柯南的主要情节
漫画VOL34F11-VOL35F4，电视286-288工藤新一纽约事件。
作为女明星的莎朗？温雅德和工藤有希子一起向魔术师黑羽盗一(海东黑羽快斗的父亲和老海东黑羽)学习，因此他们互相认识。
据推测，基德父子应该也是反黑组织的一员，可能扮演了关键角色。
漫画Vol 42f5-10与TV345直面黑组织。
沙龙的真实身份是黑人组织杀手。她杀死了朱迪的父亲，一名一直在调查该组织的美国联邦调查局特工，并放火焚烧了朱迪的家以销毁尸体。只有年幼的朱迪为了给父亲买橙汁活了下来，被父亲的同事用“证人保护计划”保护起来。
漫画VOL58F10，电视502-503红与黑的碰撞
在黑人组织中卧底的美国联邦调查局·赤井秀一(代号黑麦威士忌)和美国联邦调查局特工准备抓住这个团伙，但因为特工安德鲁？当卡梅尔的错误暴露后，赤井秀一不得不逃离组织，这为杀害赤井的女友宫野明美埋下了伏笔。
漫画VOL34F11-VOL35F4，电视286-288工藤新一纽约事件。
心怡和兰去纽约玩，招待她们看的歌剧《金苹果》。他们在剧院门口相遇并认识了沙龙，但沙龙在歌剧开始前借口有事离开了。歌剧中有一场谋杀。新一帮忙破案后，广子留下声明，两人打车回酒店。途中，两人下车找到莎朗送给兰的手帕。兰先是遇到了正在追赶银发劫匪的，然后又在废弃的仓库里遇到了逃跑中受伤的银发劫匪。当银发劫匪欲置他们于死地时，他所倚靠的栏杆突然断裂，从高处坠下，但被蓝和心怡所救。事后发现银发劫匪开枪自杀，但现场所有痕迹都被抹去，令人怀疑。
从后来的情节得知，当时的银发劫匪其实是沙龙为了让赤井秀一放松警惕进行暗杀而伪装的，所以现场的一切痕迹都被抹去了。当然，真正的银发劫匪早已被灭口，伪装成自杀。就是因为莎伦被兰和心怡救了，所以以后要处处保护他们，叫兰天使。在故事的结尾，提到赤井秀一和美国联邦调查局在一起，这暗示了他的身份。
莎伦伪造了自己的死亡，并继续作为她的女儿克里斯生活，在该组织中的代号为“苦艾酒”。
漫画VOL58F7，TV500红黑碰撞
中情局特工父女潜入黑组织，没想到在接头时被组织发现。父亲为了救女儿，咬断了他的手臂，让女儿颖海(代号基尔酒)朝他的头部开枪，利用事先准备好的带子欺骗琴酒，基尔得以继续组织卧底。
漫画VOL1F1，TV1过山车杀人事件。
青梅竹马的工藤新一和毛利兰在游乐场玩耍，目睹了伏特加酒(伏特加)交易，被组织的高级成员金恩袭击，被迫将APTX4869倒在柯南身上。
漫画Vol2f4-7、TV128改编自黑暗组织抢劫1亿元。
化名广田雅美的涉黑组织基层成员宫野明美，为了和姐姐一起离开组织，决定完成最后的任务，参与了涉黑组织6543.8+0亿元的抢劫，但得手后被杜松子灭口。
动画片Vol4f4-6和TV5改编了新干线爆炸事件。
小五郎去京都参加朋友的婚礼。柯南偷听了新干线列车里黑衣人的对话，得知黑人组织成员杜松子酒和伏特加酒都用酒的名字作为代号。
漫画VOL12F4-6-6，TV54电子游戏公司杀人事件。
在《充满天堂》的游戏发布会上，柯南遇到了黑暗组织成员龙舌兰酒，却意外遇害。后来查明，罪犯原来的杀人目标中岛和藿香交易了世界上最好的计算机程序资料，他们加入的酒吧被炸掉了。
漫画vol 18 F6-vol 19f 1，TV129来自黑暗组织的女人。
宫野明美的妹妹宫野志保(代号雪梨酒)服用APTX4869后逃离组织，化名海巴拉艾住在阿笠博士家。
漫画Vol 24F3-6，电视170-171黑暗中的死角。
