故事发生在20世纪末西德的一所名叫修洛塔贝兹的寄宿制高中。一个冬天的早晨，尤里斯摩尔像往常那样来到学校，但是却听到了一个低年级学弟——托马·维尔那自杀的死讯，并收到了他写给自己的一封遗书。尤里随即开始变得惶恐不安起来：乖巧可爱的托马在学校非常的受欢迎，但是多马却唯独喜欢品学兼优，为人和蔼的学生会长尤里。可是半年前尤里曾经当着大家的面声色俱厉地甩过他，让他深受打击。尤里的同学兼室友奥斯卡看出了尤里的不安，出于本性的善意和对尤里的占有，不断的开导他，让他忘掉托马。面对托马的死尤里似乎完全不想向托马道歉，还在他的坟墓前把他的遗书撕了个粉碎。就在这时，激动的尤里突然看到墓地的栏杆后有一个熟悉的面庞——一个披着斗篷的卷发男孩，居然长的和刚刚死去的多马一模一样！……
原来这个卷发男孩名叫亚历克，来自科隆，为了和再婚的单身母亲赌气，离开了她并转到这所学校上学。但是因为长的和死去的托马非常像，学校里顿时闹得沸沸扬扬，让他非常的生气，和同学们闹了不小的矛盾。而尤里更甚，怀着对阴魂不散的托马的复杂感情，竟对亚历克说要杀掉他……
此时，因为亚历克与同学们的格格不入，和之前奥斯卡和尤里半夜在床上接吻的传闻传到了校长的耳朵里，校长让亚历克与奥斯卡调换，成为了尤里的室友，于是在这种紧张的氛围下，亚历克开始慢慢的进入了尤里的神秘世界，并发现，平时总是为人谦和，表现优秀的尤里根本不会爱任何人，在面对与托马相似的自己时却满是冷血的迁怒和置人于死地阴险。
随着亚历克与奥斯卡的***同影响，尤里另外一重不为人知的阴暗人格正在被一层层的剥开来。围绕着尤里脖子和后背的伤痕，对托马的爱的矢口否认和他曾经敬仰过的关系已决裂的学长，是什么让尤里产生了如此严重的阴暗心理，各种悬疑层层布设，耐人寻味。
《托马的心脏》（《天使心》）绘制于1974年，是萩尾望都的少年爱名作。其完结时间甚至比耽美鼻祖漫画《风与木之诗》的开篇还要早两年。但是与《风与木之诗》趋于露骨的描绘不同，萩尾望都绘制《托马的心脏》的手法却非常的清新——稳健的分镜，清纯的人物，没有任何限制级的场面。作为一部少年爱作品，《托马的心脏》拥有现代耽美漫画少有具备的无比唯美的台词语言和细腻微妙的心理描写，复杂悬念的人物关系，丰满的内心世界，一扫现代耽美漫画的空虚感，细致地描绘出寄宿男校少年间萌发的那种不含杂质又真切感人的同性爱意。
在剧情方面，对于无法走出心理阴影的尤里，托马、奥斯卡、亚历克这三个爱着他的男孩分别用自己的行动来表示对尤里的解救与帮助。爱一个人希望他能幸福快乐，希望他能坚强勇敢，甚至让“情敌”都站在了一起，为自己***同喜爱的尤里走出了阴霾而微笑着并肩紧靠。那种纯洁美好又深沉无私的少年爱超越了简单的肉欲获取，像一股清泉涤荡着人们的心灵。爱不是剥夺，不是索取，而是不求回报的温柔。 尤里斯摩尔·拜汉 拥有希腊血统的他有着一头美丽的黑发，一直努力成为优秀的人，以改变崇尚纯德国血统的外祖母对自己的偏见。在学校是学生会会长和舍监，成绩优异，为人谦和，深受大家的爱戴，有自己的亲卫队。
但是因为1年前在学校约克夫馆二楼发生的一个意外，让他身心俱裂，从此变得阴郁，并认为自己不会再爱上任何人，包括自己对托马的爱。因为人格分裂所以奥斯卡被派为他的室友监视他。尤里是个有着强烈宗教信仰的人，所以对自己的罪过感到不安，深陷自责中不可自拔。最后选择了神学院作为自己聊以慰藉的容身之所。
托马·维纳尔（台译：多马·维纳尔）
在故事开篇就从铁桥上摔下自杀而亡。在故事中多以想象，回忆，影子的神态出现。由于他和尤里的关系匪浅，所以他的死在尤里心中成为了深刻的烙印，这个阴魂不散的梦魇一直困扰着尤里，而故事也围绕着这种沉重背负的形成与解决展开来。 托马生前是个清秀乖巧，深受同学欢迎的漂亮男孩。深深的爱着尤里，经常在远处的树丛中默默地注视着他。可是当时尤里已经恶魔缠身，所以托马对尤里深沉的爱得不到回应，为了能活在尤里心中而选择了自我牺牲…（关于为什么要选择以死相赴，作者曾说这是“不需要理由的”；不过在读者间却有着众多的解读）
奥斯卡·莱哲
俊朗，不拘一格的奥斯卡，性格非常开朗随和。平时总有点玩世不恭的感觉。虽然很爱笑，但是内心因为母亲的死和父亲把自己抛在学校，五年来杳无音讯的事也有着阴影，一直被校长细心地照顾着。奥斯卡总是能体察别人的内心，不管是自己喜欢的尤里还是因为境遇和自己很像的亚历克，他都能随时为对方准备温暖的拥抱和温柔的吻。
他非常的喜欢尤里，耐心地打开他的心结，并一直默默等待对方的回应…也因此对学弟安蒂的从中搅乱让他觉得怒不可遏。最后当亚历克喜欢上尤里时也没有生气，两人一起帮助尤里走出阴影。
亚历克·佛留林克
任性的有着强烈恋母情结的转校生，父母在自己一岁时便离异。一开始不喜欢别人说他长的像托马，也不喜欢威胁自己的尤里。对善待自己的奥斯卡有好感，后来母亲不幸死于意外，在濒临绝望时尤里温柔的安慰和照顾让他深受感动，也从中看出了尤里善良的本质，慢慢的喜欢上了这一面的尤里，并希望能通过了解托马与尤里的关系，把尤里带出阴险冷漠的人格中。小时候因不满母亲频繁交男朋友而有过自残的行为，产生了被人抱紧时便会晕厥的后遗症。
安蒂
和托马同级，经常和托马在一起。两个人曾打赌谁能先引诱到尤里，而安蒂心中喜欢的人其实另有其人…这次打赌产生的后果是托马被尤里当众甩了，让托马深陷悲哀之中并在半年后选择了自杀。他并不喜欢尤里，散布了对尤里不好的谣言，只为让和欢的人注意到自己，可惜结果并非所想…。
海尔贝特
尤里的同班同学，不喜欢尤里，认为他的优秀总是导致别人的自卑。对亚历克也总是挑衅不断。
巴卡斯
体胖心宽的学长，经常举办高年生招待低年生的茶会，曾经与赛弗利特是同学，知道他的为人。
塞佛利特
嗜书如命，头脑非常好但是品行很糟糕的金发学长，在看过《文艺复兴与人性主义》一书后写了一手漂亮的论文。这种才华甚至连尤里也被他深深吸引了，尤里的悲剧也是从喜欢上了他而开始的…最后赛弗利特因为品行不端而被学校开除。
雷德威
有偷窃癖的低年生，知道托马的事，十分为托马鸣不平。后因偷窃被抓现行，与尤里对角时的镇定和坚决非常的精彩，一度让尤里失控。