其中柯南与黑组织的面对面在1，16，24，37，42，48，49，57，58，59，67卷。此外，去年还专门出了一本漫画《柯南VS黑衣人》，收集了柯南与黑组织对抗历史的漫画。
1，vol . 1 file . 1平成时代的福尔摩斯。
File.2成为著名的儿童侦探。
对应TV 1“过山车杀人事件”
2.第二卷档案4下落不明的人
可怜的女孩
跟踪高个子男人
File.7像恶魔一样的主谋
准确的说是没有对应的动画剧集。电视13《寻亲怪杀事件》聚焦寻亲与杀人，电视128《10亿元黑暗组织抢劫事件》聚焦明美之死与黑色组织的关系。
3.Vol.4 File.4黑色公文包之谜
电视五台“新干线大爆破事件”被修改为与黑组织无关。
4.Vol.12 File.4突遇
文件5炸弹的下落
File.6柯南算错了。
对应TV 54“游戏公司杀人事件”
5、Vol.18 File.6转学生。
文件7黑衣女孩
档案8秘密组织成员，代号雪莉
乔装打扮的女孩
File.10会死。
File.11为什么？
对应电视129《来自黑暗组织的女子大学教授谋杀案》
6.Vol.19 File.9被攻击的球！
file . 1056000人质
File.11远处的眼睛
对应电视130 ~ 131竞技场无差别胁迫事件。
7.Vol.24 File.7背叛的角落
File.8黑暗的送葬队伍
不告而别。
File.10过去的子弹
File.11白色世界
对应电视176 ~ 178告别黑暗组织。
8.第29卷文件3无形的恐怖
文件4危险信号
光天化日之下的伏击
对应电视230 ~ 231《神秘乘客》
9.第34卷File.11金苹果①
第35卷File.1金苹果②
File.2金苹果③
File.3金苹果④
File.4金苹果⑤
对应电视286~288“工藤新一NY事件”
10，第37卷文件. 5暗脚印①
File.6深色脚印②
File.7深色脚印③
File.8雪...阴影...
File.9危险遭遇
File.10搭便车
Vol.38 File.1新武器！
对应电视307~308无声见证和电视309 ~ 311接触黑暗组织。
11，Vol.41 File.10来访者留下的谜团。
File.11小密室的秘密
Vol.42 File.1隐藏的真相
对应电视340 ~ 341《藏在厕所里的秘密》
12，Vol.42 File.5月圆之夜与黑暗宴会的陷阱
File.6血迹斑斑的幽灵船
File.7隐形人！
File.8工藤新一出道！？
文件掩盖下的真相
File.10烂苹果
对应电视345《月圆之夜与黑组织面对面对抗的二元推理》
13，Vol.48 File.9恶作剧的门铃。
File.10新黑人成员
Vol.49 File.1跟踪目标！
File.2新指令！
File.3黑人组织vs美国联邦调查局①
File.4黑人组织vs美国联邦调查局②
对应电视425《黑色冲击！当组织的魔爪伸出的时候。
14，第53卷档案。7一个证人。
锉刀. 8钉子和蛇
锤子的真面目
File.10令人难以置信的兼职
Vol.54 File.1晚餐菜单
File.2梦幻之星
对应电视462~465系列《黑暗组织的影子》
15，Vol.57 File.9乌鸦之歌
File.10第二行
File.11假患者
Vol.58 File.1跟踪，然后...
File.2赤井的过去
把你所有的鸡蛋放在一个篮子里
文件4伪装
File.5最后一招
File.6任务
File.7姐弟
文件8意外的嫌疑人
3号又是星期五了。
File.10卡姆迈耶的过去
File.11魔咒
第58卷文件. 1钢楔
也就是电视495~504系列《红与黑的碰撞》
16，第60卷文件. 3红色、白色和黄色
File.4黑人和白人
File.5新邻居
对应TV 509《红白黄与侦探团》和TV 510《柯南vs双码之谜》
17，Vol.61 File.8纸飞机
File.9信息
File.10救援
对应TV 510《柯南vs双暗码之谜》和TV 511《推理对决！新沂vs冲矢昴”
18，第64卷文件
文件. 2鲭鱼鲤鱼鲭鱼鲶鱼
File.3杀气
对应电视542~543《让鱼消失的墙角石》
19，第67卷文件4危险区域
File.5红色和13的提示
文件6爆炸者的目的
暴风雪中的真相
File.8无声的战争
对应电视57《红色预兆召唤危机》、电视579《黑色的暗示与13》、电视580《逼近黑色的时刻》、电视581《红色摇摆目标》。