小五郎带着兰和柯南去医生家拿体检结果，柯南认识了迪丹高中校医的儿子。在此期间，又发生了一起谋杀案，新易慧被杀。因为真正的凶手利用了一个不知情的女仆来完成案件，柯南最终决定向凶手和警方隐瞒真相，而新出智明也听说了这一情况。
漫画Vol 24F7-11，电视176-178告别黑暗组织。
柯南和艾找到了金的保时捷，在上面装了追踪器和窃听器，但是金发现了。他命令组织成员皮斯科去抓艾，艾在柯南的帮助下逃走了。皮斯科之所以能认出更小的艾，是因为他和艾的父亲宫野厚司是好朋友，在她小时候见过她，而且他也知道APTX4869的功能。最终，皮斯科还没来得及说什么伤心的话，就被杜松子酒封住了嘴，因为他的身份暴露了。
贝尔摩当时也在现场。他奉Boss之命来到日本，事后拍了照，在日本定居。因为艾觉得当时有其他组织的成员在场，所以事后柯南开始怀疑她也是该组织的成员。
漫画Vol 42f5-10与TV345直面黑组织。
贝尔摩试图通过制造车祸来杀死新出智明一家，并开始伪装成一个新的身份。另一方面，长大后的朱迪加入了美国联邦调查局，去日本追寻贝尔摩。在注意到贝尔摩的企图后，朱迪秘密地救了新出智明，并隐藏自己作为迪丹高中的英语老师来监视新生。朱迪通过比较她的指纹发现了莎伦·贝尔摩的秘密。
漫画VOL25F9-VOL26F7，电视191-192:危急生命复活。
柯南变回一个黑衣新骑士，遇到了兰，化身为新贝尔摩的发现。柯南由戴变声面具的艾伪装。
此时的贝尔摩知道新一没有死，但他应该没有猜到柯南=新一，也没有告诉组织里的任何人。
漫画书的陷阱第27卷f 7-9和电视226-227格斗游戏
朱迪遇到了柯南，看到他在花园的帮助下破案。这是朱迪第一次正式露面。显然，她发现柯南并不容易，她可能已经知道内情了。然而，事后她告诉同伴们“她掌握了一个目标”，“她不仅改变了外貌还义无反顾地去上学了”，并用代号“烂苹果”指代假装成新的贝尔莫尔。
漫画VOL 29F3-5，TV230-231是同程的粉丝。
少年侦探队和医生一行在公交车上遇到了要去美术馆的朱迪和辛楚。这时我感觉到车上有组织的成员变得非常害怕，然后大巴就被劫匪劫持了。最后在大家的努力下，劫匪被抓了，而艾却呆在快要爆炸的车里想死。最后被柯南救了。
艾觉得这个组织的成员都是贝尔摩的，朱迪单独和她在一起应该是为了监视她的行踪。幸运的是，在柯南的掩护下，朱迪和贝尔摩都没有找到艾。同时，这一集也是赤井秀一的首次正式亮相。最后，他的报告显示，他正在协助朱迪监视贝尔摩。
漫画卷32f8-10，电视258-259来自芝加哥的男人。
柯南等人遇到了来自芝加哥的老人“詹姆士·布莱克”。后来被误认为名人，被绑架了。最后，在柯南的帮助下，他被赤井救出并接走。
朱蒂和赤井的老板詹姆斯被赤井叫到日本帮忙。值得注意的是，赤井最后提到自己被女朋友甩了。
漫画VOL32F11-VOL33F2，电视253-254这个大厅里犯罪爱情的故事4
佐藤警官去和白鸟相亲了。最后，在柯南的帮助下，高木成功阻止了白鸟的计划，并与佐藤建立了情人关系。这一集唯一值得注意的是，柯南让信吾假扮高木来拖延时间，但是信吾(贝尔摩的)帮了他，这说明贝尔摩此时已经知道了柯南=新一的秘密。原因可能是作为Hiko的好朋友，她大概看到了Shingo小时候的照片，发现了其中的秘密。当然，她还是没有告诉任何人。
漫画vol 33f7-9和电视269-270是犯罪的纪念品。
