001过山车杀人事件
对应漫画:
第65438卷+0
FILE.1现代福尔摩斯
整个故事的开头，被黑暗组织下药之前的原新一(后来的高木和步美、元太、广彦等人也在这一集出现)
小兰和心怡去游乐园约会。没想到，信义旁边就发生了一起命案，这也是整个故事的开头。在过山车的隧道里，为了省钱，吉田步美、圆谷光彦和太太小岛康誉正在上车。没想到，发生了命案。在新一的推理下，命案告破。但是，回来的路上，我看到一个新来的黑衣人在进行变相交易。没想到，另一名黑衣男子从背后袭击，给了欣怡一颗未吃完的药，APTX4869。新一改名为“江户川柯南”，故事就这样开始了...
049外交官谋杀案(下)
对应漫画:
第10卷
东方著名的侦探。
一个来自东方的著名侦探出现了。
6号文件全身发热。
一天，一个神秘的人来到毛利侦探事务所。这个人是关西有名的侦探:服部平次。当时，服部平次并没有意识到柯南就是新一。而且，服部平次带来的中国酒:白送，骗柯南喝了。事件结束时，工藤新一出现在大家面前。但是，眼前的这个新的似乎有点不寻常。辛屹相当专注于感冒，解决了整个事件。
最后，担心他的兰给医生打了电话。当时，新一完全失去了意识，从楼梯上摔了下来，躲在厕所里，变回了柯南。
服部哲此时已经有些察觉了...
162飞机气室！工藤新一的第一个病例。
对应漫画:
第265438卷+0
FILE.4初始问候
文件5空气室
文件的最后一张王牌
FILE.7深埋在心里。
阿笠博士中了旅行彩票，小五郎、小兰和侦探小组去了冲绳。在飞机上，小兰梦见了之前和新一在飞机上发生的杀人事件。当时小兰被问到关于x的新问题时脸红了，随后，新一顺利解决了事件。这是第一页...
危险复活系列
对应漫画:
第26卷
FILE.2不速之客
FILE.3被覆盖的事实。
FILE.4为复活而冒生命危险
FILE.5休息一下。
FILE.6一段安静的时光
190生死关头的第三次选择(危险复活)
柯南很担心要不要告诉小兰真相。当晚，阿沙拉出现在柯南的病房，将枪口对准柯南。啪~ ~打了一朵红花...把新一吓个半死。于是告白计划告吹，剧情继续。与此同时，小兰的学校正在筹备学院节，柯南也去看了小兰主演的剧。但是观众中有一个人突然倒下死了。我很鄙视那个死人，因为如果他没死，辛屹和小兰会接吻的。
191生死时刻的黑衣骑士(危险复活)
在小兰主演的剧的表演中，有一场谋杀。蒋木木警官认为被谋杀的普天的饮料是被他的同伴下毒的，但从现实情况来看，他准备断定这是自杀。这时，一个意想不到的人物出现了！
192生死(危险复活)回来了。
当我在从干燥的白茎中提取的物质制成的临时解药的帮助下回到原来的生活时，我邀请兰在坂町中心大楼的了望餐厅吃饭。吃饭的时候，听说餐厅的电梯里发生了命案。新婚夫妇兰说了声“马上回来”，就跑到了案发现场。
193生死约定的地方(危险复活)
新一理解了在米花町中心大楼电梯里杀死社长的犯人，但他的身体开始发生变化。另一方面，小兰在瞭望餐厅独自等待新一回来。结果案子破了，药效来了。他几乎哭了...柯南走到兰面前说:“心怡哥哥走了~”，兰哭了起来。“辛屹哥哥说的~……”“我不想听……”“他说，希望你等他，就算你死了，他也会回来，所以在这之前，希望小兰姐姐能等他，……”
219称为侦探工藤新一VS黑场。
