1过山车谋杀案(gin & amp；伏特加出道让新缩小变成柯南)
2.董事长女儿被绑架(阿笠博士知道了柯南的身份，工藤新一改名为江户川·柯南，转到了迪丹小学。)
4大都会代号地图活动(少年侦探队成立)
13离奇杀亲案(宫野明美被警方抓获)
43江户川绑架柯南(工藤和他的妻子得知柯南的身份。)
48-49杀害外交官(服部平次出现，新一第一次回答)
52雾狗传奇谋杀案(柯南得知了杜松子酒和伏特加的代号)54电子游戏公司谋杀案(龙舌兰酒出现并被杀)。
57-58福尔摩斯迷谋杀案(服部哲发现柯南身份)
128一个涉黑组织抢劫十亿元(宫野明美被组织击毙)
129来自黑人组织(Ashara)的女子大学教授被害案出现。柯南第一次得知这种药的名字是APTX4869)
170-171黑暗中的死角(新出智明的父亲被继母杀害，在柯南的帮助下破案。新的正式亮相)
176-178与黑组织的永别(Ashen解释说APTX4869本来就是程序性细胞死亡。苦艾酒在这里首次亮相皮耶斯克与足原诚司的父母很熟悉，医学的发展始于足原诚司父亲的时代。GIN提到了“那位先生”，以后会经常出现。灰色原稿第一次恢复)
188-193危急生命复活(新二次复苏)
226-227格斗游戏的陷阱(朱迪出道遇到柯南，看到他在园方的帮助下破案。)
230-231神秘乘客(苦艾酒)又出现了，和足原一起冒充新车。赤井秀一出现了)
242元简直是灾难(海原爱提到Gin是左撇子。)
253-254这个大厅里犯罪爱情的故事4)新来的医生(贝尔摩假装)可能发现柯南在分析案情，用变声器。)
来自芝加哥的258-259人(詹姆斯·布莱克上台)
269-270犯罪的遗物(贝尔摩窃取了与毛利小五郎有关的档案，为了了解新案件，把美国联邦调查局的注意力转向毛利人，在影片的最后，赤井秀一监视了侦探所，贝尔摩的计划成功了)
271-272匆忙中隐藏了遗漏(朱迪在谈话中暗示柯南的身份已经暴露，提到了美国联邦调查局；；在该案中，兰回忆说，她曾见过一个“戴黑色针织帽的男人”()；在故事的结尾，贝尔摩给金发了一封电子邮件，提到了雪莉，并把飞镖送到了的交叉照片上，还有柯南和兰的照片。
277-278英语老师VS西方名侦探(柯南基本肯定克里斯是组织成员，并进一步怀疑朱迪=克里斯，和服部平次一起去朱迪的公寓探险，但未果。最后，一张柯南和兰的照片出现在朱迪浴室的镜子后面，照片上的字迹和贝尔摩的一模一样。柯南最后说，除了朱迪，另外两个可疑人物应该是赤井和信吾。)
286-288 NY事变(兰和辛屹救了苦艾酒的银发凶手。毛利兰第一次见到赤井秀一)
289-290迷失在严光森林(足原透露沼渊己一郎是该组织的成员)
307-308留下的无声见证(小五郎受托寻找失踪的电脑工程师板仓卓。从当事人的对话中，柯南得知他是龙舌兰酒的联系对象，龙舌兰酒是一个组织成员，在电子游戏一家公司的谋杀案中被杀。最后通过追查案情，柯南得到了组织的线索——板仓日记)
309-311接触黑组织(黑组织重现，柯南与GIN第一次正面交锋，柯南一度陷入危机，但最后不知是GIN放水还是疏忽大意，柯南侥幸逃脱。)
金钱买不到的友谊(阿笠博士提到，艾的父亲宫野厚司是著名的疯狂科学家，母亲艾琳娜是英国留学生，黑衣组织可能在搞一个起死回生的计划。)
335-336东都现象的秘密(赤井秀一跟着柯南和芦原，最后赤井对艾的照片说“太像了”，暗示他和艾早就认识)。
338-339四保时捷(医生)借了朱迪的车送足原回家，找了个新医生给感冒发烧的足原看病。味美思和朱迪都找到了足原诚司的住处)
340-341藏在厕所里的秘密(阿沙拉在她父亲朋友的设计办公室的厕所里发现了姐姐留下的录音磁带。贝尔莫尔在医生家里安装了一个窃听器，然后贝尔莫尔打电话给该组织成员卡尔·多瓦斯(Carl Dovas)寻求帮助，并且正在策划一项行动。)
343-344便利店陷阱(朱迪辞去了迪丹高中的老师，但兰和嘉登去朱迪家聚会时，偶然发现镜子后面有一张照片)。
345月圆之夜与黑组织面对面对质的二元推理(苦艾酒、朱迪等人身份暴露，苦艾酒放弃追雪莉，藏起柯南和艾躲避琴酒。与此同时，柯南听到了贝尔摩给这位先生发邮件时的击键声。)
346-347寻找屁股上的印记(海巴拉艾拒绝证人保护计划。)
361-362迪丹高中校园灵异(真正的新博士归来。)
374-375星星和香烟的代码(山村操给他奶奶发了一条信息，最初的按键音很像Boss的邮箱地址，是鸟取县)。
385-387斯特拉迪瓦里小提琴的不协和音(柯南知道老板的邮箱，给七个孩子)
394-396怪屋奇遇(柯南已经知道了boss的手机号)