与毛利小五郎有关的文件在大巴被劫持的当天被盗，然后被送回，暗示有人在调查他们，这让柯南相当紧张。是贝尔摩偷了案卷，主要目的是了解新案件。窃取所有相关案件档案的目的是误导美国联邦调查局，使其认为她的目标与毛利人有关。故事结尾有一张赤井监视毛利侦探社的照片，可见美国联邦调查局真的把目光投向了毛利人。
漫画VOL33F10-VOL34F1，TV271-272匆忙掩盖疏忽。
柯南又一次在朱迪面前破案，案件本身还是无关紧要的。这一集有几点值得注意:第一，朱迪暗示柯南的身份已经暴露，提到了美国联邦调查局；；第二，在该案中，兰回忆说他曾见过一个“戴黑色针织帽的人”(即)；最后，在故事的结尾，贝尔摩给金酒发了邮件，提到了雪利酒，还把飞镖射向了的交叉照片，还有柯南和兰的照片。
漫画vol 34 f 2-4，电视277-278西明侦探vs英语老师
案卷的丢失让柯南非常不安。他基本肯定了克里斯是该组织成员，并进一步怀疑朱迪就是克里斯。碰巧来到这里的服部哲对此很感兴趣，于是鼓动柯南去朱迪的公寓进行测试，双方接触过程中发生了一起凶杀案。虽然案子破了，但是对朱迪的考验却失败了。
这一集的重点是柯南和兰最后出现在朱迪浴室镜子后面的照片，照片上的字迹和贝尔摩的一模一样。根据后来的情节，是在朱迪潜入新房间(贝尔摩的)找到相关照片后复制的，而且朱迪也了解到贝尔摩的目标是服丧。
漫画卷35f8-10，电视289-290失落森林的严光
少年侦探队的成员去森林寻找弘彦。这一集提到了另一个涉黑组织成员邵元吉一郎。此人出现在惊涛骇浪连续杀人事件中，受过一些杀手训练，但在组织中只是一个无足轻重的角色。
漫画vol 37 f 5-7和电视307-308没有声音见证。
小五郎受托寻找失踪的电脑工程师板仓卓。从当事人的谈话中，柯南得知他是龙舌兰酒的联系对象，是在电子游戏公司遇害的组织成员。最后通过追查案情，柯南得到了组织的线索——板仓日记。
在案件的最后，柯南和兰遇到了。对话中，赤井提到了一个表面坚强，暗地里流泪的女孩，应该是指他的女朋友——宫野明美。就这样，柯南也得知了兰和赤井是在纽约认识的。
漫画VOL37F8-VOL38F1和电视309-311接触黑暗组织。
柯南通过半仓的日记得知了黑暗组织的行踪，并试图冒充半仓和伏特加的接头人，但被琴酒识破失败，柯南差点被抓。也有人认为当时Gin已经发现了柯南，但他不是故意的。最后柯南和艾离开的时候被赤井“碰巧”看到了。另外，板仓的日记中提到，黑暗组织的庞大计划甚至影响了人类的未来。
漫画vol 39f6-8，TV329金钱买不到的友谊。
剧情本身与主线无关，但在开头，阿笠博士提到了艾的父亲宫野厚司是著名的疯狂科学家，而他的母亲艾琳娜是英国留学生，黑暗集团可能在从事一项起死回生的计划。
漫画VOL41F4-6-6，电视335-336杜东发展学院的秘密
少年侦探队遇到一起命案，柯南帮忙解决。值得注意的是，柯南和艾在整个故事中都觉得自己被跟踪，但跟踪者最终被迫放弃。
最后，赤井秀一出现了，表明跟踪他们的人是美国联邦调查局。因为艾与朱迪拍摄的贝尔摩照片中的十字人物相似，美国联邦调查局人猜测她就是贝尔摩的目标。此外，赤井最后还对艾的照片说“太像了”，暗示他和艾以前就认识。
漫画VOL41F7-9-9，电视338-339 4保时捷。
艾得了重感冒，发烧，医生和柯南送他去医院，他却在停车场被打死了。后来，他遇到了正在购物的兰、加登和朱迪，发现了她们的行踪的跟在他后面。最后柯南破案了，医生却借了朱迪的车送艾回家，找了新医生给艾看病。
