首先，如果男上司和女下属的关系是生活中相对平等的地位，但如果是在职场上，双方的关系就是管理和被管理的关系，所以很难保证没有徇私。如果这种关系继续发展下去，可能会让人觉得男上司有偏袒女下属处理公务的嫌疑，会引起其他同事的怀疑和议论，不利于双方的工作。
其次，如果自己的单位面临裁员危机，可能存在双方都被裁的危险。也就是说，在同一个单位，如果一方出现问题，另一方也会受到影响。如果是这样的话，那么两个人都有可能面临失业，不利于两人关系的长期稳定发展。
再次，如果两个人在同一个单位工作，会遵循相同的作息制度和作息时间。如果是这样的话，将来两个人如果真的走上了婚姻的殿堂，那么其中一个肯定会为家庭做出牺牲，当然他的婆婆也可以帮忙照顾家庭。但是现在婆媳矛盾很严重，一有矛盾就可能导致家庭关系。
最后，因为办公室恋情，可能会有不公平待遇。即使两个人通过正规手段胜出，由于名额有限，对方也会失去机会。