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3.M13 DVD于13年10月2日在日本上映，国内字幕组需要翻译，大概两三天就能在网上看到。
这里有个剧透:
故事一开始，柯南的身份被杜松子酒和伏特加抓住，小兰即将被杀...原来是一场梦。
小五郎受邀参加警视厅举办的案件侦破会议，发现里面的警察都是熟悉的面孔...
警视厅的松本，静冈的横河(哥哥)，神奈川的横河(弟弟)，群马的山村(爆！他居然升得比佐藤还快！真的像柯南想的那样“群马县警察局，可以吗？”)、
长野的大和警署，埼玉的东野警署(有人觉得他是个有危险气息的新人，有点英国气质~)，京都的绫路警署，长野的上原刑事。
当然，东京永远会有白鸟、佐藤、高木和千叶。
需要解决的案件是东京及周边省县的系列杀人案。死者的身份看不出有什么共同点，但他们死后，都被带走了一个随身物品，却留下了一张麻将牌。
期间柯南说千叶好像瘦了，千叶很开心的谈起这件事。而小五郎说白鸟好像长胖了，白鸟尴尬道:“别开玩笑了好吗？我也是一周去两次健身房！”
中途推理，叔叔又做出了那个可笑的推论...牧牧说如果工藤在这里就好了...高木说了很多话，说在黑骑士的场景里，出现了一个新的...正好，它被一个间谍听到了...
检测会后，山村随口唱了一首《七个男孩》。原因是有人在厕所用手机按了类似的声音。柯南大吃一惊，追了出去。一个人走进黑色保时捷356A。
柯南由此确定，在调查会的众多参与者中，夹杂着易装大师贝尔莫尔。
后来，柯南在商场追捕嫌犯时，发现被劫持为人质的人其实是贝尔摩假装的，(原因是她看到口袋里有手枪形状的东西...)抢救结束后，问她为什么。
原来其中一名受害者是和组织内的NOC名单一起被带走的。
柯南看到贝尔摩，断定潜伏在警察中间的人是别人装的，但被替换的人是谁呢？(是个快死的老板！松本...)
此时，黑组织神秘成员爱尔兰人正如火如荼地调查柯南的身份，得出柯南=新一的结论。(高木在他面前讲了很多他曾经见过新一的事情。于是爱尔兰人在黑骑士面具上用了新一的指纹，和柯南在美术课上捏的海豚上的指纹有98%的相似度。
之后上演了一出狙击戏，黑组阻止警察去最后一个受害者家。当基安蒂酒举枪对准高木说“乖孩子”时，科恩举枪对准佐藤说“好女人”。
两个人同时拍，被吓死真的很可惜...(我家个子高！不要让任何事情发生。当然...最好不要和他家的佐藤出事。)还好只是轮子被吹掉了。组织没那么蠢。它直接面对警察。
佐藤也觉得是狙击手。当然，他告诉了高木，但是我单纯的高木说她应该是多心了。但佐藤仍然怀疑警队中有间谍(敏感机警的女性)。
在医生和萧艾与侦探队联系后，佐藤和高木成功救出了被转移并囚禁了10天的人。
下半场通过观星，小五郎也成功演绎了一些脉络。
故事的最后，柯南在服部哲和阿莎拉的帮助下，推理出连环杀人案的凶手会出现在东京铁塔，并赶去见凶手和假扮警察的爱尔兰人。对方拿到了通缉令。
小兰去铁塔是因为在电视视频里看到了柯南...为了保护柯南不受艾瑞斯的伤害，她想用脚踢他。谁知道艾瑞斯是空手道大师...兰被撞倒了...(个人认为，小兰被打倒是因为她踢了他的面具，当时他的脸看起来就像一个破了脸的僵尸...)正当他要解决兰的时候，兰突然想起了TV00655。
为了保护小兰，柯南带着变声器和守望灯把艾里斯带到了东京塔的顶端。从他的话中得知自己的身份被揭开了，但艾瑞斯并不想杀他，而是想带柯南去看《成年人》，用金恩的重大过失扳倒金恩，因为金恩轻易杀死了被艾瑞斯尊为父亲的皮斯科。
所以他没有说出柯南的真实身份~ ~ ~然后就开始辱骂柯南...比叔叔虐待他更可怕...扔来扔去...就在他试图解决柯南的时候，金等人乘直升机前来验证爱尔兰人是否拿到了名单。
但就在爱尔兰人拿出清单上的SD卡，并在金的要求下继续前进时，基安蒂酒射穿了SD卡和他的胸部...
柯南想拯救爱尔兰人，然后爱尔兰人明白了贝尔摩为什么要报道柯南。他说，“工藤新一，你只需要不断追求真理！”然后他为了保护柯南被杀了...
之后金就疯了，开始用飞机上的机枪疯狂扫射。(估计是看看旁边有没有人听到...)直升机的探照灯不停地照着躲着的柯南，机枪一次又一次地从他身边扫过，但也只是打中。
而Gin和飞机里的其他三个人甚至都没有看到柯南。
就在柯南走投无路的时候(他的真面目很快被识破)，他巧妙地使用了医生的新发明(加固伸缩带)，不仅脱险，还打掉了金的飞机。(多么强大的发明)
很多警察赶到，抢救成功~ ~ ~大团圆结局！
看到飞机坠毁爆炸，骑着摩托车在周围转悠的贝尔莫尔忍不住笑了:“真是银弹啊！”"
后来柯南得到消息，直升机残骸里没有人体...也就是说他肯定是在坠落前跳伞脱离直升机的~ ~ ~