“中世纪”这个词是在15世纪晚期被人文主义者使用的。这一时期的欧洲没有一个强有力的政权来统治。封建割据带来战乱频仍，导致科技和生产力发展停滞，人民生活在无望的痛苦中。因此，中世纪或中世纪早期在欧美一般被称为“黑暗时代”。传统上认为是欧洲文明史上发展相对缓慢的时期。
中世纪的教会非常强大。教皇为了维护自己的独立地位，建立了教皇国，并伪造了文件《君士坦丁的礼物》，声称君士坦丁大帝将罗马、拉特兰宫等地送给了教皇。教会非常严格，控制着西欧的文化和教育。牧师不能结婚，提倡禁欲，要求人们为了死后上天堂，把一切都献给上帝。另一方面，神职人员的买卖非常严重。提倡三位一体、原罪论等经院哲学，严格控制科学思想的传播，设立宗教裁判所惩罚异端，学校教育也是为神学服务的。在教皇格里高利一世时期(590 ~604年)，古罗马图书馆也遭到纵火。
中世纪有两次大流行。
第一个疫情
第一次疫情被称为查士丁尼瘟疫，它发生了两次，从540年到590年。死亡人数没有明确的统计，但一般认为这次疫情在地中海东部造成约2500万人死亡。这场瘟疫削弱了拜占庭帝国，查士丁尼试图恢复罗马帝国的光荣梦想也失败了。
第二个疫情
黑死病从1346年到1350年大规模袭击欧洲，导致欧洲人口锐减，死亡率高达30%。黑死病被认为是蒙古人带来的。大约1347年，克里米亚和墨西拿(西西里岛)之间的热那亚商船带来了受感染的黑鼠或跳蚤，很快传播到热那亚和威尼斯，疫情于1348年传播到法国、西班牙和英国，然后于1348+0350年向东传播到德国和斯堪的纳维亚。据估计，欧洲约有2500万人死亡，而欧洲、亚洲和非洲约有5500万至7500万人死亡。当时找不到治疗药物，只能用隔离的方法阻止疫情扩散。此后，黑死病在15、16世纪多次入侵欧洲。但死亡率和严重程度逐渐下降。有人认为黑死病严重打击了欧洲的传统社会结构，削弱了封建和教会势力，间接促成了后来的文艺复兴和宗教改革。
中世纪的科技发展几乎停滞，不把范围扩大到15世纪几乎找不到科学家。
1.哥白尼:意大利著名天文学家，著有《天体运行论》，被教会残酷迫害。1543死于5月20日。
2.坚持哥白尼“日心说”的布鲁诺首先被关进监狱。他听到判决书后，轻蔑地对杀人不眨眼的刽子手们说:“你们读判决书时的恐惧，比我走进火场时的恐惧要大得多。”后来于2月1600在罗马花卉广场被烧死。
3.塞巴斯蒂安(375-415)是历史上第一位已知的女数学家。吉本在《罗马帝国衰亡史》中说:“她被从车上拉下来，脱光衣服，拖到教堂，对一群野蛮而没有人性的狂热分子使用锋利的牡蛎？她从骨头上剥下她的肉，砍掉她的手和脚，扔进火里。
4.伽利略:意大利科学家。为了捍卫科学真理，他在1633年受到宗教裁判所的迫害，在1642年不幸去世，当时双目失明。
希腊女数学家希帕西亚，坚持传播科学知识，被暴民拷打，投入火中。
6.科学家帕利西因为说化石是动物的遗骸而不是“造物主的游戏”，被宗教裁判所判处死刑。
7.塞尔维特在《基督教信仰的复兴》一书中提出了血液循环的观点，被烤了两个多小时就死了；
8.比利时生理学家维萨里乌斯，因发表解剖学著作《人体结构》于1564年被迫前往圣地——耶路撒冷忏悔，在回家的路上被杀害；
9.阿毛里:巴黎大学教授，1210年，因宣扬泛神论死后受审，坟墓被挖，十个弟子全部被处死。
10.Cirkel:巴黎大学教授因在物理研究中发表所谓异端言论被教会殴打致死。
重大科学发现:日心说。虽然当时并不认可。