赤井秀一原本留着像杜松子酒一样的长发,在新一成为柯南的两年前,他以“竹兴达”的假名潜入了黑暗组织。在此期间,他一直与该组织成员宫野明美(广田亚米饰)保持联系(从漫画中可以看出这种联系疑似出于某种目的),并与该组织科学家的姐姐宫野志保(海原爱饰)发生关系(档案599,单行本V58,档案2赤井秀一的过去)。赤井秀一依靠自己的能力在组织中取得了很高的地位,得到了“黑麦(黑麦威士忌)”的组织代号,已经到了仅次于杜松子酒的位置,他将可以见到组织的老板。由于一名美国联邦调查局特工安德烈·卡姆迈耶的失误,赤井秀一的身份暴露了,他最终设法逃离了该组织,回到了美国。在美国,他还调查了苦艾酒化妆纽约杀人案(TV288工藤新一纽约事件(解决))。由于赤井秀一的能力如此强大,他被组织视为可以威胁组织生死的“银弹”。
明美逃离后一直试图脱离组织,与秀吉团聚。在一次任务前,明美给一休发了一条短信:君,你离开组织后,真的能以男朋友的身份和我交往吗?赞美诗可惜在那次事件中,明美最终被杜松子灭口(TV128黑组织1亿元抢劫事件)。赤井秀一为了报复她的“情人”金,剪掉了自己的长发,并很快来到日本继续调查该组织的案件。
赤井秀一死在了水无怜奈(本馆瀛海)的枪下(TV 503)(file . 608-609,Vol60 File.1 TV504),但有相当一部分人认为他还活着。后来,一个奇怪的大学生冲矢昴(档案. 622-624)出现了,大多数人怀疑他是赤井秀一。关于赤井秀一的推理能力,大多数人认为应该和金酒差不多。