艾露比·普露，成人动画的 《Cream Lemon》系列《媚·妹·Baby》中的亚美（义妹）等等。1988年，吉卜力工作室的一部并非以“妹属性”作为卖点的动画作品《萤火虫之墓》，描写二战后一对小小的兄妹艰难求生的悲伤故事，却感动和影响着更多的群众。 由于PC98、X68k、MMX等个人电脑走进日本家庭，以CG画面为卖点的erogame和galgame开始盘踞PC市场，及至后来甚至有专门用于游戏的PC主机PCE，这个时代的以“妹属性”作为卖点的游戏，开始层出不穷，其中最出名的如ELF的《同级生2》的鸣泽唯（义妹），《下级生》的南里爱（学妹）等
同时由于90年代初的沙织事件、萝莉控的负面新闻的影响，日本各种自主规制团体相继出现，及至98年的コ·コ·ロ…因包含儿童虐待等过激描写，被软伦禁止发行责令回收，自此以后，跟近亲相关的描写被全面禁止，直到2004年解禁为止，几乎没有实妹出现在相关游戏作品里面。但就在这样的时期里，仍然出现了很多优秀的妹系作品，这其中就包括田中罗密欧的名作《加奈妹妹》，藤堂加奈（义妹）的塑造让这款 作品成为泣系代表作，其后许多文艺作品、韩剧都有借鉴和抄袭其内容，而シスコン的理念也由此得到继承和发扬，同时这也是媒介第一款明确以“妹萌え”作为战略卖点的游戏作品。
90年代的动漫界则是百花齐放的局面，许多著名的动漫作品如《魔卡少女樱》《幽游白书》《宇宙骑士》《纯情房东俏房客》等，都进一步完善了妹属性的理念，妹萌え的要素逐渐开始形成。而这些作品在国内多数都有引进，对国内的妹控文化的基础也起到了积极作用。 “萌え”一词出现的具体时间，无法详细考证，但普遍认为是90年代后半开始在网络使用，到21世纪初萌文化定型。这其中，“妹萌え”对萌文化的形成起着主导作用，对后来的萌要素定义也起着至关重要的作用。其原因要归功于，无论是妹控史上还是萌文化史上的里程碑作品——《妹妹公主》。
《妹妹公主》严格来说是1999年3月开始，在《电击G'smagazine》上启动的读者参与企画，到2000年2月号为第一期，第一期***有妹妹9人，2000年3月号开始的第二期，根据读者的意见添加了3人，形成了12人的妹妹，12个妹妹根据出生星座性格各异，属性各不相同。因为读者也亲自参与到企画中，更彰显了其亲和力，很快红遍整个ACGN界，这之后在2001年和 2002年两度动画化，更是刮起了妹萌的狂潮，在当时中国国内的中高校也有不小的影响，由此以后，萌属性和萌文化在新世纪全面拉开序幕。
与此同时，《天使禁猎区》，又一对妹控影响深远的作品，如果说妹妹公主是从“妹萌え”的角度进行定义，天禁则是从“シスコン”的角度阐述含义。本作品截止2001年，漫画***计售出800万部。2000年，《天使禁猎区》发行了3卷OVA，由野岛健儿、川澄绫子、子安武人等著名声优演绎，反响强烈，当时国内媒体均有相关的宣传报道。
2004年，一部画风清新、表现自然的作品《恋风》，抛弃了传统俗套的禁忌思想的束缚，以更真实更亲和的视角，自然地描绘了佐伯耕四郎和小日向七夏这对实兄妹的纯洁真实的爱恋，从另一个角度揭示了妹控的真谛.
而此时的游戏界，却为妹控呈现出另一种局面。98年到04年间，虽然软伦严厉禁止近亲之间的描写，却依然诞生了不少被玩家称道的“妹ゲー”“妹モノ”（妹作、妹物），这其中就有星空めてお的名作《腐姬》，在妹萌之风盛行的时候造就了另一种在后来被称为“病娇”属性的狂气妹，要这样的妹也能包容的才算究极的妹控的说法也是当时本作的特点。
在04年软伦解禁之后的另外一部优秀作品《死妹人形》，则从生与死、亲情与欲望的角度向玩家表达了妹控的思想理念和作者的生死观。
而《初音岛》、《Gift》、《夜明前的琉璃色》、《月姬》等（设定均为义妹）一大批玩家熟知的作品将妹控引导至成熟的局面。 2006年-2008年，TV动画《CodeGeass叛逆的鲁鲁修》塑造了一个为妹妹改变世界的妹控，给广大观众，特别是国内的观众产生了巨大的影响。
2007年，由feng出品的美少女游戏《染红的街道》，实妹长濑凑深受玩家喜爱，在08年动画化后，赢得了很高的人气。
2008年末，由Sphere出品的18禁美少女游戏《缘之空》，造就了目前ACGN界的最高妹——春日野穹，优秀的人设和属性，让这位双子实妹在国内拥有最高的影响力，2010年动画化。
2010年，由轻小说改编的动画《我的妹妹不可能那么可爱》在海内海外大红大紫，将“妹萌え”在整个轻小说界彻底点燃，大批大批的以“妹萌え”为噱头的作品充斥轻小说甚至整个ACGN市场。实妹的设定也开始占据主要地位，根据mediamix（媒体组合、媒介效应，常见手段如各种文库将自己发行的作品进行电影化、动画化等），实妹线被许多读者关注也成为客观事实。 如上面所述的历史，在国内，“妹控”的叫法，产生于21世纪初，在“萝莉控”传到国内后不久就有相关说法，然而，妹控的概念还没有得到广泛普及和传播，所以在天使禁猎区OVA动画里，面对“シスコン”一词，就出现了不知道怎么翻译的情况。
在其后的一段时间内，“妹控”一词虽然时有出现，但也还没有被广大玩家接受，在《初音岛》的动画后，认知的人群开始逐渐增多。一直到《死神》的朽木白哉、《Code Geass 反叛的鲁路修》的鲁路修出现之后，才开始逐渐噪热。
到2008年《CodeGeass叛逆的鲁鲁修》R2完结之后，“妹控”的影响力已经全面普及。这之后的众多带有妹萌要素的相关作品（由于数量太多，不再一一列举）也加速了妹控文化的传播。
不过，国内的“妹控”文化，也并非仅靠日式ACGN的输入，在国产游戏中，《剑侠情缘》系列、《轩辕剑》系列、《仙剑奇侠传》系列、《天地劫》系列等作品中，均有以“妹属性”为看点的角色出现，其中最出名的应该是《仙剑奇侠传三》中被誉为“国产游戏第一妹”的龙葵。
而国内的动漫产业，由于在21世纪后毫无起色，故没能提供任何跟“妹控”相关的文化。而国产网络小说界跟ACGN相去甚远，不能理解妹萌文化的内涵，故跟“妹控”一词无缘。在轻小说改编的动画大热之后，国内也开始出现轻小说，但是因为缺乏整体规范，和专业权威的评定，暂时还不能成为有公信力的传播途径，而对妹控的理解不深、YY成分多于创新创作等也是目前最大的现实问题。
所以国内仅有游戏界曾输出“妹控”文化，而目今国内单机市场也早已衰落，除了日式ACGN的输入，国内刚刚起步的同人游戏界或能提供一些妹控文化的输出。振兴和发展国内动漫游戏轻小说等新文化界的多样化，还任重道远。另外，国内读者的望文生义，使得非核心妹控对这一词的理解和解读产生了误区，也是问题之一。