当时一些相声作品被指思想不正，无奈之下，侯宝林垂着头向众人撇清责任：“这些不是我写的，是徒弟马季写的。”从当时的环境和相声圈的名声地位来说，侯宝林的处境比马季危险得多，人在危难中想自我保护，也是无可厚非。而马季是如何对待恩师的呢？坊间传言，马季曾当众掌掴过侯宝林，但也只是传言而已，并无实证。
在二人生前，早有好事者询问过。奇怪的是，对这个问题，两人都未有过正面回答。侯宝林的反应是淡然一笑：“在旧社会，徒弟打师父是常有的事”，马季则说了段富有哲理的话：“没有这些误会，就没有生活，任何人都一样。”
相声界悬案“马季打侯宝林”要说马季和侯耀文的矛盾争端，大概就是从劫难开始。传闻马季曾经打过侯宝林一巴掌，这件事在相声界自然是讳莫如深，甚至谈之色变。
在节目《以德服人》中，郭德纲和马季就曾探讨过这个问题。郭德纲说：对这件事，专门问过师父和二大爷，但两人都予以否认。
马东解释说：自己的父亲马季懒得去解释这些，也就使得传闻逐渐肆虐，一直到去世，也没有解决这个问题；黄宏的父亲黄枫写过一个证明，如果需要的时候会拿出来证明清白。
是真是假早已说不清，但可以确定师徒二人多年后才和解，并且两人的说法都很含糊，才使得传闻一直传播。
马季侯耀文矛盾深厚浩劫时马季写了一段相声，叫《训候记》；浩劫之后，候宝林也写了一段相声，叫做《训马记》，不知道大家有没有听过这个故事。说明一下，这件事情并未证其真假，也全当作一个笑话来看。估计马季先生不会做这样的事情，后面的新段子也就没有可实施性了。
再有马季对马三立的态度问题，根本还是送的那一幅字：前无古人，后无来者。要知道，马季对自己的师父侯宝林都没有这么高的一种评价，反而把这种评价给了马三爷。
马家和侯家的关系也是不好言说，中间也有隔阂，一件事就可以证明——侯宝林去世之后，都没有告诉马三立。这是考虑马三立身体不好，不适合舟车劳顿？如此一来，必然招致侯耀文的不满，因此也使得矛盾进一步深化。
侯宝林马季的师徒恩怨其实侯宝林在世后期已经开始打压马季了，而马季碍于情面并未坑声，而这种打压一直持续，侯门父子的强势应该都懂。
而侯家要是没有侯耀文后来收郭德纲为徒，那真是可以算是相声圈的“罪人”了因此现在有好多人说，侯耀文的唯一贡献就是收了这个徒弟。要提到相声水平，马季侯耀文不是一个档次。
一位网友说的倒是透彻：“侯耀文是是志大才疏，相对于他的能力来说，他事业还不错，但是他觉着自己应该更成功，自觉不比马季差，但实际上他连马季的徒弟也比不过（姜崐，冯巩，赵炎等），所以他不是很开心。家庭经营得更不好，离婚几次婚，还有未婚同居的，总之是一地鸡毛。过得不开心，最后早早去了，和他的性格有很大关系，你看候二，没什么本事，但是人家很快乐，现在也是艺术家。”
结语我们都希望做师父的德艺双馨，诲人不倦；做徒弟的尊师重道，青出如蓝。但师徒也是凡人，有些许矛盾误会很正常。
不管怎样，侯宝林马季都已驾鹤西去，两位大师纵有些许恩怨，也已付诸尘土，而他们曾创作的那些经典相声段子，却为我们带来永恒的陪伴与无尽的欢乐。向他们致敬！