之后还有很多情节，所以写一些大概的趋势，从佐助和迪达拉的战斗开始。
佐助用属性赢DDL，DDL最后用绝招自爆，但是ZZ通灵万寿挡了伤害。万寿死了，DDL死了，佐助活了下来。事后，阿飞向肖汇报了情况。
杀死DDL的佐助后继续寻找臭鼬，在一个地方找到了臭鼬的查克拉。佐助一个人去的，看到臭鼬，就攻击它。臭鼬被佐助识破，最后说:我在内比都祠堂(算是基地)等你，然后变成了乌鸦。
镜头切换到自来也。为了调查萧的情报，决定前往萧组织的总基地村，临行前向告别，留下“幸福不是男人所期望的！”这句话(事实上，纲手已经默认，如果自来也能活着回来，他就嫁给他)。最后，自来也提醒纲手要小心根人。
自来也来到于人村，伪装成一家商店的老板，从于人村抓了两个人，从佩恩那里得到了信息。据说佩恩有“神”的能力！自来也继续偷偷溜进来。在调查过程中，佩恩不幸被发现，战斗一触即发。佩恩，VS萧组织的老大！在战斗中，自来也发现佩恩长得像他的一个名叫弥彦的徒弟，然后勾起了回忆。原来(佩恩饰)、肖南(萧组织成员)和都是的徒弟。最初，在第二次耐力世界大战中，自来也、纲手和大蛇丸挑战了于人村的老板半藏。双方有赢有输，一战成名，最后被称为传说中的三忍。战后，自来也救了三个人，收他们为徒。后来，自来也走后，半藏和团藏联手攻打弥彦的村子，半藏逮捕了小南。为了救长门和小南，弥彦用自己的命换来了小南的命，但半藏一开始就不想放过他们，弥彦白白牺牲了。这时，长门大发雷霆，唤醒了身体的内在力量。欢颜据说是忍者界的“六仙”。...
父母去世，亲人去世，朋友去世，过去的种种事情冲击着长门的心。这是什么世道？他把他们的死归咎于这个世界。世界上只要有人，就会有战争，有战争就会有牺牲。最后，长门准备向全世界复仇。以毁灭世界为目的加入萧组织，改名佩恩。在自来也和佩恩的战斗中，佩恩召唤了两个佩恩，也就是三双1。自来也用各种忍耐力与之对抗，最后变成了仙女模式，召唤文泰的父母，使用最强幻术——牢不可破，杀死了三个佩恩。就在自来也以为佩恩已经死了的时候，另一个佩恩从后面过来，射下了自来也的手臂。三个刚刚被杀的佩恩不知怎么又活了过来。这时候，自来也终于知道了佩恩的秘密，以及为什么佩恩的能力被称为神的能力。自来也用仅存的力量创造了一个结界来吸引佩恩。一个叫佩恩的人被自来也困住并杀死了。另一个佩恩斯来了，用一把可以影响另一个脉轮的刀杀死了自来也。当自来也去世时，他在文泰的父亲后面写了几个数字，并把这些信息发给了纲手。
自来也死的时候没有逃跑(以他的能力，逃跑是绝对没有问题的)，但是为了调查佩恩的能力，他牺牲了自己，把命押在了下一代身上。一个新的时代将会到来！英雄自来也大张旗鼓地结束了自己的生命，他用自己的生命诠释了自己的隐忍！
而佐助在内广基地找到了雪貂，就像恋人的话。一打起来就互相用幻术，从来不看战斗。雪貂利用了月读，佐助用血轮之眼破解了雪貂的月读。战斗中，雪貂用力压下，使用了天象，佐助则使用大蛇丸的身双术破解。战斗还在继续，两个人的查克拉所剩无几。这个时候，只是佐助把它封在了自己的身体里。一旦佐助的查克拉克制不住大蛇丸，大蛇丸就可以出来了。被复仇之心吞噬的佐助为了杀死雪貂，使用了大蛇丸的力量，大蛇丸被解封，使用了八歧大蛇的手法。雪貂似乎有了长久之计，用上了雪貂最强的忍耐力:SUSANOO再次封印大蛇丸。佐助倒下的时候，臭鼬对佐助说了一句“这是最后一次了，兄弟”就倒在了血泊中。佐助杀了雪貂应该高兴还是难过？昏迷的佐助被庞克带走了，雪貂的尸体也被带走了。
佐助醒来后，阿飞告诉佐助一些关于木叶的历史。原来，内广氏族的灭亡是团藏和木叶的首领，他命令雪貂和内广马达拉(内广的创始人)消灭内广氏族。当时，霍颖的三代人都不在村子里，所以没有人能阻止悲剧的发生。其实在和佐助的战斗中，臭鼬已经识破了佐助的所有伎俩。他只想耗尽佐助的查克拉，逼出大蛇丸，把大蛇丸和佐助的身体分开。(其实佐助的实力远不如雪貂。)听到这个消息，佐助伤心欲绝，在无尽的悲痛和悔恨中，他实现了比万花筒更高更上的瞳孔手术(眼睛是六角形的)。然后，蛇队也归顺了黎明。
自来也去世的消息传到了木叶。当她听到这个消息时，每个人都哑口无言，而纲手却伤心欲绝，因为她生命中最重要的人去世了。鸣人在老师的安慰下，悲痛欲绝，决心复仇，但力量不够。文夫人的父母带鸣人去了自来也老师以前练习的地方，以“神仙模式”练习。
事实上，阿飞是萧的上司。他派佩恩去木叶抓九尾。佩恩在身体后补充道，欣然，牡丹。当他到达木叶时，佩恩和六个人大吵大闹。木叶损失惨重，卡卡西在与天道佩恩的对抗中死去！穆特也被佩恩杀死了。纲手引导蛞蝓治疗所有被木叶伤害、耗尽脉轮和晕倒的人。在所有人都对佩恩的力量绝望的时候，鸣人回到木叶，以一敌六秒干掉了五个佩恩，最后逼退了八尾与佩恩一较高下。鸣人不愿意使用九尾的力量。醒来后，他在不朽模式下打败了佩恩，找到了佩恩的本体——长门、长门和名人都是自来也的徒弟，但他们对世界的看法完全不同。长门被鸣人的意志所感动，认为鸣人是继承了自来也意志的人。他用一生复活了他杀死的人，卡卡西和穆特也复活了，佩恩死了。
此时佐助正在执行阿飞下达的抓八尾任务。佐助、祥林、水月和重吾遇到了八尾。经过战斗，他们成功抓到了八尾(但其实是假的，用的是身双)。八尾纵队部队也受了重伤。他是任磊村雷英的弟弟。当他听说他的弟弟被肖带走时，他非常生气。纲手的霍颖之位被团藏篡夺是因为他晕了。
木叶村、村、沙仁村、五仁村和岩仁村都受到了萧的威胁，于是他们计划召集五片开会，五片聚在一起商量对付萧的办法。这时佐助的队伍也来到了这里，准备伏击小组，鸣人也来到这里找佐助。
战争即将开始。....