在故事的最后，贝尔摩烧掉了哀悼的照片，说:“你准备好了吗？我找到了，我去找你。”艾彻底暴露了。贝尔摩和美国联邦调查局都知道她的地址。贝尔摩还在医生家里安装了窃听器，一场恶战一触即发。
漫画Vol 41f 10-Vol 42f 1，TV340-341+0厕所隐藏的秘密。
医生带着柯南和艾去拜访艾父亲生前的好朋友，设计师出岛试图多了解艾的父亲。当然，设计院必然还会有另一桩命案。柯南破案的时候，还找到了艾的姐姐设法藏在设计院，艾的妈妈留给艾的那盘磁带。
在故事的结尾，贝尔摩打电话给组织成员“卡尔瓦多斯省”(Calvados)来帮助和策划一项行动。
漫画卷42f2-4，电视343-344便利店陷阱
朱迪辞去了迪丹高中的教师职务。显然，她会采取措施的。当兰和花园去朱迪家参加聚会时，兰意外地在镜子后面发现了那张照片。
漫画vol 42f5-10，TV345和黑组织面对面！月圆之夜的二元推理
贝尔摩策划了幽灵船派对，邀请了小五郎、新一(信中用了江户川柯南，表示身份已经暴露)和伏特加，试图分散柯南的注意力，暗杀艾；朱迪得知了这个计划，先带走了艾，并试图将贝尔摩引入陷阱。不过贝尔摩的棋艺比别人好，所以做了安排。柯南邀请服部哲，让尤喜子把他打扮成派对新人，自己则打扮成丧服，联系黑组织；但我不放心柯南去，就偷了柯南的追踪眼镜跟着他。因为兰想知道朱迪的真实身份，所以她藏在了朱迪汽车的后备箱里...其间，各种势力相互冲突，各种谜团相继被揭开，局势几经变化。服部哲成功侦破鬼船杀人案，掩护新一；另一方面，朱迪布置的陷阱被贝尔摩识破，朱迪也受了伤，柯南对化妆的哀悼又一次伤害了贝尔摩。因为莫宁的搅和，柯南被贝尔摩打晕，小兰跳出后备箱保护莫宁，差点被卡尔瓦多斯打伤，卡尔瓦多斯被赤井秀一打伤后自杀。贝尔莫尔也被赤井用猎枪打死。最后贝尔摩逃脱了阿凯的追求，又一次放走了柯南。
斯特拉迪瓦里小提琴在漫画第46卷F 2-6和电视385-387的不和谐。
柯南·詹伯斯虽然逃脱了，但他录下了贝尔莫尔给“那个人”(组织老大)发短信时拨打的手机按键的音调。后来才知道，这个音调是《七只乌鸦》这首歌的旋律。柯南想通过旋律找出“那个人”的号码，从而找出黑组织的老大，但又难过地说号码像潘多拉魔盒一样打不开。
漫画vol 48 f 9-vol 49 f 4，TV425暗震！当组织的爪子伸出的时候
一次偶然的机会，毛利人接受了冲野洋子的邀请，参加电视节目。后来，洋子小姐带来了著名节目主持人水无怜奈，水屋请毛利调查这起疑似恶作剧。解决事件后，柯南的带有追踪器和窃听器的口香糖误粘在了水底。柯南还听到了“七只乌鸦”的旋律，然后听到了水无怜奈和金之间的通话，得知水无怜奈是黑人组织基尔的成员，而这个黑人组织即将暗杀某人。与此同时，两个新的人物——基安蒂酒(坎蒂)和科恩(考恩)也从黑人组织中脱颖而出，两人都是狙击手。在柯南阻止了第一次暗杀后，基尔用一种特殊的方式对柯南进行了测谎，为后来水武的真实身份做了铺垫。基尔在准备第二次暗杀时，被美国联邦调查局追杀。他在一次车祸中昏迷不醒，被美国联邦调查局秘密保护，作为追查该组织的线索。这时，金发现了粘在基尔鞋底的口香糖，并推测这一切都是毛利小五郎的错。征得“那个人”的同意，金决定放弃原定刺杀毛利小五郎的计划。不过柯南及时赶到，摆脱了毛利人的怀疑。事先埋伏在附近一栋高楼里的赤井秀一，再次用狙击枪瞄准器瞄准了金。黑衣人组织计划彻底破产，让金的怀疑目标从毛利人转移到美国联邦调查局。最后贝尔摩因为太偏袒毛利人而被金怀疑，金也表示不完全相信毛利人是无辜的。
