作为三人组中的老大，亲自在雨隐村成立了一个名为“萧”的私人组织。当时，虽然个人实力一般，却是、肖南、肖组织众多成员的精神领袖。尤其是牡丹，是《爱的年龄》的种子，多多少少对这个从小一起长大的领导有点好感。
至于长门，从小孤僻多嘴的长门生来就不讨女孩子喜欢，所以牡丹一直把长门当哥哥。可惜好景不长。弥彦的死彻底抹黑了长门，也让牡丹再也不敢去追求自己的幸福。由一手创办的萧组织，也在和肖南的领导下，成为中国第一个隐忍的反派组织。
长门和佩恩的关系
长门黑化后，他接受了取土的建议，以其他方式改变忍者世界。然而，在营救小南的过程中，长门使用了一个外星魔像，并被山脚胡椒鱼半藏雷管击中，行动不便。于是，长门利用圆眼的特殊能力，收集忍者的尸体，并将其改造成木偶，以代替长门的行动，其中弥彦就成了被长门控制的木偶。
圆眼的一个特点是可以远距离传送查克拉，长门利用这种能力控制佩恩六道。在剧情中我们可以发现，被改造成佩恩《六道》的个人身上有很多单簧管。事实上，这是接收长门和查克拉的工具，长门可以通过这些单簧管控制佩恩的行动。