打算接下铃木财阀黑珍珠黑星的黑叶海东想起了之前关于钟台的一件事。(有一个怪贼对着新一，但后者不是新一，而是以柯南的身份出现。)另一方面，小五郎的办公室收到了一封来自未知发信人的信，信里有一张支票。小五郎带着小兰和柯南去了“黄昏之阁”。“黄昏之屋”是百万富翁Umaru Lianye的别墅，和其他著名侦探一起被招待。然后开始了博物馆寻宝的游戏。但是侦探们一个接一个地消失了。谁是最后一个留下来的侦探？传唤侦探的犯人的真实身份是什么？
286工藤新一事件(事件)
287工藤新一纽约事件(推理)
288纽约工藤新一事件(解决方案)
对应漫画:
第34卷
FILE.11金苹果①
第35卷
FILE.1金苹果②
FILE.2金苹果③
FILE.3金苹果④
FILE.4金苹果⑤
柯南解决了横滨中华街事件，小兰却发高烧病倒了。恍惚中，小兰的脑海里浮现出戴黑帽子的男人、赤井、新一、美国女演员莎伦·温雅德的形象。小兰想起以前在纽约。她和新一遇到了莎伦·温雅德，遇到了偶遇的赤井。那是两个人去见住在美国的新父母的时候。新一的母亲广子开着一辆美洲虎疾驰在纽约的街道上。她买到了音乐剧《金苹果》的门票，该剧在百老汇好评如潮，她正准备去剧院观看。(这也是毛利兰开始对辛屹产生好感的开始，也为后来苦艾酒知道柯南就是辛屹做了铺垫。)
400疑小兰(回忆)
记忆部分是原创动画。
小兰越来越怀疑柯南就是新一。柯南放在那里的手机被小兰看到了，她想从手机的邮件中证实自己的怀疑。小兰发现手机被锁在了开机画面里。就在我试图解开密码的时候，外面传来了汽车喇叭声。小兰看到车号是46-49(yoroshiku)，想起了半年前和新的那个日期…
437上户彩和辛屹四年前的约定(回忆)
动画创意
柯南、兰和工藤打扫工藤图书馆的花园，注意到一张根据优秀作品改编成电视剧的《女高中生侦探由纪的笔记本》照片。图为16岁，本名心怡、兰。听兰说，这是四年前第一次演主角的蔡去游左时拍的照片。
后来，一个年轻女子来到工藤家。那个人就是上户彩。原来她有事要找新的...
472青年工藤新一历险记(上)(青年)
473少年工藤新一历险记(下)(少年)
对应漫画:
第55卷
文件。六月下
文件7石灰化
文件. 8白天
文件. 9日落
柯南等人正在迪丹小学的图书馆里学习。此时，小林老师在书架的缝隙里发现了什么东西。是一个旧皮钱包，中间有1张纸。柯南对这个钱包有一种似曾相识的感觉。10年前，小学一年级学生心怡和小兰为了查明学校闹鬼谣言的真相，在月圆之夜潜入小学图书馆。在那里，新一从神秘人那里拿到了皮夹，并接受了阅读记录在纸上的密码的挑战...
柯南继续讲图书馆里钱包的回忆。10年后的现在，柯南发现最后一步推理错了。真相是什么？
490服部平次vs工藤新一滑雪场的推理对抗(中学)
第50卷
FILE.8的内存
FILE.9雪女的策略
FILE.10揭开神秘面纱
FILE.11银衣雪女传说
第565438卷+0
FILE.1暴风雪中的复仇
521杀人犯工藤新一
对应漫画:
第62卷
FILE.5仇恨之村
FILE.6失去的记忆
档案7工藤新一杀人。
FILE.8罗申勋爵
柯南收到了一封来自一个叫武田诚二的人的信，让他在森林里的一个小木屋见他。没想到，出门前，他误服了药，本来应该是普通的感冒药，但阿笠博士却服用了海原爱自己制作的APTX4869解药。小屋中的柯南即将变回工藤新一。最后一刻，柯南掉进了湖里。令兰吃惊的是，新一失去了记忆！告诉叶带上工藤，也许能恢复工藤的记忆。在一年前的现场，新一、小兰、叶禾、平治等人认识了太田大人的同行:水川萌生，以及Todo新闻记者:川口李绅。
第二天，服部平次发现工藤新一不见了，然后他在一年前的犯罪现场找到了新一。人们发现新一深深地刺伤了河口...
