灵魂之树的象征意义应该在造物主的层面上定义。潘多拉星球的居民就住在这棵大树上，就体现了这一点。
此外，大祭司通过与灵魂之树的交流最终救出了格蕾丝·奥古斯丁博士，这也说明了灵魂之树拥有赋予生命的力量。虽然没有成功，但在男主角杰克莎莉最终变身的时候再次得到了验证。
潘多拉星球上的大多数居民都相信灵魂之树的神力，他们非常乐意与自然界的万物交流。灵魂之树的奇迹也是电影结尾的精彩场景，创作者为了发泄对贪婪的人类的不满，控制了星球上的所有生物来围攻矿业公司的舰队。
这种主题在好莱坞大片中屡见不鲜，而电影《《阿凡达》》无疑通过震撼的画面再次给公众上了这样一堂意味深长的课。