《名侦探柯南:黑暗追踪者》是根据日本漫画家青山刚昌创作的漫画《名侦探柯南》改编的一系列动画电影的13作品。影片在探讨连环杀人案真相的同时，讲述了柯南的身份秘密。
以东京为中心发生了六起连环杀人案。除了蒋木木警察厅，还有县刑警和小五郎等人出席了调查会议。令柯南惊讶的是，他发现会上一名警察上了一辆跑车。“是那辆车吗...杜松子酒？”其中一个“黑组织”潜入调查会，乘金的车逃走。
“黑色组织”是否对连环杀人案负责？危机迫在眉睫！如果金知道工藤新一还活着，不仅会危及新一，也会危及柯南身边的人。意识到事情危险性的柯南开始独自调查。