为什么小恐龙阿贡的漫画和原版漫画不一样？

也不是完全不一样。大概100集左右的佐助出逃和三年后鸣人放学归来，动画补了一些内容，很难看。三年后又恢复了话题，开始和漫画联系起来。不过动画整体比漫画更细致，加入了新的内容，其中一些是岸本透露的，也有可能。比如火神庙的整段比漫画还多。