漫画Vol 49F8-10和电视429-430不能回。
因为车祸而被美国联邦调查局抓获的阿水并没有被送到医院进行秘密治疗，而是一直处于昏迷状态。在此期间，小兰的班级转向了一个名叫唐本·英优的男孩，他有一双像水无怜奈一样的眼睛。嬴由看起来是一个笨拙的人，但实际上，他还有另一个目的来接近毛利小五郎。柯南怀疑英宇是该组织的成员。
根据后来的故事，英佑去找毛利是因为水屋失踪前曾委托毛利调查此案。
漫画Vol 53F7-Vol 54F2，电视462-465黑暗组织的阴影。
在一次事件中，我们学校的颖友用了水屋在柯南身上用过的测谎仪，这让柯南非常怀疑。英宇说她是从她父亲那里学来的。还有一次，本堂说在一个个人主页的站长日记中，发现了一个类似于夏洛克·福尔摩斯小说《红发联盟》中的事件。日记里写着这是一份莫名其妙却报酬不菲的工作——收垃圾。柯南等人认为这部作品疑点重重，决定前去一探究竟。垃圾场附近又发生了一起枪击事件。受害人的儿子头四是水屋被美国联邦调查局追尾的交通事故的目击者。Tousi还认为，他的母亲是被一名黑衣妇女杀害的，这名妇女详细询问了交通事故的情况。最后虽然破案了，但是英佑在这个大厅的目的并不在这里，而是向头四了解车祸和黑衣女子的事情。另一方面，金在与同伙的谈话中提到了基尔的一次非凡表现，在那次事件中被基尔击中头部的间谍名叫唐本。
漫画VOL54F8 TV479和在服部平次的三天* * *
柯南来到大阪和服部平次等人一起玩，并请服部哲打听水无怜奈的情况。因为柯南在大阪发现了像水无怜奈这样的人的照片。
漫画vol 56f7-9和电视484-485中黑人照片的去向。
不久，平治打电话给柯南，告诉他找到了一些消息。大阪有人认识瀛友，因为瀛友小时候曾经和父亲一起去大阪的拉面屋吃拉面，但是经理已经去世了。于是柯南、阿笠博士和海原爱决定去住在东京、认识拉面店长的模特爱好者西君的家里看看，无意间看到了瀛友拍的照片。在照片中，我看到了英佑的父亲，我了解到英佑的父亲经常和穿着黑色西装的外国人打交道，在公司工作...
漫画VOL56F11-VOL57F4，TV491-494红黑碰撞。
兰和去医院看望初中同学，遇到了正在打听姐姐消息的应友。她发现英佑手里的照片和她年轻时的水舞很像。为了搞清楚这个人是不是水武，兰找到了水武的超级粉丝，看了水武早期的视频，得知水武的血型是AB。但是颖佑说她姐姐的血型是O型，所以柯南认为水屋和颖佑的姐姐不是同一个人。为了证明自己的血型，英佑带着毛利等人来到了母亲曾经服役的房子。看到《母婴保健手册》的柯南等人确定，颖友真的不是水武的弟弟。这时，柯南发现英佑的胸前有一个奇怪的伤疤。
漫画Vol 57F9-Vol 58F1TV 495-497红与黑的碰撞
兰说，颖友在医院打听妹妹的消息时，遇到了一个长得像她父亲同事的人。柯南怕组织的人来水屋所在的医院，就去水屋所在的医院把情况通知了美国联邦调查局。在柯南的帮助下，美国联邦调查局找到了楠田陆道，一个黑人组织的成员，但当他在逃跑中看到赤井时，他自杀了，因为他知道他被打败了。同时，Gin等人也知道，没有水的医院。
漫画第58卷f 2-7电视497-500红与黑的碰撞
柯南从朱迪老师等人那里了解到了赤井悲惨的过去。英佑潜入没有水的病榻了解真相，却被柯南和赤井阻止。原来水武的确是莹莹的妹妹。迎迎因为得了白血病，接受了别人造血干细胞的骨髓移植，改变了他的血型，而他并不知道。在得知她的姐姐和父亲都是中央情报局特工后，应友被美国联邦调查局带走。他父亲惨死的故事再次被提起。赤井和水没有达成协议，并决定让水作为基尔回到该组织，为中央情报局和美国联邦调查局提供线索。水并没有提出优先考虑CIA的工作，赤井表示同意。这个时候，别人还不知道这个计划。