425黑撞击！黑人组织的魔爪伸出的那一刻(基尔、基安蒂酒、科恩出道。黑人组织的谋杀计划被美国联邦调查局和柯南阻止，基尔受伤昏迷，被美国联邦调查局俘虏。)
429-430两个不能回头的人(本堂瑛祐出现了。)
462-465黑色组织的影子(柯南注意到贝尔摩去水无怜奈的证人家询问事故，本堂瑛祐在参观毛利侦探所时有意无意地把话题引到水无怜奈，希望柯南等人调查)。
484-485黑照片的去向(柯南和海原爱调查过，得到了本堂瑛祐父亲的照片)。
491-504红与黑的碰撞(小兰的新同学颖友总是给柯南不好的感觉。他到处寻找他的妹妹英海。瀛海看起来和水无怜奈一模一样，但是她的血型不对。黑衣组织正在到处寻找水无怜奈。水无怜奈得到了美国联邦调查局的帮助，假装失去了知觉。被本堂的应友攻击后，不得不说出自己的真实身份。原来，水无怜奈就是这个大厅的瀛海，取代他被谋杀的父亲成为中央情报局的卧底。水无怜奈答应赤井秀一重返组织，但他接到的第一个任务是杀死赤井秀一。赤井秀一有牺牲的嫌疑。)
507-508卡拉ok包房一角(本堂瑛祐知道柯南的身份，打算离开日本。柯南对赤井秀一之死的态度很奇怪。)
509红白黄侦探组F/C(水无怜奈把信息泄露给朱迪，组织了一个强大的波旁侦探。冲矢昴出现并搬进了工藤新一的房子。)
510柯南VS双暗码之谜
511推理对抗！新一对冲矢昴(柯南发现冲矢昴推理能力强，是左撇子，爱喝波本威士忌。)
521杀人犯工藤新一
心怡和小兰眼泪的真实身份
523我真正想问的(新的第三次恢复)
542-543鱼消失的角岩(海原爱再一次感受到了冲矢昴的压迫感。)
563-564侦探兵团VS强盗兵团(一个脸上有烧伤疤痕，疑似赤井秀一的人出现，右眼有明显的烧伤疤痕。最终，该男子拿起劫匪的手枪，在柯南被劫匪劫持的紧张时刻向其开枪。)
578召唤危机的红色前兆
579黑和13的暗示
580近似值的黑色时间限制
581摇曳的红色目标(疑似赤井秀一的人再次出现，与此同时，商场里的朱迪老师收到了“这里危险，快跑”的纸条。这时，冲矢昴也在商场里，他第一次见到了刀疤男。他说的话很有意义。刀疤男用别人的手机把商场里发生的案件推理发给了毛利小五郎。金、基安蒂酒等人试图测试赤井秀一是否还活着，以此来证明基尔是否是卧底，但柯南巧妙地引走了他。与此同时，常也在寻找刀疤男，但刀疤男在瞄准时对着眼前的景象诡异地一笑。)
616-621福尔摩斯无声录(新一第四回恢复，向兰告白。工藤和他的妻子知道海原爱是APTX4869的开发者。)
622-623紧急情况252(阿笠博士被绑架，影片结尾，海原爱再次表达了对冲矢昴的强烈怀疑。)
646-647幽灵酒店的推理对抗(世良真纯出道)
651柯南VS平吉侦探推理对决(朱迪和卡姆迈耶在看到世良的照片后说世良“像某个人”，而詹姆斯第一眼看到世良就是个女生。)
656-657医生视频网站(石亮看到医生视频里印着海原爱的影子，从严光和元泰打听“医生家的小姑娘”(也就是海原爱)和她的邻居(也就是)的情况。他对着冲矢昴的窗户说，“我还以为是谁刚搬进来，现在看来，真是杞人忧天……”最后，世良把视频中灰色平原的意外图像从电脑中删除了。)
667-668年婚礼前夕(安石头出场，成为小五郎弟子。)
671-674侦探的噩梦(冲矢昴脱口而出“不要露出那种表情”，这似乎让阿沙拉感到相当在意。苦艾酒打电话给波旁，安子头、冲矢昴和世良真纯同时接到电话)。
675-676一点都不原谅(足原诚司回忆了冲矢的那句“不要露出那种表情”，和曾经组织过卧底的诸兴达(也就是赤井秀一)用的词很像。世良真纯似乎很早就知道了工藤新一，对海原爱表现出了兴趣，并关注了伤疤。
681-683以生命为赌注的爱播(最后安石头为高木的指导警官伊达扫墓，暗示两人是朋友)
684-685泡沫、蒸汽和香烟(足原的动作和两人的对话表明千叶的脖子里藏着一个秘密)
690-691未解事件(行为可疑，世良在房间里发现了关于女人的线索，最后世良含泪回头看了柯南和兰一眼，说:“果然，我是个坏孩子。”)
699-700接近阿沙拉的秘密的黑影(侦探队被困，阿沙拉要服用解药才能恢复，被广彦拍下，被世良、安石、冲矢看到。)
701-704黑暗快车(世良真纯，安士通身份暴露。黑组又出来了，目标是雪莉。海东·黑场受柯南委托，假扮成宫野志保，进入最后一节车厢。马车掉下后，贝尔莫尔引爆炸药，基德乘滑翔翼逃脱。贝尔摩发现雪莉没死后，没有向组织汇报。安世头对阿凯的死因有怀疑，准备重新调查。冲矢昴展示了和赤井秀一一样的眼睛。)
705密室中的柯南(波旁继续以救护员的身份出现)
706在波旁面前解谜(波旁发现柯南用了腕表麻醉针，对其产生了兴趣，并怀疑“沉睡的小五郎”与柯南的联系)。