准确的说，从第一集开始，游戏就把羽毛栗子球给了第十代，也就是说最后一集新一代决斗王的战斗注定要开始了。而且最后的结果也看到了。第十代Neos输给了Sky Dragon。
故事介绍
决斗者的王国
一个神秘的视频，千年神器中千年之眼的主人贝卡斯·J·克罗佛多在视频中用黑暗决斗挑战武藤游戏，但是武藤游戏因为时间的终结而战败，武藤双六的灵魂被千年之眼的力量封印在灵魂封印卡中(漫画版是贝卡斯发给游戏的视频)。
武藤游戏为了拯救灵魂被囚禁的爷爷，前往决斗者的王国寻找贝卡斯，与彼此信任的朋友和心中的另一个人并肩作战。