该组织终于开始行动，在医院附近接连造成三起事故:火灾、煤气和食物中毒，使得需要就医的人数增加，大量病人涌向美国联邦调查局所在的医院，造成混乱，使得美国联邦调查局无法对住院的人进行逐一询问。与此同时，詹姆斯收到了一盆装有定时炸弹的鲜花。特工卡梅尔和朱迪决定把塑料炸弹拿到空地上引爆，然后离开医院。越来越多的鲜花和礼物被送到医院的病人手中。由于担心是炸弹，美国联邦调查局下令所有特工一起回收礼物。这时，病房的电视上播放了水无怜奈的康复和电视采访节目。惊讶之余，美国联邦调查局赶到水屋的病房一探究竟，却中了组织的计。事实上，礼物不是炸弹，而是定位仪器。很多定位仪器同时涌向一个房间，Gin等人完全掌握了水的位置。
赤井决定用事先安排好的方案把水送回黑组织。经过周密部署，决定由卡梅尔开车护送水屋。细想之下，Gin发现三辆车无处下手，其实是被赤井骗了！而卡梅尔则表演了一场赛车失败，掉下悬崖后丧命的场景，安全脱身。事后，赤井和柯南把一切都告诉了大家。
漫画vol 58 F8-vol 59 f 1tv 501-504红黑碰撞。
水没拿走之后，金和“那个人”都怀疑赤井会做出这么简单的策略。为了证明基尔的忠诚，我决定给她一个立即的任务——杀死赤井秀一。金和其他人通过无线电和针孔摄像头监视她的行动。阿凯接到水屋的电话，信心满满地赶到了接头地点。水舞真的举起枪朝阿凯的右肺开枪，并在琴酒的要求下爆了阿凯的头，最后炸掉了阿凯的车...朱迪看到新闻，绝望地去警察局对比柯南手机上附着的指纹和阿凯没有被炸掉的右手，但得到的是“指纹匹配”的认证，她很失望。柯南拿回手机时，发现手机的序列号和条形码都变了，但他没有问朱迪为什么，朱迪也没有告诉柯南赤井的事。
漫画vol 59 f 11-vol 60 F2 TV 507-508卡拉ok厅一角。
为了保护英宇，美国联邦调查局决定对英宇实施证人保护计划。像足原一样，英宇拒绝保护，但美国联邦调查局仍然不得不秘密保护英宇。有一天放学后，柯南、兰、元子和颖友决定去KTV唱歌。柯南发现有人在跟踪他们。柯南以为美国联邦调查局保护了颖佑，却没想到，在KTV里，跟着颖佑的人被杀了。经过柯南的分析推理，死者其实是一名诱拐者。事件解决后，嬴优和柯南独自走了。瀛友说要离开日本去美国加入中情局，他还试图告诉兰柯南的真实身份。原来他早就知道柯南是新一。最后，他提到了在美国联邦调查局发生的事情，但柯南认为这“没什么”。
漫画vol 60f3-F5电视509红白黄与侦探组
柯南和美国联邦调查局从水屋那里得知，组织的新成员波旁已经被派遣了。此时少年侦缉队受同学委托，调查其家中的一名陌生房客。第二天，少年侦探队来到医生家附近的公寓，但公寓发生了火灾。民警立即对三名嫌疑人进行调查，此时艾感觉到了他们有组织的同伴。事情解决后，其中一名嫌疑人，名叫冲矢昴的研究生，通过一个少年侦探小组认识了这位医生，并提出了共用一个房间的想法，但她不同意。这时，柯南提出让冲矢昴住在自己家里，并让他有意义地“看家”。
漫画卷61f8-f10
兰和去一所新房子打扫卫生，并结识了。崇亚和蓝口的《锦衣》(柯南说“不要和崇亚谈大川”)有一场关于纸飞机事件的推理大赛，不分上下。最后事情解决了，但是有一张冲矢昴喝波尔酒的照片。