新一和兰眼泪的真实身份
对应漫画:
第62卷
无法阻挡的泪水
FILE.10原型
FILE.11我真正想问的。
事实证明，真正的工藤新一不是杀人犯。假冒的工藤新一原来是一名整形外科医生。在森林里的一个小屋里，穿上了死去的罗神的衣服，见到了事发现场的所有人，并透露了事件的真相。在事件的最后，当工藤新一意识到他要变回江户川·柯南时，他给了工藤新一一剂APTX4869的解药，并保守了这个秘密。回来的路上，我遇到了另一起谋杀案...
我真正想问的是
对应漫画:
第63卷
FILE.1我的推理
FILE.2推理的答案
新一，他们经过的一辆车里有个陌生人。仔细一看，原来他已经死了！当新一和平福赶到凶案现场时，小兰的脑海里出现了他们去游乐园的回忆...小兰抓着新一的衣服好像要说什么，但什么也没说...谜底解开的时候，APTX4869的解药只有四个小时的药效。在变回柯南之前，工藤新一只想逃走，但小兰抓住了新一。幸好被阿修罗用麻醉针麻醉了，结果自然就安全变回来了...
616夏洛克·福尔摩斯的启示(侦探的门徒)
对应漫画:
第765438卷
文件。三个侦探的门徒。
文件4启示
因为要去伦敦，柯南的身份(化名)是个问题...于是我帮柯南换回了心怡，持续了24小时。到了伦敦，我以柯南的身份去看小兰。在伦敦，柯南遇到了一个小男孩，阿波罗。他告诉柯南，一个叔叔说会出事...
617福尔摩斯的启示(LOVEis 0)
对应漫画:
第765438卷
文件4启示
令人心碎的爱情
当小兰给新一打电话时，新一在伦敦泄露了这件事。在小兰的追逐下，柯南吃了阿沙拉送给他的APTX4869(原本是回国用的)。他们吵了几句，冉兰哭着走了，新一在后面追...
618夏洛克·福尔摩斯的启示(撒旦)
小兰和毛利小五郎通过犯人留下的暗号找到了一条关于福尔摩斯的线索，于是小兰打电话询问新情况。就在心怡准备和小兰一起破解暗号的时候，解药失效了...
621福尔摩斯的天启(0是开始)
对应漫画:
第765438卷
FILE.11女王的真实价值
第72卷
一个棘手而困难的事件
犯人被柯南找到了，犯人被华丽的制服了。工藤和妻子意外出现。在兰给草女王发的短信里，兰的一双新鞋…
一个新的剧场版小兰的告白出现在了机场兰的记忆里。
M4瞳孔中的刺客
小兰回忆起和心怡一起去游乐园。
M7迷宫的十字路口
柯南和服部哲推测了远山和叶被绑架的地点。但是服部哲受伤了。柯南找海原爱要APTX4869的解药，海原爱没带。于是海原爱说:先吃阿笠博士做的药(可以重感冒)，然后白喝。最后柯南成了新人。
M11毕比的棺材
柯南把氧气瓶给了兰，兰却无法呼吸。海底下，兰把氧气瓶给了柯南。
着陆后，柯南问兰为什么把氧气瓶给他。兰说柯南的动作和心怡很像。
记得初二的时候，有一天下雨，兰着急回家。她看见了，就给了她一把伞。我还告诉兰，我是个侦探，早就知道要下雨，所以多带了一把伞。最后，心怡冒雨回家，感冒了。
M12颤抖的乐谱
在经历了颤抖的乐谱、粉丝墙和乌拉拉事件后，兰回忆起当时的情景。当时是秋庭怜子先生在河边唱歌，唱的是《天赐恩典》(Amazing Grace，英文名是Amazing Grace)。
M12颤抖的乐谱:工藤新一粉丝墙与黑色拉布拉多犬事件
回到工藤新一的初中，这个案子是通过一个吉他盒发起的...
M13黑暗追踪者特别版心怡和兰麻将和七夕回忆
它讲述了新小学的故事。他和同学齐欣一起帮助兰实现了看望母亲的愿望。
M14天上的沉船
基德为了不被小兰发现，把自己伪装成了工藤新一...
OVA2 16嫌疑人
一个秋日，我和轻井泽、柯南、兰一起散步，回想起三年前他们打网球、骑自行车去河边看风景的情景...