消化内科是内科科室，胃肠外科是外科科室，这两个科室在性质上有本质的区别。许多消化系统疾病需要要外科的方式来治疗，有的只需内科用药治疗即可，但近年来，消化内掌握了很多腔镜技术，俗称内科中的小外科，有了很大的突破。所以二者截然不同，但必不可分。