情节继续到353
冰山和弗兰基是汤姆的两个徒弟。政府逮捕了汤姆。原来，汤姆是一个船夫的一块，必须一起执行。生存的唯一条件是交出冥王星的设计。政府的阴谋是用强大的武器控制世界。罗杰看出了政府的用心，用自己的死换来了人民的反抗。海贼王时代的到来，是组织政府剧情的最好方式。这时，汤姆把布鲁托的设计交给了他最喜欢的徒弟弗兰基，并让冰山成为七水之都的市长，让弗兰基匿名，改变他的外貌，隐藏危险武器的设计，并告诉他要等待一个真正配得上他的好男人。
CP9的老板
这时CP9开始用各种手段折磨弗兰基，威胁他交出设计图。吴奋力反抗，告诉他们路飞一定会来救他们。CP9不屑的话语激怒了吴，终于他爆发了自己全部的潜力。但是，他仍然无法对付强大的六式CP9。在这关键时刻，梅丽尔伴随着船灵的召唤而物化，为吴挡住了的致命一击。路飞等人终于到了。
这时候CP9的老大终于出现了。他是七五海之一，唐吉诃德。他真正的目的是借助冥王的力量，消灭一切反对他的势力，建立自己的世界。路飞责无旁贷，干掉他们，真正的战斗开始了。
这时，吴向路飞发起了攻击。很显然，吴当时处于昏迷状态。原来唐是个能力者，是个傀儡果。只要他遇到人，就会被他控制。路飞VS唐，索隆VS猫(带鹰)，VS牛(带门果)，娜美VS女秘书，佛VS长鼻子。路飞无法对吴下手，但也激起了他的战意，但唐也会六式。
六种类型的弱点
鲁早就厌倦了那些没心没肺，无心插柳的海贼，于是站在路飞一边，说出了六式的软肋。原来，练习六种风格的人会在他们的身体里有一个位置，这是他们的命运。只要他们找到它，他们就能打破它。
索隆VS猫，速度差距让索隆无法攻击敌人。这时鹰眼的声音传来:真正的剑的精神不是用眼睛看，而是用心去感受。剑在你手里，不是剑，所以你能理解，上一层楼就赢的境界。乔巴VS黄牛，新研发的药丸会充分发挥他的变形，取得胜利，同时消耗过多的昏迷。
娜美VS女秘书，速度和力量有差距，但聪明的娜美灵活的头脑发现了敌人的致命之处。他利用贝的力量一举破敌，取得胜利。
佛VS鼻，作为礼物加入草帽海盗，他奋力拼搏，而此时我们的山治赶到了，一起，赢了。
橡胶果实进化
最后一战，面对吴的攻击，路飞无视，用愤怒的拳头攻击唐，但唐用同伴的身体挡住了路飞的攻击。愤怒的路飞终于醒悟了，橡皮果进化了。路飞的身体可以改变整个身体的密度，也就是分子级别的致密化，让拳头的力量可以达到之前的100倍，而卑鄙的唐却用武的身体挡剑，当时路飞无可奈何。
梅丽尔的重生
在船灵和佛祖的努力下，梅丽尔号终于修好了，佛祖把设计给了路飞，路飞破坏了大家都想要的设计。我想成为海贼王，但我不会成为强大的武器，我想成为自己的力量。
世界政府的愤怒
世界政府对这场战斗感到惊讶。两海落在路飞脚下，路飞悬赏提高到3亿，索隆2亿。其他人也相应提高了。世界政府不允许路飞存在，于是海军出动最强战力，三国海军将同时封锁草帽。
红狗的力量
有了岩浆之果，他可以把一切都变成岩浆，战斗无法进行，于是路飞等人向下一个目的地出发。这时候青芝出现了，但不是他的敌人。面对追到这里的红狗，他神化了周围的环境，告诉路飞这是他最后的恩惠。但在这种环境下，路飞无法发挥出自己的果能力，路飞轻松战胜了池智。临走时，青青说:
黑胡子的追求
在下一个目的地，路飞一行遇到了黑胡子，路飞经过一番苦战取得了胜利。同时了解到他们和海贼王有些关系，但具体情况还不清楚。
命运的告别
一群人在grand line的结尾遇到了红发，已经成为真正强者的路飞终于在见到偶像的时候泪流满面。草帽物归原主，红发此时去和白胡子战斗了，于是路飞加入了他们，他终于遇到了站在海贼王最高点的艾斯。
白胡子VS红头发
两人决定单独解决问题。两个人都不称职。红头发原来是世界上跑得最快的人，而白胡子是世界上最强壮的人。战斗持续了一天一夜。最后红发因为一手筋疲力尽。最后，他把草帽给了路飞，让路飞完成志愿，拿到一块。白胡子终于说出了真相。路飞是海贼王的孙子，遇到了grand line。
一块
最后，到达终点。这个时候世界政府为了阻止海盗分一杯羹，正在集结所有最强的战斗力量赶到这里，各路大海贼纷纷来到这里。面对白胡子，鹰眼和到达黄猿的五人，青芝，七武海，战斗打响，路飞VS白胡子，索隆VS鹰眼
世界第一剑客的诞生
面对鹰眼，此时的索伦已经不是当时的他了。丰富的战斗经验让他与鹰眼势均力敌。关键时刻，古伊娜的脸重新出现在他的脑海里，终极意义，被斩首的神，
最强者之间的决斗，D的意志。
海石制造的最强护甲和最强力量的组合就是白胡子。路飞的攻击对他无效。他一次次跌倒，一次次站起来，路飞体内的血液爆发。整个圣地都在颤抖。路飞举起半个岛，砸向白胡子。最强的力量也挡不住路飞的一击。
最强的动物果实VS风之果实
革命者龙也在此时赶到，加入了反政府组织路飞。面对黄猿，风之刃用所有的能力无情地砍向了动物系统。
火与冰
艾斯和清之战有着千丝万缕的联系，随着两人交织的光芒而消失。
什么是海贼王？路飞终于来到了终点，实现了爷爷的意愿，那就是自由。
这是所有海盗来庆祝新海贼王诞生的地方。
海军元帅和五星司机把布鲁托开到了这里。他等待的是一举歼灭所有反政府武装，冥王星的设计早已被他取而代之。
最强壮的果实，光明的果实
凭借着元帅的能力与太阳的力量，路飞决定单枪匹马去解决所有的饥饿问题。面对光的力量，路飞失败了。这时路飞用身体引着冥王星的主炮。随着一朵蘑菇云的出现，天空中只剩下了掉落的草帽。
剧终